More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0401 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 755 aa  1512    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00237245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.5 
 
 		 822 aa  313  9e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.25 
 
 		 732 aa  145  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000536436  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2944  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 604 aa  139  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.21 
 
 		 657 aa  134  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  26.76 
 
 		 660 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  26.76 
 
 		 660 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1328  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.96 
 
 		 658 aa  132  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  26.57 
 
 		 660 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  21.73 
 
 		 695 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0266885  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  26.57 
 
 		 660 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  26.57 
 
 		 660 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2304  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.68 
 
 		 713 aa  129  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0631  methyl-accepting chemotaxis protein  26.38 
 
 		 660 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  26.57 
 
 		 660 aa  126  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1488  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.75 
 
 		 758 aa  126  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.62 
 
 		 650 aa  125  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3450  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.29 
 
 		 664 aa  125  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.53 
 
 		 661 aa  125  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0201  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.81 
 
 		 736 aa  124  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00388216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4841  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25 
 
 		 666 aa  124  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4724  methyl-accepting chemotaxis protein  25.9 
 
 		 666 aa  122  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5124  methyl-accepting chemotaxis protein  25.9 
 
 		 669 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5151  methyl-accepting chemotaxis protein  25.93 
 
 		 666 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4882  methyl-accepting chemotaxis protein  25.9 
 
 		 666 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5256  methyl-accepting chemotaxis protein  25.9 
 
 		 666 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0594583  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.01 
 
 		 676 aa  121  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.06 
 
 		 679 aa  120  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0088  methyl-accepting chemotaxis protein  25.05 
 
 		 666 aa  120  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5156  methyl-accepting chemotaxis protein  25.05 
 
 		 666 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.87 
 
 		 666 aa  119  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  23.96 
 
 		 658 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  22.28 
 
 		 660 aa  119  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05691  histidine kinase  25 
 
 		 538 aa  118  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2356  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.52 
 
 		 415 aa  118  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.120093  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1768  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.32 
 
 		 516 aa  117  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  22.2 
 
 		 660 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2945  histidine kinase  25.06 
 
 		 616 aa  115  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.546794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4543  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.78 
 
 		 663 aa  114  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.113755  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  25.06 
 
 		 658 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  25.06 
 
 		 658 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  25.06 
 
 		 658 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  25.06 
 
 		 658 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  24.39 
 
 		 650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4739  methyl-accepting chemotaxis protein  23.7 
 
 		 666 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  25.78 
 
 		 645 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  25.6 
 
 		 713 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  25.06 
 
 		 658 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  23.49 
 
 		 658 aa  112  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  22.96 
 
 		 660 aa  111  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0020921  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.69 
 
 		 660 aa  111  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.96 
 
 		 660 aa  111  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171017  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3234  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.6 
 
 		 678 aa  111  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0897525  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.87 
 
 		 533 aa  111  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5162  methyl-accepting chemotaxis protein  25.71 
 
 		 666 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  22.47 
 
 		 660 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.22 
 
 		 540 aa  110  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  26.01 
 
 		 712 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  22.47 
 
 		 660 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  22.47 
 
 		 660 aa  110  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  22.47 
 
 		 660 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  22.47 
 
 		 660 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  22.87 
 
 		 660 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.25 
 
 		 689 aa  110  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.03 
 
 		 659 aa  109  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  23.51 
 
 		 650 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  23.51 
 
 		 650 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0213  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.66 
 
 		 807 aa  108  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.344812 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.7 
 
 		 566 aa  108  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  21.96 
 
 		 660 aa  107  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  22.6 
 
 		 658 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.751919 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27 
 
 		 623 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0619  methyl-accepting chemotaxis protein  25.06 
 
 		 658 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.95 
 
 		 748 aa  106  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  23.62 
 
 		 660 aa  106  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.85 
 
 		 564 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  25.47 
 
 		 712 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1607  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.54 
 
 		 668 aa  106  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.11 
 
 		 588 aa  105  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.031352  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  22.78 
 
 		 660 aa  105  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  21.63 
 
 		 658 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0868  methyl-accepting chemotaxis protein  26.54 
 
 		 536 aa  105  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000231989  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  27.81 
 
 		 642 aa  105  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2122  methyl-accepting chemotaxis protein  22.3 
 
 		 660 aa  104  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  27.23 
 
 		 714 aa  103  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0687  methyl-accepting chemotaxis protein  25.06 
 
 		 658 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.64 
 
 		 543 aa  103  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2152  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.92 
 
 		 655 aa  103  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.697016  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2086  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.13 
 
 		 653 aa  103  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0240769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.97 
 
 		 807 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  22.47 
 
 		 660 aa  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  26.2 
 
 		 633 aa  103  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0341  methyl-accepting chemotaxis protein  30.48 
 
 		 574 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  22.1 
 
 		 628 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.8 
 
 		 660 aa  103  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00464  methyl-accepting chemotaxis protein  23.25 
 
 		 636 aa  103  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  26.04 
 
 		 714 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.04 
 
 		 714 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1879  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.86 
 
 		 661 aa  103  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.34 
 
 		 647 aa  103  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>