More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1008 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 373 aa  764    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  46.89 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  41.56 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  40.78 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  40.13 
 
 		 355 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  38.44 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  38.68 
 
 		 339 aa  212  7e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  39.93 
 
 		 344 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  41.56 
 
 		 335 aa  209  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  38 
 
 		 338 aa  206  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  34.47 
 
 		 344 aa  202  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  34.19 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  39.05 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  35.38 
 
 		 345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  36.21 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  38.49 
 
 		 360 aa  186  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  36.33 
 
 		 347 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  36.33 
 
 		 362 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  33.76 
 
 		 344 aa  179  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  34.49 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  35.8 
 
 		 362 aa  176  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0732  hypothetical protein  35.11 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  32.81 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  33.71 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  35 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  31.23 
 
 		 334 aa  170  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  35.28 
 
 		 364 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  32.68 
 
 		 376 aa  170  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  34.97 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  30.43 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  34.87 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  34.81 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  35.86 
 
 		 370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  32.57 
 
 		 327 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  32.89 
 
 		 358 aa  162  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3414  aminodeoxychorismate lyase  36.07 
 
 		 369 aa  162  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  32.96 
 
 		 339 aa  159  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  34.31 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  36.76 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  33.97 
 
 		 349 aa  157  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  33.76 
 
 		 340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  32.62 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1563  aminodeoxychorismate lyase  35.08 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  32.8 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  33.96 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  30.11 
 
 		 363 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  33.13 
 
 		 620 aa  152  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  31.2 
 
 		 356 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  32.42 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  30.08 
 
 		 467 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  30.08 
 
 		 467 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  30.17 
 
 		 363 aa  152  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  33.97 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  29.73 
 
 		 623 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  31.3 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  30.93 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  31.88 
 
 		 339 aa  150  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  30.55 
 
 		 464 aa  150  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  32.68 
 
 		 340 aa  150  5e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.93 
 
 		 356 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  31.71 
 
 		 355 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.93 
 
 		 356 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  34.43 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  32.03 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  32.79 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  30.39 
 
 		 418 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  30.93 
 
 		 356 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  30.93 
 
 		 356 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  30.45 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  31.8 
 
 		 342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  33.76 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  32.92 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  39.91 
 
 		 314 aa  147  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  33.03 
 
 		 389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  32.35 
 
 		 339 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  28.73 
 
 		 599 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  30.59 
 
 		 355 aa  146  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  33.55 
 
 		 340 aa  146  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  28.69 
 
 		 415 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  31.68 
 
 		 335 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  32.47 
 
 		 351 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  31.58 
 
 		 351 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  32.28 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0908  aminodeoxychorismate lyase  31.43 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.112601  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  31.43 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  30.91 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.4 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  30.23 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  27.44 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  32.39 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  31.34 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  31.31 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  32.57 
 
 		 337 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  30.77 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  31.99 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  31.27 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  28.29 
 
 		 471 aa  143  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  29.69 
 
 		 414 aa  143  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  31.41 
 
 		 315 aa  142  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  32.34 
 
 		 372 aa  142  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>