More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2945 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2945  histidine kinase  100 
 
 		 616 aa  1253    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.546794  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2944  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.5 
 
 		 604 aa  571  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0256  histidine kinase  42.23 
 
 		 712 aa  210  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2145  histidine kinase  37.93 
 
 		 610 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.06 
 
 		 755 aa  104  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00237245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 873 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00758089  normal  0.057217 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0081  histidine kinase  27.27 
 
 		 529 aa  95.9  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.63025  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 1242 aa  95.9  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 680 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  23.34 
 
 		 581 aa  95.5  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3384  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 		 898 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0214  histidine kinase  26.89 
 
 		 657 aa  95.1  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2038  histidine kinase  26.9 
 
 		 552 aa  94.4  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02433  sensor histide kinase  27.8 
 
 		 482 aa  94.4  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 		 1146 aa  93.6  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2370  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 672 aa  93.6  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0813  histidine kinase  25.91 
 
 		 587 aa  92.8  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1744  Signal transduction histidine kinase  23.6 
 
 		 893 aa  92.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410742  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1356  histidine kinase  25.37 
 
 		 591 aa  92.8  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.272397  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3113  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 962 aa  92.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1112  histidine kinase  30.08 
 
 		 453 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0613673  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 		 1465 aa  91.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 		 893 aa  91.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01455  sensor histidine kinase  24.81 
 
 		 436 aa  91.3  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 1036 aa  91.3  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 407 aa  91.3  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2356  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.95 
 
 		 900 aa  91.3  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0113546  normal  0.244783 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 557 aa  91.3  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 		 789 aa  91.3  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.84 
 
 		 1795 aa  90.5  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3720  histidine kinase  25.27 
 
 		 693 aa  90.1  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 683 aa  89.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3803  histone-like DNA-binding protein  29.63 
 
 		 308 aa  90.1  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2177  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 885 aa  90.1  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3715  histidine kinase  28.24 
 
 		 695 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223291 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4495  sensory box sensor histidine kinase  28.52 
 
 		 508 aa  89.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1349  histidine kinase  23.46 
 
 		 554 aa  89.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134136  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3109  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 		 901 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3581  histidine kinase  27.14 
 
 		 739 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  28.19 
 
 		 1187 aa  88.6  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2532  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.09 
 
 		 794 aa  88.2  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.108241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2443  histidine kinase  29.15 
 
 		 578 aa  88.2  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 713 aa  87.8  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 666 aa  88.2  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1720  flagellar regulatory protein B  25.2 
 
 		 351 aa  87  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00341718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  28.25 
 
 		 542 aa  87  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 557 aa  87  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 671 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3910  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.15 
 
 		 850 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.302032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 		 678 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0246  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 573 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  25.9 
 
 		 439 aa  86.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.8 
 
 		 822 aa  87  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.52 
 
 		 1215 aa  86.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0932  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 		 632 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  24.65 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2633  histidine kinase  25.09 
 
 		 566 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4673  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 713 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1893  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 985 aa  86.3  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.426931  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1018  sensory box sensor histidine kinase  23.19 
 
 		 648 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1222  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 686 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5024  histidine kinase  28.9 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  24.83 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3535  histidine kinase  27.41 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.15 
 
 		 801 aa  85.1  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00277  Signal transduction histidine kinase (contains HAMP domain)  25.38 
 
 		 560 aa  84.3  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3600  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.19 
 
 		 900 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.56 
 
 		 1797 aa  84.3  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 559 aa  84  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4457  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.36 
 
 		 661 aa  84  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  25.08 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1180  ATP-binding region, ATPase-like  26.07 
 
 		 451 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2392  histidine kinase  26.01 
 
 		 502 aa  83.6  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 467 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0186  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 		 857 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 571 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2683  ATP-binding region ATPase domain protein  28.69 
 
 		 746 aa  83.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.301078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5455  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 		 571 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0104043  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 		 632 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  27.36 
 
 		 505 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  26.09 
 
 		 524 aa  82.8  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 1021 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 827 aa  82.4  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3068  histidine kinase  23.88 
 
 		 485 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.158411  normal  0.556433 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.51 
 
 		 644 aa  82.8  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 588 aa  82.8  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2962  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.51 
 
 		 729 aa  82.4  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0966  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 		 632 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1834  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 681 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 		 577 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0969  sensory histidine kinase AtoS  28.57 
 
 		 622 aa  82  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000351141  normal  0.40359 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0958  histidine kinase  24.6 
 
 		 632 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.27 
 
 		 1805 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  24.76 
 
 		 458 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 672 aa  82  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 		 470 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 		 919 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>