237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0193 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
126 aa  259  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  47.01 
 
 
119 aa  116  9e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  47.46 
 
 
121 aa  114  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.75 
 
 
138 aa  114  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  52.73 
 
 
150 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  48.31 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  47.22 
 
 
120 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.22 
 
 
118 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.9 
 
 
119 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  33.62 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  37.72 
 
 
177 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  27.56 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.45 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.332449  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01320  hypothetical protein  37.93 
 
 
122 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333196  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.07 
 
 
274 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0577  hypothetical protein  40.51 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116523  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  34.41 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.65 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.55 
 
 
133 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.56 
 
 
172 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.81 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.33 
 
 
172 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  38.61 
 
 
171 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  34.67 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  31.65 
 
 
130 aa  52  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  29.09 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2392  cupin 2 domain-containing protein  31.19 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232938  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  32.91 
 
 
162 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  28.05 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  30.34 
 
 
134 aa  50.1  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3060  cupin 2 domain-containing protein  32.43 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975792 
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  32.14 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  30.63 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  29.55 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1593  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.93 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.147547 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  40.35 
 
 
203 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  35.71 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  30.1 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  38.46 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  26.61 
 
 
122 aa  48.9  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.76 
 
 
159 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  31.94 
 
 
171 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  36.76 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.84 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1757  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.61 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128793  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  35.38 
 
 
172 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.46 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  29.07 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2328  cupin region  30.19 
 
 
167 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  34.25 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0766  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  31.65 
 
 
472 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.38 
 
 
181 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2960  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  29.76 
 
 
490 aa  47.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2573  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  29.76 
 
 
490 aa  47.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  29.73 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  37.1 
 
 
166 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.62 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.88 
 
 
146 aa  47.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 
130 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0888  mannose-1-phosphate guanylyltransferase-like  30.11 
 
 
119 aa  47  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  hitchhiker  0.000147914 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.73 
 
 
141 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  30.3 
 
 
147 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  32.84 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1927  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.43 
 
 
477 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal  0.35544 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1329  mannose-6-phosphate isomerase  23.81 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0501  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3999  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  31.65 
 
 
476 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  32.1 
 
 
152 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  40.98 
 
 
155 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.11 
 
 
192 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4503  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.3 
 
 
469 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.930228  normal  0.622419 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.908983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4135  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.3 
 
 
469 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.500124  normal  0.71949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2942  hypothetical protein  35.53 
 
 
144 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4146  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  31.65 
 
 
474 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.469733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.65 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  26.19 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.02 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2364  mannose-6-phosphate isomerase  27.59 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.960914  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4617  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.3 
 
 
469 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0274196  normal  0.929739 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  33.33 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  30.36 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3146  cupin 2, barrel  27.88 
 
 
187 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.515896 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  42.86 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2852  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.56 
 
 
476 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.78 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.39 
 
 
126 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  35.14 
 
 
163 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.39 
 
 
126 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6242  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  29.76 
 
 
479 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.91 
 
 
167 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.49 
 
 
170 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  25.26 
 
 
129 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2852  cupin 2  28.71 
 
 
156 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 
115 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>