More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3073 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  65.3 
 
 		 844 aa  1150    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  69.15 
 
 		 838 aa  1224    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  66.13 
 
 		 832 aa  1131    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  66.67 
 
 		 861 aa  1168    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  53.9 
 
 		 834 aa  944    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  72.88 
 
 		 898 aa  1264    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  56.19 
 
 		 880 aa  942    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  71.51 
 
 		 899 aa  1223    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  100 
 
 		 950 aa  1935    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2009  excinuclease ABC, A subunit  70.38 
 
 		 880 aa  1183    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  58.92 
 
 		 833 aa  956    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  58.84 
 
 		 848 aa  986    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  94.74 
 
 		 897 aa  1722    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  72 
 
 		 894 aa  1249    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  54.78 
 
 		 827 aa  891    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  72.97 
 
 		 877 aa  1303    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  59.75 
 
 		 843 aa  980    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  69.66 
 
 		 838 aa  1202    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  70.91 
 
 		 838 aa  1238    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  93.1 
 
 		 899 aa  1690    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1787  ABC transporter related  55.14 
 
 		 845 aa  880    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184754  normal  0.778498 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  64.29 
 
 		 853 aa  1127    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  65.76 
 
 		 843 aa  1184    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  67.35 
 
 		 850 aa  1168    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  69.23 
 
 		 838 aa  1223    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  58.84 
 
 		 848 aa  984    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  62.93 
 
 		 822 aa  1092    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  55.76 
 
 		 863 aa  930    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  54.79 
 
 		 776 aa  860    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  59.85 
 
 		 860 aa  1006    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  86.29 
 
 		 885 aa  1539    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  72.43 
 
 		 898 aa  1243    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  58.84 
 
 		 848 aa  984    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  56.61 
 
 		 851 aa  937    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2123  excinuclease ABC, A subunit  70.94 
 
 		 944 aa  1183    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429692 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  71.51 
 
 		 881 aa  1241    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  40.96 
 
 		 939 aa  570  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  42.28 
 
 		 945 aa  566  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  42.58 
 
 		 968 aa  567  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  40.56 
 
 		 939 aa  567  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  40.82 
 
 		 942 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3137  excinuclease ABC, A subunit  42.15 
 
 		 961 aa  565  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.484359  normal  0.0493947 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  41.42 
 
 		 954 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  41.34 
 
 		 952 aa  563  1.0000000000000001e-159  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  42.49 
 
 		 955 aa  562  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  39.89 
 
 		 958 aa  555  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  39.89 
 
 		 958 aa  555  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  39.89 
 
 		 958 aa  555  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  39.76 
 
 		 958 aa  553  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5328  excinuclease ABC subunit A  39.76 
 
 		 958 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  39.89 
 
 		 958 aa  555  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  43.32 
 
 		 971 aa  554  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5251  excinuclease ABC subunit A  39.89 
 
 		 958 aa  555  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1722  excinuclease ABC subunit A  41.68 
 
 		 941 aa  553  1e-156  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10450  Excinuclease ABC subunit A  41.6 
 
 		 960 aa  555  1e-156  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0436929  hitchhiker  0.0000000651145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5285  excinuclease ABC subunit A  39.76 
 
 		 958 aa  553  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5672  excinuclease ABC subunit A  39.63 
 
 		 958 aa  550  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4958  excinuclease ABC subunit A  39.63 
 
 		 959 aa  551  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0384  excinuclease ABC subunit A  40.99 
 
 		 954 aa  549  1e-155  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000942847  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  41.3 
 
 		 946 aa  546  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3709  excinuclease ABC subunit A  40.43 
 
 		 956 aa  548  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  40.08 
 
 		 987 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0168  excinuclease ABC subunit A  38.93 
 
 		 921 aa  545  1e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1542  excinuclease ABC, A subunit  42.38 
 
 		 965 aa  543  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.464882  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  40.16 
 
 		 942 aa  546  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  40.29 
 
 		 987 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1422  excinuclease ABC, A subunit  42.06 
 
 		 963 aa  545  1e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0151035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0800  excinuclease ABC subunit A  40.35 
 
 		 948 aa  541  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0783  excinuclease ABC subunit A  40.35 
 
 		 948 aa  541  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.686779  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1251  excinuclease ABC subunit A  42.02 
 
 		 971 aa  540  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  38.8 
 
 		 927 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3003  excinuclease ABC subunit A  42.93 
 
 		 973 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.855569  normal  0.034696 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2422  excinuclease ABC, A subunit  42.42 
 
 		 952 aa  540  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5483  excinuclease ABC subunit A  42.29 
 
 		 954 aa  542  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118727  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  41.23 
 
 		 963 aa  541  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11654  excinuclease ABC subunit A  42.38 
 
 		 972 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550141 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  42.93 
 
 		 973 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2016  excinuclease ABC subunit A  41.36 
 
 		 923 aa  541  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  41.47 
 
 		 956 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  42.93 
 
 		 973 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  43.06 
 
 		 967 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  41.48 
 
 		 957 aa  538  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25750  excinuclease ABC subunit A  41.55 
 
 		 953 aa  536  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1631  excinuclease ABC subunit A  41.36 
 
 		 976 aa  538  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.978501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  38.55 
 
 		 941 aa  536  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2940  excinuclease ABC subunit A  42.4 
 
 		 995 aa  539  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2191  excinuclease ABC, A subunit  41.59 
 
 		 946 aa  539  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3018  excinuclease ABC, A subunit  41.98 
 
 		 948 aa  537  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244171  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1317  excinuclease ATPase subunit  40.75 
 
 		 953 aa  536  1e-151  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.133455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  41.14 
 
 		 946 aa  537  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1893  excinuclease ABC, A subunit  39.19 
 
 		 945 aa  537  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0808708  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0143  excinuclease ABC, A subunit  39.26 
 
 		 1942 aa  533  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2057  excinuclease ABC subunit A  41.68 
 
 		 965 aa  536  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1820  excinuclease ABC subunit A  41.18 
 
 		 973 aa  533  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137397 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2009  excinuclease ABC subunit A  40.47 
 
 		 943 aa  533  1e-150  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.407568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6045  excinuclease ABC subunit A  41.01 
 
 		 946 aa  534  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.834052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4379  excinuclease ABC, A subunit  39.34 
 
 		 962 aa  534  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3548  excinuclease ABC subunit A  42.27 
 
 		 967 aa  531  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658203  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  41.94 
 
 		 946 aa  530  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  40.28 
 
 		 1019 aa  532  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>