More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1882 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  100 
 
 
430 aa  873    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  67.6 
 
 
480 aa  595  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  43.53 
 
 
446 aa  354  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  44.34 
 
 
466 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  44 
 
 
439 aa  345  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  42.76 
 
 
453 aa  342  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  44.08 
 
 
474 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  44.79 
 
 
433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  43.84 
 
 
474 aa  338  7e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.76 
 
 
458 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  44.04 
 
 
448 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.21 
 
 
458 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  42.99 
 
 
455 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.66 
 
 
458 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  43.69 
 
 
458 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  41.92 
 
 
453 aa  332  6e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.08 
 
 
460 aa  330  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  43.22 
 
 
452 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.08 
 
 
460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  44.64 
 
 
461 aa  324  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  40.78 
 
 
481 aa  323  3e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.2 
 
 
443 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  39.22 
 
 
463 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  43.46 
 
 
451 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.62 
 
 
460 aa  318  9e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  39.4 
 
 
486 aa  318  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  40.09 
 
 
460 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  42.35 
 
 
471 aa  317  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  39.4 
 
 
463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.31 
 
 
460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  38.39 
 
 
460 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.03 
 
 
460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.03 
 
 
460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.03 
 
 
460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.03 
 
 
460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  41.92 
 
 
378 aa  312  5.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.71 
 
 
460 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.71 
 
 
460 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.09 
 
 
442 aa  312  9e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.94 
 
 
460 aa  311  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.48 
 
 
460 aa  311  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  41.69 
 
 
378 aa  310  4e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  38.48 
 
 
484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  38.25 
 
 
460 aa  306  3e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  41.3 
 
 
440 aa  305  8.000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  41.59 
 
 
453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.19 
 
 
447 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  38.13 
 
 
430 aa  302  8.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.28 
 
 
473 aa  300  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.49 
 
 
468 aa  295  8e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2243  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.3 
 
 
444 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.61 
 
 
468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  38.1 
 
 
455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  41.58 
 
 
475 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.78 
 
 
674 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  38.7 
 
 
488 aa  281  1e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  38.56 
 
 
471 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  38.65 
 
 
487 aa  280  3e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.05 
 
 
471 aa  279  7e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  35.39 
 
 
469 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  35.39 
 
 
471 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.32 
 
 
472 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.83 
 
 
410 aa  265  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.28 
 
 
474 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.93 
 
 
472 aa  261  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  37.59 
 
 
395 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.35 
 
 
399 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  37.59 
 
 
395 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.3 
 
 
421 aa  249  5e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.11 
 
 
396 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.11 
 
 
396 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.83 
 
 
427 aa  249  7e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  37.11 
 
 
396 aa  249  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.3 
 
 
439 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.11 
 
 
396 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.66 
 
 
389 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.87 
 
 
396 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.66 
 
 
389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  35.41 
 
 
395 aa  245  9e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0585  membrane spanning export protein  35.68 
 
 
391 aa  244  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.836061  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.13 
 
 
394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.13 
 
 
394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.13 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.88 
 
 
394 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.35 
 
 
416 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1191  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.22 
 
 
424 aa  223  4e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.795272  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.98 
 
 
399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.36 
 
 
428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.18 
 
 
468 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  35.51 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4206  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.16 
 
 
437 aa  210  5e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05073  putative hemolysin-type secretion transmembrane protein  34.91 
 
 
358 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.62 
 
 
390 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.01612  normal  0.250186 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2502  secretion protein  35.68 
 
 
439 aa  197  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.867679 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  31.43 
 
 
390 aa  196  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.46 
 
 
518 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0970  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.73 
 
 
505 aa  191  2e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.995954  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.65 
 
 
389 aa  190  5e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.21 
 
 
480 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.34 
 
 
438 aa  186  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>