More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2079 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4457  ABC transporter related  56.56 
 
 		 613 aa  642    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.754482  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2079  ABC transporter related  100 
 
 		 623 aa  1251    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304897 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  29.85 
 
 		 720 aa  239  6.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  31.08 
 
 		 740 aa  238  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  29.48 
 
 		 720 aa  237  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  30.31 
 
 		 720 aa  233  9e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.68 
 
 		 1000 aa  231  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  28.97 
 
 		 743 aa  231  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.1 
 
 		 1003 aa  231  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.47 
 
 		 976 aa  230  7e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  29.39 
 
 		 753 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  28.24 
 
 		 980 aa  227  4e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  27.68 
 
 		 971 aa  227  4e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  28.39 
 
 		 725 aa  227  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  29.52 
 
 		 721 aa  227  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  28.57 
 
 		 700 aa  226  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  28.97 
 
 		 739 aa  225  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  29.71 
 
 		 741 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.71 
 
 		 1008 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.71 
 
 		 1008 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  28.46 
 
 		 892 aa  223  9e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  28.84 
 
 		 737 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  29.39 
 
 		 920 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  28.49 
 
 		 728 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  27.42 
 
 		 930 aa  220  7e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  29.37 
 
 		 734 aa  220  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  28.03 
 
 		 705 aa  220  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  30.2 
 
 		 776 aa  219  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  29.51 
 
 		 986 aa  218  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  27.36 
 
 		 712 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  27.77 
 
 		 750 aa  218  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.04 
 
 		 720 aa  218  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  27.31 
 
 		 699 aa  217  4e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  29.01 
 
 		 723 aa  217  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  28.08 
 
 		 726 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  28.06 
 
 		 712 aa  217  5.9999999999999996e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3586  type I secretion system ATPase  30.17 
 
 		 598 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  28.14 
 
 		 975 aa  216  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  29.04 
 
 		 725 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.95 
 
 		 1001 aa  216  8e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  29.73 
 
 		 721 aa  216  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  29.04 
 
 		 725 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  29.04 
 
 		 725 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  29.04 
 
 		 725 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  28.81 
 
 		 731 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  28.12 
 
 		 706 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.41 
 
 		 1024 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.25 
 
 		 999 aa  215  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  27.87 
 
 		 725 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  27.2 
 
 		 731 aa  215  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2547  ABC transporter related  30 
 
 		 740 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  28.44 
 
 		 730 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  28.08 
 
 		 704 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  27.93 
 
 		 728 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  27.61 
 
 		 712 aa  214  4.9999999999999996e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.85 
 
 		 865 aa  213  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  27.95 
 
 		 725 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  27.61 
 
 		 712 aa  213  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  28.83 
 
 		 726 aa  212  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  28.49 
 
 		 725 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  27.61 
 
 		 712 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  28.54 
 
 		 704 aa  211  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  28.49 
 
 		 725 aa  211  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  28.47 
 
 		 724 aa  211  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  28.47 
 
 		 724 aa  211  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  29.55 
 
 		 725 aa  210  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  27.86 
 
 		 717 aa  210  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0039  Type I secretion system ATPase, PrtD  28.39 
 
 		 585 aa  210  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  29.96 
 
 		 714 aa  210  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  28.62 
 
 		 726 aa  209  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  29.21 
 
 		 726 aa  208  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  30.06 
 
 		 721 aa  207  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2196  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  30.46 
 
 		 763 aa  208  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.338051  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  28.81 
 
 		 718 aa  208  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2060  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.46 
 
 		 763 aa  208  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  27.05 
 
 		 712 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2722  ABC transporter related  29.36 
 
 		 730 aa  207  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  28.03 
 
 		 762 aa  207  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  28.6 
 
 		 725 aa  207  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4007  type I secretion system ATPase  29.97 
 
 		 573 aa  206  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  30.98 
 
 		 723 aa  206  9e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  29.76 
 
 		 714 aa  206  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.22 
 
 		 1018 aa  206  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  30.84 
 
 		 731 aa  206  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.28 
 
 		 1016 aa  206  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  27.42 
 
 		 1040 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  27.94 
 
 		 726 aa  204  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5958  type I secretion system ATPase  32.3 
 
 		 569 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  26.68 
 
 		 718 aa  204  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.67 
 
 		 1013 aa  204  4e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  29.14 
 
 		 1018 aa  204  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  29.34 
 
 		 570 aa  204  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  29.84 
 
 		 871 aa  204  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.44 
 
 		 1019 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.72 
 
 		 1018 aa  204  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  25.88 
 
 		 968 aa  203  7e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0631  Type I secretion system ATPase, PrtD  28.04 
 
 		 592 aa  202  9.999999999999999e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  27.5 
 
 		 734 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  26.69 
 
 		 739 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0132  type I secretion ATP-binding protein  29.26 
 
 		 602 aa  201  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>