More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0061 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  66.07 
 
 		 224 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  66.36 
 
 		 220 aa  287  8e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  60.43 
 
 		 230 aa  275  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  60.18 
 
 		 220 aa  270  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1620  riboflavin synthase subunit alpha  60.27 
 
 		 224 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  51.13 
 
 		 220 aa  204  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  49.32 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 213 aa  187  9e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  47.25 
 
 		 215 aa  185  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  50.77 
 
 		 196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  44.29 
 
 		 219 aa  181  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  42.01 
 
 		 217 aa  181  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  39.91 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  39.91 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  49 
 
 		 200 aa  175  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 217 aa  174  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 216 aa  174  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  42.66 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  42.73 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  43.38 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  44.29 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  43.24 
 
 		 219 aa  172  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  41.28 
 
 		 214 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  40.99 
 
 		 217 aa  171  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  44.09 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  43.75 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  41.82 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  42.2 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  39.82 
 
 		 217 aa  167  8e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  39.91 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  41.45 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  42.99 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  40.37 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  45.88 
 
 		 200 aa  165  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  39.45 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  39.27 
 
 		 215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  38.07 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  41.89 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  45.88 
 
 		 200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  38.99 
 
 		 214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  48.21 
 
 		 196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  42.2 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  42.08 
 
 		 218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  42.08 
 
 		 218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  39.45 
 
 		 207 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  45.36 
 
 		 200 aa  161  7e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  46.46 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  39.91 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  44.27 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  46.57 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  44.67 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  43.15 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  43.59 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  42.79 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  43 
 
 		 204 aa  159  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  40.83 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  40.64 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  37.44 
 
 		 218 aa  157  9e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  40.36 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  38.01 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  35.78 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  40.83 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  39.27 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 220 aa  155  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  39.82 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  43.81 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  37.23 
 
 		 232 aa  155  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  39.27 
 
 		 221 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  42.86 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  39.27 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  39.27 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  45.13 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  42.71 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  39.19 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  39.27 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  42.13 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  39.27 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  43.43 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  40.37 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  39.27 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  41.36 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>