More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5298 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5298  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  635    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4798  hypothetical protein  36.84 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.177253  normal  0.0723657 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  36.77 
 
 		 315 aa  176  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  37.01 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  36.9 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  39.22 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2535  hypothetical protein  38.33 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.188346  normal  0.11919 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  34.48 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  36.74 
 
 		 356 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  34.48 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4408  extra-cytoplasmic solute receptor  37.36 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0323746  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  36.15 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  36.07 
 
 		 322 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  37.07 
 
 		 327 aa  165  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  35.2 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.3 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  35.25 
 
 		 328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  35.84 
 
 		 325 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  35.92 
 
 		 322 aa  162  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  35.29 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4638  hypothetical protein  35.71 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  35.69 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.68 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  36.86 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  35.86 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  38.03 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  37.98 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  36.53 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  34.53 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  34.7 
 
 		 330 aa  159  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  32.45 
 
 		 330 aa  159  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5359  extra-cytoplasmic solute receptor  36.31 
 
 		 323 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00868603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  34.7 
 
 		 330 aa  159  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  35.38 
 
 		 339 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  33.98 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  36.88 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  34.14 
 
 		 331 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  33 
 
 		 327 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  30.99 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  36.64 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  34.14 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2282  hypothetical protein  35.03 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.736343  hitchhiker  0.00501521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2286  hypothetical protein  37.35 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.53441  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  40.16 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  34.44 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  33.44 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  35.09 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  38.2 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  36.57 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  34.6 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  34.44 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  34.97 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6257  hypothetical protein  37.55 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460323  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  31.44 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4856  hypothetical protein  36.5 
 
 		 325 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.876948  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  32.69 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  36.52 
 
 		 328 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  33.69 
 
 		 320 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  35.34 
 
 		 325 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6179  hypothetical protein  36.27 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  35.54 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0715  hypothetical protein  35.77 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  30.28 
 
 		 325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  36.14 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4969  extra-cytoplasmic solute receptor  32.89 
 
 		 364 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332662  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3496  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.192421 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  32.9 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  34.19 
 
 		 332 aa  152  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3986  hypothetical protein  36.4 
 
 		 325 aa  152  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2124  hypothetical protein  33.22 
 
 		 348 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304167  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1908  hypothetical protein  34.9 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.865584  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  35.02 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  36.2 
 
 		 316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  38.36 
 
 		 328 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  34.4 
 
 		 333 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6345  hypothetical protein  36.19 
 
 		 330 aa  152  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  33.23 
 
 		 334 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  36.2 
 
 		 316 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  34.46 
 
 		 327 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  34.7 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1820  hypothetical protein  34.9 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  34.59 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  29.9 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0230  hypothetical protein  34.93 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.297897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  36.49 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  35.77 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0712  hypothetical protein  34.36 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.780507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  34.81 
 
 		 330 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  37.46 
 
 		 326 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  30.19 
 
 		 325 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  34.71 
 
 		 326 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  34.46 
 
 		 327 aa  149  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5248  extra-cytoplasmic solute receptor  37.33 
 
 		 333 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0821441  normal  0.224057 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4543  hypothetical protein  32.41 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00792277  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  34.98 
 
 		 321 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  34.24 
 
 		 324 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  38.7 
 
 		 328 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  31.21 
 
 		 328 aa  149  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  35.17 
 
 		 331 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5161  extra-cytoplasmic solute receptor  36.88 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0547548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>