More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0622 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  100 
 
 
377 aa  767    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  33.89 
 
 
477 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  34.15 
 
 
487 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  34.35 
 
 
578 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  34.66 
 
 
462 aa  179  9e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.63 
 
 
392 aa  166  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  31.82 
 
 
470 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  30.32 
 
 
417 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.08 
 
 
442 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  34.67 
 
 
445 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  33.64 
 
 
356 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  30.92 
 
 
446 aa  152  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  32.79 
 
 
543 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  32.79 
 
 
543 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  34.6 
 
 
338 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  31.59 
 
 
510 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  32.36 
 
 
537 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  29.03 
 
 
434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  30.52 
 
 
559 aa  139  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  30.72 
 
 
446 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  27.86 
 
 
367 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  29.33 
 
 
364 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  32.69 
 
 
404 aa  137  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  30.85 
 
 
514 aa  136  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  31.83 
 
 
611 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  31.56 
 
 
415 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  30.06 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  30.27 
 
 
416 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.23 
 
 
378 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  30.97 
 
 
330 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  31.56 
 
 
416 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  32.03 
 
 
543 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  30.38 
 
 
413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.88 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  28.57 
 
 
362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  32.24 
 
 
593 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  27.54 
 
 
453 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  30.74 
 
 
421 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  30 
 
 
422 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  30.74 
 
 
421 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  30.74 
 
 
412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  30.74 
 
 
412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.95 
 
 
447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  26.48 
 
 
483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  31.67 
 
 
349 aa  126  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  32.57 
 
 
603 aa  126  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  29.21 
 
 
450 aa  126  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  30 
 
 
413 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  31.16 
 
 
402 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  27.11 
 
 
342 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  26.86 
 
 
422 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  29.8 
 
 
401 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  28.03 
 
 
375 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  30.45 
 
 
496 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  27.13 
 
 
442 aa  123  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  31.09 
 
 
505 aa  123  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  30.65 
 
 
447 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.65 
 
 
447 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.01 
 
 
413 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  29.77 
 
 
419 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  32.12 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  28.85 
 
 
501 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  26.32 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  30.79 
 
 
848 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  28.94 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.84 
 
 
445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  30.84 
 
 
395 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  33.97 
 
 
498 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  33.97 
 
 
498 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  29.17 
 
 
370 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  25.83 
 
 
377 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  25.83 
 
 
377 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  25.83 
 
 
377 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  27.75 
 
 
720 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  31.62 
 
 
381 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.09 
 
 
388 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  25.83 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  27.11 
 
 
375 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  25.15 
 
 
377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  27.24 
 
 
375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  28.84 
 
 
482 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  25.15 
 
 
375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  26.97 
 
 
378 aa  117  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  28.57 
 
 
388 aa  117  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  28.34 
 
 
740 aa  116  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  28.84 
 
 
482 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  25.48 
 
 
369 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  27.42 
 
 
378 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  28.57 
 
 
388 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  26.53 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.23 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  27.27 
 
 
1032 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  27.99 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2537  beta-lactamase  26.39 
 
 
393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  27.1 
 
 
378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  32.47 
 
 
447 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  32.38 
 
 
633 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  27.98 
 
 
388 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  27.48 
 
 
431 aa  114  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  29.81 
 
 
364 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>