More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0983 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0983  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 593 aa  1193    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0874  translation initiation factor IF-2  94.94 
 
 		 593 aa  1150    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0133057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  54.39 
 
 		 692 aa  636    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_855  translation initiation factor 2 (IF-2)  96.63 
 
 		 593 aa  1160    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00962289  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  52.86 
 
 		 985 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  54.17 
 
 		 903 aa  625  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  54.55 
 
 		 656 aa  626  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  53.82 
 
 		 845 aa  615  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  52.29 
 
 		 884 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  54.18 
 
 		 971 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0476  translation initiation factor IF-2  53.29 
 
 		 602 aa  613  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  52.37 
 
 		 883 aa  608  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  52.65 
 
 		 738 aa  608  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  52.3 
 
 		 888 aa  608  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  52.6 
 
 		 1029 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  51.74 
 
 		 732 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3751  translation initiation factor IF-2  52.99 
 
 		 729 aa  607  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00372327  unclonable  0.0000243777 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  51.82 
 
 		 739 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  51.61 
 
 		 686 aa  604  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  51.67 
 
 		 882 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  51.95 
 
 		 986 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  50.78 
 
 		 679 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  50.78 
 
 		 679 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  52.2 
 
 		 980 aa  598  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  51.53 
 
 		 822 aa  601  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  51.75 
 
 		 921 aa  598  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  50.84 
 
 		 689 aa  595  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 		 686 aa  593  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  51.38 
 
 		 686 aa  594  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  51.21 
 
 		 686 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  51.21 
 
 		 686 aa  592  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  51.21 
 
 		 686 aa  592  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  51.38 
 
 		 686 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  51.21 
 
 		 686 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  51.7 
 
 		 1161 aa  589  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 688 aa  591  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 688 aa  587  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  50.7 
 
 		 882 aa  585  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  51.13 
 
 		 720 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  51.01 
 
 		 860 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  51.44 
 
 		 962 aa  581  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  51.67 
 
 		 898 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  50.26 
 
 		 705 aa  578  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  50.26 
 
 		 705 aa  578  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  51.14 
 
 		 658 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 949 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3681  translation initiation factor IF-2  51.44 
 
 		 753 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00576781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  49.25 
 
 		 673 aa  574  1.0000000000000001e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  49.05 
 
 		 945 aa  568  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  51.15 
 
 		 922 aa  570  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  52.08 
 
 		 964 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  49.14 
 
 		 947 aa  570  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  52.08 
 
 		 964 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 924 aa  570  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  49.66 
 
 		 1059 aa  571  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  50.59 
 
 		 968 aa  569  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0993  translation initiation factor IF-2  48.71 
 
 		 668 aa  565  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000676499  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  48.69 
 
 		 689 aa  567  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  50.7 
 
 		 894 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  51.1 
 
 		 975 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  49.91 
 
 		 711 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  51.1 
 
 		 975 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 895 aa  561  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  50.26 
 
 		 1035 aa  565  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  51.1 
 
 		 975 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  49.49 
 
 		 1005 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  51.1 
 
 		 975 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  46.97 
 
 		 949 aa  563  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  52.02 
 
 		 1131 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  49.48 
 
 		 943 aa  560  1e-158  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  50.93 
 
 		 975 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  48.96 
 
 		 915 aa  558  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 876 aa  559  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  50.93 
 
 		 975 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  50.71 
 
 		 907 aa  561  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  48.29 
 
 		 843 aa  561  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  50.93 
 
 		 975 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  50.35 
 
 		 896 aa  561  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  51.38 
 
 		 964 aa  556  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 		 969 aa  555  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  51.05 
 
 		 902 aa  555  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  48.39 
 
 		 853 aa  555  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  48.53 
 
 		 911 aa  557  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  50.59 
 
 		 976 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  48.67 
 
 		 1011 aa  556  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0725  translation initiation factor IF-2  49.14 
 
 		 912 aa  558  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0457048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2357  translation initiation factor IF-2  49.74 
 
 		 1101 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  50.35 
 
 		 896 aa  552  1e-156  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  48.83 
 
 		 992 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  51.1 
 
 		 992 aa  553  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  48.35 
 
 		 936 aa  554  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  49.91 
 
 		 891 aa  555  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  50.43 
 
 		 989 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  50.68 
 
 		 972 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  50.85 
 
 		 971 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  50.43 
 
 		 971 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 882 aa  553  1e-156  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  50.85 
 
 		 971 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04131  translation initiation factor IF-2  50.52 
 
 		 1124 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  49.23 
 
 		 882 aa  553  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>