More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6319 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
149 aa  308  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0836  heat shock protein Hsp20  69.8 
 
 
149 aa  222  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.414458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3751  response regulator receiver protein  70 
 
 
150 aa  216  7.999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.544355  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4413  heat shock protein Hsp20  67.33 
 
 
150 aa  209  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0233  small heat shock protein  55.63 
 
 
145 aa  158  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.818598  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  47.37 
 
 
148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  45.93 
 
 
142 aa  130  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06090  small heat shock protein  43.33 
 
 
148 aa  125  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.473161  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2899  heat shock protein Hsp20  44.08 
 
 
145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0174584 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1697  hypothetical protein  39.46 
 
 
145 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2326  heat shock protein Hsp20  44.68 
 
 
144 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0663504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0370  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.733353  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  40.15 
 
 
148 aa  92  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  37.88 
 
 
143 aa  90.9  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  40.83 
 
 
146 aa  89.4  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  35.95 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  35.38 
 
 
156 aa  87.8  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  39.39 
 
 
147 aa  87  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  39.39 
 
 
147 aa  86.7  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
176 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  40.18 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 
189 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  42.45 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  39.25 
 
 
189 aa  84.3  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  44.95 
 
 
147 aa  84  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  39.25 
 
 
189 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  39.85 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  35.88 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  39.25 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
149 aa  82  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  33.83 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  40.4 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  39.25 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  36.57 
 
 
184 aa  82  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  35.76 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  41.59 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4132  heat shock protein Hsp20  32.81 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  38 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  35.94 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  35.11 
 
 
177 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  39.67 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  35.83 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  40.37 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  40.37 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  39 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  40.37 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  40.37 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  40.37 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  40.37 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  40.37 
 
 
215 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  33.91 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  34.07 
 
 
231 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
163 aa  77  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  43.01 
 
 
143 aa  77  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
139 aa  76.6  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
136 aa  76.6  0.00000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  31.78 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  34.21 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  43.75 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  36.07 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  41.94 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  38.21 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  31.78 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  34.88 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  36.45 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  36.45 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  33.61 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  37.3 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  38.39 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  35.16 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  34.09 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  33.04 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  32.5 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  39.09 
 
 
181 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  39.09 
 
 
181 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  32.56 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  35.48 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  36.52 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  35.88 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  30.97 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  35.09 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  37.27 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1509  heat shock protein Hsp20  36.07 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000196437  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  34.57 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  41.57 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>