25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0515 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4143  hypothetical protein  85.89 
 
 		 574 aa  1039    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0483  hypothetical protein  85.02 
 
 		 574 aa  1031    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0478  hypothetical protein  85.19 
 
 		 574 aa  1031    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.486321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3512  hypothetical protein  85.49 
 
 		 576 aa  1029    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0440  hypothetical protein  86.01 
 
 		 576 aa  1033    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3555  hypothetical protein  83.33 
 
 		 570 aa  1006    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.688598  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3689  hypothetical protein  85.84 
 
 		 576 aa  1031    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3179  hypothetical protein  74.96 
 
 		 601 aa  935    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4059  hypothetical protein  87.54 
 
 		 570 aa  1048    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0515  hypothetical protein  100 
 
 		 570 aa  1176    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.363208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0459  hypothetical protein  85.19 
 
 		 574 aa  1031    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0760  hypothetical protein  30.4 
 
 		 592 aa  192  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.554801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2199  hypothetical protein  31.21 
 
 		 531 aa  187  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0776  hypothetical protein  29.15 
 
 		 587 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1033  hypothetical protein  29.19 
 
 		 488 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2218  hypothetical protein  29.68 
 
 		 575 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000179043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1036  hypothetical protein  28.86 
 
 		 488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.823153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3128  hypothetical protein  29.32 
 
 		 562 aa  170  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000493206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0974  hypothetical protein  28.47 
 
 		 488 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3090  hypothetical protein  30.97 
 
 		 538 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3633  hypothetical protein  27.97 
 
 		 589 aa  146  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.832641  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2269  hypothetical protein  29.87 
 
 		 515 aa  137  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1185  hypothetical protein  24.15 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1304  hypothetical protein  24.34 
 
 		 476 aa  76.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5229  hypothetical protein  24.14 
 
 		 550 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0780533  normal  0.270928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>