More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6479 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
237 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.43 
 
 
236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.435369  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.74 
 
 
226 aa  216  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156891  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.85 
 
 
236 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  44.81 
 
 
228 aa  195  6e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3579  biopolymer transport protein  47.21 
 
 
234 aa  194  8.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.159406  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.48 
 
 
234 aa  191  9e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.36 
 
 
204 aa  181  7e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.8 
 
 
238 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0460  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.21 
 
 
230 aa  179  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  38.92 
 
 
229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.08 
 
 
241 aa  122  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.42 
 
 
246 aa  116  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.96 
 
 
243 aa  115  7.999999999999999e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.65 
 
 
339 aa  105  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0782  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.91 
 
 
270 aa  105  7e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.36 
 
 
206 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.48 
 
 
210 aa  99  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.77 
 
 
218 aa  99  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  27.72 
 
 
234 aa  97.1  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.91 
 
 
257 aa  96.7  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  31.51 
 
 
470 aa  93.2  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.15 
 
 
206 aa  92.4  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.35 
 
 
576 aa  92  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.23 
 
 
220 aa  91.7  9e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  29.23 
 
 
220 aa  91.7  9e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.37 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.26 
 
 
202 aa  89.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  29.44 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.5 
 
 
204 aa  88.6  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.38 
 
 
214 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.1 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.4 
 
 
220 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.25 
 
 
208 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  28.14 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.7 
 
 
208 aa  86.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  28.14 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.5 
 
 
209 aa  85.9  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.9 
 
 
206 aa  85.5  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  25.9 
 
 
206 aa  85.5  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.4 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.75 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.426551  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  27.18 
 
 
474 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  25.13 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.21 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.41 
 
 
480 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.47 
 
 
218 aa  81.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.85 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.23 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.43 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.23 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0287  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.51 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.92 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  24.43 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.53 
 
 
216 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5123  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.26 
 
 
234 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.76 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.76 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  23.86 
 
 
465 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.89 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2018  biopolymer transport protein  28.72 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  23.01 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0539  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.88 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  23.96 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.89 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  22.57 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.94 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  23.81 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0493  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.09 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.02 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  26.11 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1426  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.06 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  25.87 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  25.37 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.38 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  25.62 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.16 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.04 
 
 
230 aa  72  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0443122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.23 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0667192  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.87 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.42 
 
 
221 aa  71.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0536  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.8 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.14 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.45 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0542744  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.48 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  22.78 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.83 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  23.41 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.72 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  22.89 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.42 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1474  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.27 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368115  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  29.82 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  22.89 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1509  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.27 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75134  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.36 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>