More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2667 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
737 aa  1473    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  33.43 
 
 
751 aa  341  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
695 aa  328  3e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.92 
 
 
1059 aa  301  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.62 
 
 
866 aa  298  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2131  response regulator, histidine kinase  39.32 
 
 
958 aa  296  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.739788  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  37.38 
 
 
987 aa  295  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  40.77 
 
 
982 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 
631 aa  285  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3728  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 
750 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  39.24 
 
 
553 aa  279  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.18 
 
 
1075 aa  279  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2178  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.01 
 
 
750 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00477296  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  40.04 
 
 
1125 aa  276  9e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
822 aa  275  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.8 
 
 
765 aa  275  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2035  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 
750 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  42.75 
 
 
900 aa  273  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  34.15 
 
 
985 aa  273  8.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
1433 aa  273  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.07 
 
 
1199 aa  273  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.97 
 
 
1350 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 
817 aa  271  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  39.91 
 
 
641 aa  270  8.999999999999999e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 
1125 aa  269  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 
874 aa  269  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
873 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.28 
 
 
781 aa  269  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 
827 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.97 
 
 
864 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  34.68 
 
 
968 aa  268  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.64 
 
 
1362 aa  268  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 
844 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 
844 aa  266  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  42.51 
 
 
676 aa  266  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.28 
 
 
1226 aa  266  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 
932 aa  264  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65860  putative two-component sensor  39.79 
 
 
770 aa  264  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407883  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5715  putative two-component sensor  39.59 
 
 
750 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.901003  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  43 
 
 
785 aa  264  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  41.5 
 
 
620 aa  264  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.71 
 
 
877 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 
1127 aa  263  8e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 
764 aa  263  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 
882 aa  263  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 
759 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.01 
 
 
1158 aa  262  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  42.44 
 
 
578 aa  262  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  38.24 
 
 
1060 aa  261  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.67 
 
 
876 aa  261  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.98 
 
 
606 aa  261  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
1611 aa  261  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.55 
 
 
1767 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 
1767 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 
896 aa  260  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 
803 aa  260  6e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
1195 aa  259  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 
873 aa  259  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1728  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 
1120 aa  259  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405777  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0202  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
781 aa  259  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0688  histidine kinase  38.08 
 
 
691 aa  258  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.88 
 
 
1284 aa  259  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 
880 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.01 
 
 
984 aa  258  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  40.51 
 
 
1763 aa  259  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.29 
 
 
957 aa  258  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  37.59 
 
 
671 aa  258  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.21 
 
 
1202 aa  258  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  39.45 
 
 
1765 aa  257  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 
1407 aa  257  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.91 
 
 
946 aa  257  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 
1767 aa  257  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  40.92 
 
 
588 aa  257  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  36.88 
 
 
544 aa  256  8e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  39.14 
 
 
794 aa  256  9e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 
724 aa  256  9e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2475  sensor histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 
784 aa  256  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446979  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 
1124 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 
1771 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.77 
 
 
1120 aa  256  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 
674 aa  255  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  35.87 
 
 
835 aa  254  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 
1596 aa  255  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1601  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 
685 aa  255  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0518398  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1277  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 
811 aa  254  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.93 
 
 
763 aa  254  4.0000000000000004e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  36.69 
 
 
755 aa  254  5.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 
1009 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  34.98 
 
 
984 aa  253  7e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000354  sensor histidine kinase  31.35 
 
 
785 aa  253  7e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.407699  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3044  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
813 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.53 
 
 
812 aa  253  8.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 
1313 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.14 
 
 
1398 aa  253  9.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  39.5 
 
 
764 aa  252  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 
1029 aa  253  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  40.81 
 
 
606 aa  253  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3852  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
879 aa  253  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0452097  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1877  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 
863 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 
969 aa  253  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>