More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3040 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3212  ABC transporter related protein  44.23 
 
 		 790 aa  664    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125335  hitchhiker  0.000000125221 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0264  ABC transporter related  49.26 
 
 		 761 aa  759    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1327  ABC transporter related  49.66 
 
 		 751 aa  746    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0595  daunorubicin resistance protein DrrC, putative  48.33 
 
 		 752 aa  710    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0588759  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2348  ABC transporter-like protein  45.93 
 
 		 790 aa  692    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.86691  normal  0.591253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5845  ABC transporter related  44.65 
 
 		 790 aa  659    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1474  ABC transporter related  51.21 
 
 		 758 aa  744    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.891231  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3531  ABC transporter related  48.19 
 
 		 754 aa  714    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114059  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1716  ABC transporter related  50.27 
 
 		 745 aa  759    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01950  Excinuclease ATPase subunit  44.89 
 
 		 798 aa  650    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3513  ABC transporter related protein  49.53 
 
 		 752 aa  731    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0485409  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3727  ABC transporter related  44.03 
 
 		 810 aa  660    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7895  excinuclease ABC subunit A  45.72 
 
 		 768 aa  663    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2501  ABC transporter related protein  45.33 
 
 		 805 aa  664    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0727  ABC transporter related protein  48.73 
 
 		 752 aa  720    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2621  ABC transporter related  44.78 
 
 		 826 aa  636    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.12429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2219  ABC transporter related protein  44.74 
 
 		 788 aa  652    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0097  ABC transporter related  42.93 
 
 		 792 aa  638    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73348  normal  0.128909 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2074  ABC transporter related  43.17 
 
 		 798 aa  645    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012346  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0491  ABC transporter related protein  44.29 
 
 		 794 aa  667    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544871  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2761  ABC transporter related protein  49.06 
 
 		 752 aa  733    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5797  ABC transporter related protein  46.41 
 
 		 780 aa  729    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0852128  normal  0.68212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1738  ABC transporter related  45.47 
 
 		 793 aa  649    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1600  ABC transporter related protein  43.93 
 
 		 798 aa  653    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.239381 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18400  Excinuclease ATPase subunit  44.67 
 
 		 795 aa  659    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2478  ABC transporter related  44.06 
 
 		 797 aa  645    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.704947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0057  ABC transporter related  44.17 
 
 		 797 aa  636    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0413721  normal  0.79813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2899  ABC transporter related  44.54 
 
 		 796 aa  637    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000977115  hitchhiker  0.0000331786 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1999  ABC transporter related  49.4 
 
 		 761 aa  759    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6204  nogalamycin resistance protein SnorO  48.13 
 
 		 750 aa  720    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846667 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1980  ABC transporter related  55.07 
 
 		 753 aa  837    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0889  excinuclease ATPase subunit  45.45 
 
 		 760 aa  687    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.470006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0885  excinuclease ATPase subunit  46.87 
 
 		 750 aa  687    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.987216  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2199  ABC transporter related  45.08 
 
 		 794 aa  664    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424891  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0108  ABC transporter related  44.12 
 
 		 796 aa  661    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1801  ABC transporter related  49.53 
 
 		 745 aa  737    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.344909  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2679  ABC transporter related  44.77 
 
 		 795 aa  672    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.249669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1785  ABC transporter related  45.47 
 
 		 793 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.806156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3006  ABC transporter-related protein  45.49 
 
 		 792 aa  669    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320548  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3040  ABC transporter related  100 
 
 		 754 aa  1547    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28420  Excinuclease ATPase subunit  45.04 
 
 		 799 aa  664    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3170  ABC transporter related  45.78 
 
 		 801 aa  651    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1659  ABC transporter related protein  45.98 
 
 		 792 aa  674    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.818321  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1717  ABC transporter related  45.34 
 
 		 793 aa  647    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2061  ABC transporter related protein  47.32 
 
 		 756 aa  681    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1286  ABC transporter related protein  46.21 
 
 		 827 aa  669    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19653  hitchhiker  0.00243826 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2335  ABC transporter related  43.92 
 
 		 797 aa  633  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0125219 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1706  ABC transporter related protein  44.27 
 
 		 795 aa  631  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1760  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 799 aa  625  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4179  ABC transporter related  43.88 
 
 		 795 aa  622  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706824  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3201  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 790 aa  612  1e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0977104  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  35.24 
 
 		 838 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  35.27 
 
 		 843 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  35.77 
 
 		 850 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  36.48 
 
 		 844 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  35.07 
 
 		 853 aa  488  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  35.8 
 
 		 832 aa  482  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  34.63 
 
 		 838 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  34.84 
 
 		 838 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  33.41 
 
 		 899 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  36.52 
 
 		 827 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  33.94 
 
 		 861 aa  482  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  35.01 
 
 		 834 aa  478  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  34.83 
 
 		 838 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  33 
 
 		 950 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  36.4 
 
 		 823 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  33.26 
 
 		 897 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  34.7 
 
 		 877 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  35.44 
 
 		 822 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  33.9 
 
 		 885 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  33.99 
 
 		 894 aa  458  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  36.42 
 
 		 851 aa  451  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  33.49 
 
 		 820 aa  445  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  34.25 
 
 		 848 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  34.25 
 
 		 848 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  34.13 
 
 		 848 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  34.06 
 
 		 843 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  34.32 
 
 		 860 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  35.44 
 
 		 776 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  32.49 
 
 		 899 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  31.92 
 
 		 898 aa  437  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  31.61 
 
 		 898 aa  435  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  38.1 
 
 		 931 aa  432  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  33.71 
 
 		 881 aa  432  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2009  excinuclease ABC, A subunit  33.41 
 
 		 880 aa  429  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  37.35 
 
 		 946 aa  419  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  37.56 
 
 		 946 aa  421  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0800  excinuclease ABC subunit A  37.52 
 
 		 948 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0037  excinuclease ABC subunit A  37.22 
 
 		 920 aa  419  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  35.79 
 
 		 968 aa  416  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0654  excinuclease ABC, A subunit  37.01 
 
 		 992 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4520  excinuclease ABC subunit A  37.15 
 
 		 961 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5051  excinuclease ABC subunit A  36.43 
 
 		 944 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0371407 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1301  excinuclease ABC subunit A  38.06 
 
 		 942 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  36.24 
 
 		 946 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1406  excinuclease ABC, A subunit  38.34 
 
 		 935 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0783  excinuclease ABC subunit A  37.52 
 
 		 948 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.686779  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3878  excinuclease ABC subunit A  33.79 
 
 		 946 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2026  ABC transporter related  33.25 
 
 		 818 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  36.22 
 
 		 954 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>