More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4045 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4045  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 231 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  54.19 
 
 		 233 aa  184  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  48.37 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2161  GntR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0958  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208617  normal  0.334799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  33.79 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  37.88 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 244 aa  98.2  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  37.65 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 218 aa  89.4  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  32.29 
 
 		 218 aa  89  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 233 aa  88.6  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 243 aa  88.6  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 232 aa  85.5  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 211 aa  85.1  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 211 aa  85.1  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  35.43 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0519  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1462  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1846  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2102  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0736867  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0833  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0422  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2317  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0600206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2149  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.577726  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4720  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4211  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.349011  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6445  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  30.45 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5579  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5943  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7250  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0535  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 243 aa  78.2  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  32.27 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  33.19 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  24.32 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>