More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5071 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5071  Transketolase central region  100 
 
 		 325 aa  650    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.067721  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1034  Transketolase central region  64.81 
 
 		 332 aa  412  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.29633 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1944  Transketolase central region  65.74 
 
 		 325 aa  402  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  48.9 
 
 		 320 aa  299  4e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1047  transketolase, central region  51.68 
 
 		 327 aa  295  7e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0574878  normal  0.0597249 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  47.19 
 
 		 327 aa  293  3e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  47.19 
 
 		 327 aa  293  3e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2404  transketolase, central region  49.55 
 
 		 339 aa  288  9e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  45.32 
 
 		 333 aa  287  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  45.32 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  45.68 
 
 		 324 aa  278  9e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2269  transketolase, central region  47.76 
 
 		 336 aa  278  9e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  46.3 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  48.31 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3559  transketolase, central region  46.11 
 
 		 337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00351586  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  47.69 
 
 		 334 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  47.22 
 
 		 332 aa  272  7e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5078  Transketolase central region  48.77 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1088  Transketolase central region  45.59 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.589015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  48.36 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.61 
 
 		 344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.61 
 
 		 344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.31 
 
 		 344 aa  268  7e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  40.25 
 
 		 325 aa  268  7e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  44.31 
 
 		 344 aa  268  7e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.31 
 
 		 344 aa  268  7e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.31 
 
 		 344 aa  268  8e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0314  acetoin dehydrogenase, beta subunit  47.15 
 
 		 334 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  45.85 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  42.59 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  44.01 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  43.83 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  44.01 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  40.25 
 
 		 325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0344  acetoin:DCPIP oxidoreductase beta subunit  42.81 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.71 
 
 		 344 aa  266  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.71 
 
 		 344 aa  266  5e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  41.23 
 
 		 328 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  41.54 
 
 		 328 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2110  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase (E1) component  41.05 
 
 		 326 aa  264  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.140374  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  42.95 
 
 		 327 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  44.55 
 
 		 324 aa  263  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  40.56 
 
 		 325 aa  262  4.999999999999999e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1601  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  45.02 
 
 		 337 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  40.8 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5919  Transketolase central region  46.77 
 
 		 334 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1120  transketolase, central region  42.86 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  46.04 
 
 		 334 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1092  transketolase, central region  42.86 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1109  transketolase, central region  42.86 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  42.59 
 
 		 332 aa  259  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1749  transketolase central region  48 
 
 		 334 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374866  normal  0.0546828 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3081  dehydrogenase, E1 component  42.99 
 
 		 675 aa  259  6e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0845423  normal  0.132557 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  44.17 
 
 		 328 aa  259  6e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  42.34 
 
 		 340 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  42.34 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1435  transketolase central region  47.69 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464869 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6875  transketolase central region  43.83 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.580767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  42.9 
 
 		 339 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  42.59 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  42.34 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1862  transketolase central region  48.31 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0703587  hitchhiker  0.00590609 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0120  transketolase central region  44.01 
 
 		 341 aa  256  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  43.65 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  44.28 
 
 		 339 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  44.75 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  41.36 
 
 		 327 aa  256  5e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6241  transketolase, central region  48.31 
 
 		 334 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1838  transketolase, central region  48.31 
 
 		 334 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267827  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5139  acetoin/2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit  47.38 
 
 		 334 aa  255  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0912103  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  43.29 
 
 		 343 aa  255  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  44.31 
 
 		 324 aa  255  9e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  44.31 
 
 		 324 aa  255  9e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0929  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  42.41 
 
 		 324 aa  255  9e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5551  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  45.32 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2510  transketolase-like  45.06 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  41.67 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  44 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  41.36 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  41.98 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  44.61 
 
 		 342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  44.11 
 
 		 347 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  41.39 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0856  putative 2-oxo acid dehydrogenase beta subunit  42.99 
 
 		 324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389429  normal  0.709595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4082  Transketolase central region  44.05 
 
 		 335 aa  252  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  39.63 
 
 		 326 aa  252  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  44.13 
 
 		 348 aa  252  6e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.28 
 
 		 449 aa  252  7e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0517  pyruvate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  40.44 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  39.63 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3038  transketolase central region  40.82 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7509  transketolase central region  44.44 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  42.9 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  44.58 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0912  transketolase, central region  43.03 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0840  transketolase, central region  45.37 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1280  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  39.61 
 
 		 327 aa  251  2e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.91 
 
 		 469 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3730  Transketolase central region  43.5 
 
 		 340 aa  250  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.98943 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1750  transketolase central region  45.1 
 
 		 348 aa  249  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>