More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5894 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 615 aa  1281    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  41.72 
 
 		 617 aa  505  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  32.04 
 
 		 605 aa  289  9e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  31.41 
 
 		 602 aa  260  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  29.79 
 
 		 602 aa  235  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  29.18 
 
 		 619 aa  235  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  29.2 
 
 		 599 aa  227  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3220  Rhs element Vgr protein  28.57 
 
 		 618 aa  215  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  26.92 
 
 		 616 aa  211  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  26.89 
 
 		 612 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  24.83 
 
 		 576 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  35.71 
 
 		 218 aa  115  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  26.91 
 
 		 593 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  25.94 
 
 		 668 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  30.48 
 
 		 248 aa  103  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  26.25 
 
 		 668 aa  101  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  25.84 
 
 		 697 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 589 aa  97.1  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  31.98 
 
 		 239 aa  92  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  25.84 
 
 		 709 aa  92  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  23.86 
 
 		 668 aa  92  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  24.83 
 
 		 669 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  23.3 
 
 		 683 aa  89.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  26.44 
 
 		 851 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2821  Rhs element protein VgrE  23.01 
 
 		 690 aa  89.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  21.69 
 
 		 741 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  31.16 
 
 		 578 aa  88.6  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  38.58 
 
 		 273 aa  89  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  23.18 
 
 		 741 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  22.94 
 
 		 683 aa  88.2  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  22.72 
 
 		 706 aa  87  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  24.82 
 
 		 729 aa  87  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  23.78 
 
 		 853 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  22.19 
 
 		 643 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  24.82 
 
 		 729 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  32.85 
 
 		 275 aa  85.9  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  23.29 
 
 		 741 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  24.4 
 
 		 723 aa  85.9  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0251  type VI secretion system Vgr family protein  24.47 
 
 		 713 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830075 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  26.49 
 
 		 619 aa  84  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  23.04 
 
 		 574 aa  84  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  22.87 
 
 		 646 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  21.82 
 
 		 687 aa  84  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  21.82 
 
 		 687 aa  84  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  21.82 
 
 		 687 aa  84  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  22.87 
 
 		 587 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  23.61 
 
 		 618 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  22.46 
 
 		 619 aa  83.2  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  22.77 
 
 		 689 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  24.37 
 
 		 713 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  23.97 
 
 		 661 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  24.14 
 
 		 661 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  23.97 
 
 		 661 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  25.1 
 
 		 661 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  21.93 
 
 		 875 aa  82.4  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  23.97 
 
 		 661 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  23.97 
 
 		 661 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  24.18 
 
 		 565 aa  82  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  24.9 
 
 		 661 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  22.33 
 
 		 871 aa  81.3  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  24.65 
 
 		 609 aa  81.3  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  24.34 
 
 		 641 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0243  type VI secretion system Vgr family protein  24.42 
 
 		 713 aa  80.9  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  24.86 
 
 		 724 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0245  type VI secretion system Vgr family protein  24.42 
 
 		 713 aa  80.9  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  23.31 
 
 		 730 aa  80.5  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  23.86 
 
 		 743 aa  80.5  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  23.54 
 
 		 618 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  23.77 
 
 		 614 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  22.99 
 
 		 613 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  23.14 
 
 		 617 aa  79.7  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  31.11 
 
 		 229 aa  80.1  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  24.21 
 
 		 633 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  22.45 
 
 		 735 aa  79.7  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  21.23 
 
 		 592 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  27.86 
 
 		 606 aa  79.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  22.11 
 
 		 661 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  20.83 
 
 		 703 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  24.21 
 
 		 633 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3043  type VI secretion system Vgr family protein  24.18 
 
 		 611 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313865  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  24.15 
 
 		 704 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0587  type VI secretion system Vgr family protein  23.99 
 
 		 633 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  22.56 
 
 		 682 aa  79  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  22.86 
 
 		 689 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  30.49 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  23.15 
 
 		 869 aa  78.2  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  28.38 
 
 		 642 aa  78.2  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  24.48 
 
 		 702 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  24.3 
 
 		 618 aa  77.4  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1138  hypothetical protein  32.87 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0153  Rhs element Vgr protein  22.51 
 
 		 689 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  24.03 
 
 		 1095 aa  77.4  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  23.48 
 
 		 911 aa  77  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2758  vgrG protein  25.69 
 
 		 774 aa  77  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  25.23 
 
 		 775 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  25.38 
 
 		 595 aa  76.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1538  two component LuxR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 621 aa  76.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  25.85 
 
 		 775 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  25.1 
 
 		 610 aa  76.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  25.23 
 
 		 775 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>