More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2289 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 536 aa  1100    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000503711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.43 
 
 		 584 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.93 
 
 		 620 aa  237  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.838333  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  44.89 
 
 		 596 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 604 aa  229  9e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 		 609 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1037  histidine kinase  41.2 
 
 		 608 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4039  histidine kinase  46.67 
 
 		 572 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  44.89 
 
 		 597 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2175  histidine kinase  44.89 
 
 		 599 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4130  histidine kinase  45.88 
 
 		 572 aa  226  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.964997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 		 584 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  33.12 
 
 		 917 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2755  periplasmic substrate-binding protein/sensor histidine kinase  45.42 
 
 		 590 aa  223  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1249  sensory box histidine kinase  35.28 
 
 		 524 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0948878  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2172  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 406 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2003  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 653 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.977312  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1761  histidine kinase  42.86 
 
 		 578 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1802  histidine kinase  44.24 
 
 		 540 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.963501  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1728  histidine kinase  44.24 
 
 		 560 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2923  histidine kinase  40.81 
 
 		 598 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  40.07 
 
 		 596 aa  209  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 		 986 aa  207  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 		 1509 aa  205  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2102  histidine kinase  40.28 
 
 		 575 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1854  histidine kinase  41.76 
 
 		 578 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1870  histidine kinase  41.37 
 
 		 779 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  41.57 
 
 		 578 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  40.78 
 
 		 774 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1894  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 1085 aa  188  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2643  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 552 aa  187  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1907  histidine kinase  41.5 
 
 		 560 aa  186  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.649995 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 771 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1832  histidine kinase  35.85 
 
 		 550 aa  166  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156636 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3096  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 659 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2460  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 797 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  36.25 
 
 		 505 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.22 
 
 		 1309 aa  161  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  38.13 
 
 		 524 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1149  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 833 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355741  normal  0.205094 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  31.23 
 
 		 1322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 619 aa  153  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 		 990 aa  153  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 557 aa  152  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.25 
 
 		 1019 aa  150  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 553 aa  150  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 715 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1960  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 525 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  33.33 
 
 		 1187 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 683 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4132  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 619 aa  147  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3113  histidine kinase  33.83 
 
 		 654 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000907022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0754  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.77 
 
 		 492 aa  146  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.499334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 1021 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 		 1132 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3878  histidine kinase  34.32 
 
 		 692 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.245936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 680 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 470 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1145  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2797  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 480 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 675 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 971 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 		 929 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.31 
 
 		 871 aa  141  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 1072 aa  141  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1834  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 681 aa  141  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0658  sensor histide kinase  36.36 
 
 		 315 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  35.1 
 
 		 445 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3516  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 614 aa  140  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.166046 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 611 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 611 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 467 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.05 
 
 		 652 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.8 
 
 		 1808 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0721  histidine kinase  34.44 
 
 		 675 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3689  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 655 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 627 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 495 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 627 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 627 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  37.5 
 
 		 681 aa  139  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  34.88 
 
 		 627 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 627 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 678 aa  139  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 627 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 627 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.51 
 
 		 810 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3777  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 701 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215477  hitchhiker  0.0067097 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01455  sensor histidine kinase  32.72 
 
 		 436 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  35.82 
 
 		 611 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 594 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  35.45 
 
 		 305 aa  137  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 602 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 679 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1953  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 458 aa  137  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1911  histidine kinase  34.95 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>