25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4143 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0483  hypothetical protein  94.6 
 
 		 574 aa  1135    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4143  hypothetical protein  100 
 
 		 574 aa  1183    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0478  hypothetical protein  94.77 
 
 		 574 aa  1136    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.486321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4059  hypothetical protein  83.28 
 
 		 570 aa  1009    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3512  hypothetical protein  96.5 
 
 		 576 aa  1146    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0440  hypothetical protein  96.85 
 
 		 576 aa  1150    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3555  hypothetical protein  84.15 
 
 		 570 aa  1010    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.688598  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3689  hypothetical protein  96.68 
 
 		 576 aa  1150    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3179  hypothetical protein  73.58 
 
 		 601 aa  920    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0459  hypothetical protein  94.77 
 
 		 574 aa  1135    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0515  hypothetical protein  85.89 
 
 		 570 aa  1039    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.363208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0760  hypothetical protein  30.51 
 
 		 592 aa  196  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.554801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2199  hypothetical protein  31.18 
 
 		 531 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0776  hypothetical protein  30.27 
 
 		 587 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1033  hypothetical protein  29.7 
 
 		 488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1036  hypothetical protein  29.53 
 
 		 488 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.823153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3128  hypothetical protein  30.59 
 
 		 562 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000493206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2218  hypothetical protein  29.7 
 
 		 575 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000179043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0974  hypothetical protein  29.49 
 
 		 488 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3090  hypothetical protein  29.07 
 
 		 538 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3633  hypothetical protein  29.98 
 
 		 589 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.832641  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2269  hypothetical protein  29.63 
 
 		 515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1185  hypothetical protein  25.24 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1304  hypothetical protein  26.09 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5229  hypothetical protein  25.09 
 
 		 550 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0780533  normal  0.270928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>