274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5876 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5876  cytochrome c assembly protein  100 
 
 
265 aa  534  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2580  cytochrome c assembly protein  37.43 
 
 
256 aa  135  9e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05020  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  37.31 
 
 
246 aa  124  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.396568  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 
224 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07680  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  34.08 
 
 
254 aa  122  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.679091  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  36.36 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  33.82 
 
 
225 aa  118  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  31.96 
 
 
239 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  31.86 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  32.99 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  33.77 
 
 
235 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  30.88 
 
 
234 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  31.18 
 
 
236 aa  105  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  32.78 
 
 
230 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  30.53 
 
 
230 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  29.73 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  30 
 
 
234 aa  97.1  3e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  29.47 
 
 
254 aa  96.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  30 
 
 
234 aa  96.3  5e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  31.08 
 
 
268 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  32.37 
 
 
229 aa  93.6  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  33.16 
 
 
254 aa  92.8  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  29.76 
 
 
256 aa  92.8  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  31.42 
 
 
248 aa  92.8  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  31.42 
 
 
248 aa  92.8  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  30.97 
 
 
248 aa  92.8  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  31.42 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  27.19 
 
 
265 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  30.97 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  30.32 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  28.57 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  28.57 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  29.86 
 
 
268 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  31.1 
 
 
248 aa  89  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  28.97 
 
 
256 aa  88.6  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  31.48 
 
 
248 aa  89  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  32.8 
 
 
259 aa  89  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2649  heme exporter protein CcmC  31.31 
 
 
247 aa  88.6  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00358111  normal  0.0120286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0449  heme exporter protein CcmC  33.54 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  28.22 
 
 
254 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0461  heme exporter protein CcmC  35.17 
 
 
242 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.530136  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  31.1 
 
 
248 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  31.1 
 
 
248 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1803  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  33.54 
 
 
242 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  31.1 
 
 
248 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  30.72 
 
 
246 aa  87.8  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0243  heme exporter protein CcmC  32.99 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  hitchhiker  0.000734181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  29.03 
 
 
255 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  26.73 
 
 
260 aa  86.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  29.03 
 
 
255 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1001  heme exporter protein CcmC  28.96 
 
 
244 aa  86.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.114267  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3568  cytochrome c assembly protein  34.18 
 
 
321 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4661  heme exporter protein CcmC  29.61 
 
 
248 aa  86.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.727875  hitchhiker  0.000000192901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  30.56 
 
 
250 aa  85.5  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1411  heme exporter protein CcmC  33.75 
 
 
241 aa  85.9  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11561  normal  0.597775 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  33.73 
 
 
247 aa  85.5  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  31.67 
 
 
254 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  31.36 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  31.63 
 
 
244 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  31.45 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  28.7 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3361  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  30.46 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  29.38 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  33.13 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  27.62 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  29.13 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  28.11 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  27.65 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  28.31 
 
 
267 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  29.3 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1852  cytochrome c assembly protein  30.05 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2719  cytochrome c assembly protein  30.87 
 
 
320 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  30.5 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  29.12 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3254  heme exporter protein CcmC  29.86 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0188  heme exporter protein CcmC  30.33 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1853  heme exporter protein C  32.9 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.024303  normal  0.648082 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  29.3 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3413  heme exporter protein CcmC  30.73 
 
 
248 aa  82  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  27.95 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  32.05 
 
 
245 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  31.35 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  30.34 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  28.32 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0755  cytochrome c assembly protein  34.16 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  27.75 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0177  heme exporter protein CcmC  29.9 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3221  cytochrome c assembly protein  27.75 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  32.17 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  30.27 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4984  heme exporter protein CcmC  30.43 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4437  cytochrome c assembly protein  32.74 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0213  heme exporter protein CcmC  31.1 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  33.09 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  29.77 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  33.77 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  29.11 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  27.37 
 
 
244 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0509  CcmC family heme exporter protein  28.1 
 
 
233 aa  79  0.00000000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0176154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>