More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4099 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4099  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 
379 aa  763    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0894  putative inner membrane protein translocase component YidC  84.74 
 
 
381 aa  666    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4060  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 
379 aa  763    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3435  putative inner membrane protein translocase component YidC  65.96 
 
 
380 aa  534  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98769  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4710  putative inner membrane protein translocase component YidC  69.11 
 
 
382 aa  533  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.620699  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0687  YidC/Oxa1 family lipolytic protein  63.35 
 
 
383 aa  516  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.852164  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1617  putative inner membrane protein translocase component YidC  60.66 
 
 
392 aa  500  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.281889 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5265  putative inner membrane protein translocase component YidC  60.46 
 
 
396 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.0483383 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1787  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.54 
 
 
380 aa  425  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.169669  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06091  putative inner membrane protein translocase component YidC  55.82 
 
 
377 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0577  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.85 
 
 
376 aa  421  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13791  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.28 
 
 
380 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.429072  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13871  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.54 
 
 
380 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0838115  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0805  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.05 
 
 
382 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.792706  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1287  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.28 
 
 
380 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.495694  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12731  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.91 
 
 
383 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00483232 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13581  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.16 
 
 
379 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.13065  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16601  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.05 
 
 
382 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0685745  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  44.35 
 
 
584 aa  102  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  43.55 
 
 
583 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  42.65 
 
 
225 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  43.55 
 
 
583 aa  100  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  39.52 
 
 
584 aa  100  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  45.16 
 
 
587 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  43.59 
 
 
268 aa  97.4  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  41.94 
 
 
585 aa  97.1  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2740  protein translocase subunit yidC  44.35 
 
 
579 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  47.27 
 
 
217 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.24 
 
 
544 aa  95.1  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.76 
 
 
533 aa  94.7  3e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.32 
 
 
526 aa  93.2  7e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28520  preprotein translocase subunit YidC  43.52 
 
 
257 aa  92.4  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000336467  hitchhiker  0.00141204 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.98 
 
 
543 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  45.61 
 
 
261 aa  92.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.06 
 
 
541 aa  92  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.98 
 
 
544 aa  92  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  42.59 
 
 
257 aa  91.7  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.52 
 
 
517 aa  92  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.46 
 
 
530 aa  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  50 
 
 
341 aa  91.3  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  40.35 
 
 
628 aa  90.9  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.06 
 
 
595 aa  90.5  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.06 
 
 
632 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.48 
 
 
584 aa  90.9  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.21 
 
 
543 aa  90.1  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0131  60 kDa inner membrane insertion protein  47.96 
 
 
459 aa  90.1  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.74 
 
 
600 aa  90.1  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.94 
 
 
607 aa  89.7  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.66 
 
 
531 aa  89.4  9e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.52 
 
 
518 aa  89.4  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.61 
 
 
530 aa  89  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  38.28 
 
 
614 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.21 
 
 
545 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  41.28 
 
 
607 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  40.62 
 
 
609 aa  89  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.61 
 
 
528 aa  89  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.94 
 
 
610 aa  88.2  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.94 
 
 
610 aa  88.2  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.8 
 
 
555 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  43.22 
 
 
229 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  37.96 
 
 
532 aa  88.2  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2035  60 kDa inner membrane insertion protein  43.27 
 
 
336 aa  88.2  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.01 
 
 
554 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.84 
 
 
577 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.01 
 
 
554 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  37.5 
 
 
616 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.43 
 
 
543 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  35.94 
 
 
548 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.06 
 
 
629 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.28 
 
 
621 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  35.04 
 
 
543 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  37.5 
 
 
616 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.01 
 
 
555 aa  87.4  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  37.5 
 
 
553 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  36.72 
 
 
605 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  38.28 
 
 
604 aa  86.7  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.28 
 
 
540 aa  86.7  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.86 
 
 
532 aa  86.7  7e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  38.28 
 
 
556 aa  86.3  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.22 
 
 
553 aa  86.3  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.43 
 
 
548 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.43 
 
 
548 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  38.28 
 
 
566 aa  86.3  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.43 
 
 
548 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  36.72 
 
 
559 aa  86.3  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.43 
 
 
548 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  44.44 
 
 
246 aa  86.3  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.43 
 
 
548 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  38.28 
 
 
540 aa  86.3  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.43 
 
 
548 aa  86.3  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.16 
 
 
597 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.94 
 
 
546 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.94 
 
 
546 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.94 
 
 
546 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0522  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.45 
 
 
787 aa  85.1  0.000000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0640  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.72 
 
 
630 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.138762  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  39.05 
 
 
539 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.94 
 
 
575 aa  85.1  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  37.5 
 
 
617 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.16 
 
 
609 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>