More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0384 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0384  ABC transporter related protein  100 
 
 		 237 aa  481  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3802  ABC transporter related  59.36 
 
 		 221 aa  268  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3064  ABC transporter, ATP-binding protein  51.13 
 
 		 227 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2199  ABC transporter, ATP-binding protein  52.27 
 
 		 221 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517578  hitchhiker  0.0000000011345 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0657  ABC transporter ATP-binding protein  54.59 
 
 		 216 aa  242  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0271807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2837  ABC transporter ATP-binding protein  50.91 
 
 		 223 aa  241  7e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000357321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3052  ABC transporter ATP-binding protein  50.91 
 
 		 223 aa  241  7e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2811  ABC transporter, ATP-binding protein  51.36 
 
 		 223 aa  240  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179867  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2771  ABC transporter, ATP-binding protein  50.91 
 
 		 223 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0904  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  54.13 
 
 		 216 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3083  ABC transporter, ATP-binding protein  50.91 
 
 		 223 aa  237  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.760416  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3081  ABC transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 223 aa  235  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.501337  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  48.89 
 
 		 230 aa  235  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  48.67 
 
 		 236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  48.47 
 
 		 266 aa  227  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  45.11 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  48.2 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  47.14 
 
 		 235 aa  225  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  45.66 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  47 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  47.3 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  45.74 
 
 		 240 aa  221  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  47.01 
 
 		 242 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  44.95 
 
 		 228 aa  220  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  49.32 
 
 		 224 aa  220  1.9999999999999999e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  44.2 
 
 		 644 aa  219  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  47.25 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  47.25 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  46.15 
 
 		 237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 230 aa  218  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  46.46 
 
 		 247 aa  218  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  46.98 
 
 		 233 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  43.67 
 
 		 248 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  44.84 
 
 		 229 aa  217  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  48.65 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  48.05 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  44.8 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  47.16 
 
 		 234 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  47.32 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.59 
 
 		 647 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  46.52 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1979  transporter  50.23 
 
 		 227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  45.25 
 
 		 668 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  45.25 
 
 		 668 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  48.17 
 
 		 246 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  48.17 
 
 		 246 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  48.17 
 
 		 246 aa  216  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  50.68 
 
 		 236 aa  215  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  47.51 
 
 		 232 aa  215  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  44.63 
 
 		 653 aa  214  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  44.78 
 
 		 252 aa  214  8e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  45.18 
 
 		 667 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  45.18 
 
 		 667 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  43.23 
 
 		 228 aa  214  9e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  45.29 
 
 		 246 aa  214  9e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  46.49 
 
 		 648 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  46.46 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  46.49 
 
 		 648 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  45.29 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  45.33 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  43.97 
 
 		 646 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  46.4 
 
 		 230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  46.78 
 
 		 239 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  46.72 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  45.26 
 
 		 682 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  47.25 
 
 		 246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  45.5 
 
 		 240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  47.25 
 
 		 263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  44.83 
 
 		 682 aa  211  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  46.33 
 
 		 232 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  44.75 
 
 		 224 aa  211  9e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  45.05 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  45.53 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  46.58 
 
 		 226 aa  211  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  46.33 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  44.05 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  45.33 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.97 
 
 		 656 aa  209  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  46.33 
 
 		 247 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  46.4 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  44.3 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  43.83 
 
 		 649 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  45.05 
 
 		 224 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  44.02 
 
 		 661 aa  209  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  45.87 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  47.75 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  42.08 
 
 		 237 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  46.33 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  46.33 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  45.87 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  45.18 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  46.33 
 
 		 247 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  46.33 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  45.09 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  45.05 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1413  ABC transporter ATPase  45.26 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  44 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  44.89 
 
 		 656 aa  209  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>