More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2219 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1706  ABC transporter related protein  78.16 
 
 		 795 aa  1236    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5845  ABC transporter related  50.83 
 
 		 790 aa  729    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1716  ABC transporter related  49.48 
 
 		 745 aa  754    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0595  daunorubicin resistance protein DrrC, putative  42.13 
 
 		 752 aa  651    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0588759  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3040  ABC transporter related  44.49 
 
 		 754 aa  655    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2761  ABC transporter related protein  48.13 
 
 		 752 aa  708    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1980  ABC transporter related  48.47 
 
 		 753 aa  757    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0108  ABC transporter related  74.05 
 
 		 796 aa  1208    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6204  nogalamycin resistance protein SnorO  49.16 
 
 		 750 aa  731    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7895  excinuclease ABC subunit A  77.27 
 
 		 768 aa  1218    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2348  ABC transporter-like protein  77.59 
 
 		 790 aa  1261    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.86691  normal  0.591253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1474  ABC transporter related  51.16 
 
 		 758 aa  745    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.891231  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5797  ABC transporter related protein  50 
 
 		 780 aa  749    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0852128  normal  0.68212 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1801  ABC transporter related  47.81 
 
 		 745 aa  751    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.344909  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2501  ABC transporter related protein  78.87 
 
 		 805 aa  1277    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1659  ABC transporter related protein  76.95 
 
 		 792 aa  1256    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.818321  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0491  ABC transporter related protein  79.03 
 
 		 794 aa  1283    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544871  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3727  ABC transporter related  76.47 
 
 		 810 aa  1246    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2621  ABC transporter related  77.09 
 
 		 826 aa  1206    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.12429 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28420  Excinuclease ATPase subunit  75.41 
 
 		 799 aa  1212    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4179  ABC transporter related  78.8 
 
 		 795 aa  1238    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706824  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3212  ABC transporter related protein  78.33 
 
 		 790 aa  1267    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125335  hitchhiker  0.000000125221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1738  ABC transporter related  78.83 
 
 		 793 aa  1241    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3170  ABC transporter related  75.99 
 
 		 801 aa  1204    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2478  ABC transporter related  76.21 
 
 		 797 aa  1230    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.704947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0889  excinuclease ATPase subunit  44.19 
 
 		 760 aa  671    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.470006  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1286  ABC transporter related protein  75.96 
 
 		 827 aa  1209    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19653  hitchhiker  0.00243826 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2061  ABC transporter related protein  63.75 
 
 		 756 aa  969    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2199  ABC transporter related  77.17 
 
 		 794 aa  1241    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424891  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0097  ABC transporter related  71.34 
 
 		 792 aa  1156    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73348  normal  0.128909 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2074  ABC transporter related  68.61 
 
 		 798 aa  1118    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012346  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2679  ABC transporter related  75.74 
 
 		 795 aa  1214    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.249669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1785  ABC transporter related  78.83 
 
 		 793 aa  1241    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.806156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3006  ABC transporter-related protein  75.92 
 
 		 792 aa  1212    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320548  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1327  ABC transporter related  50.19 
 
 		 751 aa  781    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0264  ABC transporter related  44.25 
 
 		 761 aa  651    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01950  Excinuclease ATPase subunit  57.25 
 
 		 798 aa  908    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1600  ABC transporter related protein  74.11 
 
 		 798 aa  1176    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.239381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1717  ABC transporter related  78.83 
 
 		 793 aa  1242    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3531  ABC transporter related  65.55 
 
 		 754 aa  1037    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114059  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18400  Excinuclease ATPase subunit  74.81 
 
 		 795 aa  1203    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3201  ABC transporter related protein  79.56 
 
 		 790 aa  1236    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0977104  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2335  ABC transporter related  75 
 
 		 797 aa  1223    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0125219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2219  ABC transporter related protein  100 
 
 		 788 aa  1602    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0057  ABC transporter related  75.96 
 
 		 797 aa  1220    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0413721  normal  0.79813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2899  ABC transporter related  80.08 
 
 		 796 aa  1251    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000977115  hitchhiker  0.0000331786 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1760  ABC transporter related protein  68.7 
 
 		 799 aa  1083    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0727  ABC transporter related protein  47.82 
 
 		 752 aa  655    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1999  ABC transporter related  44.1 
 
 		 761 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3513  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 752 aa  616  1e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0485409  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0885  excinuclease ATPase subunit  41.18 
 
 		 750 aa  591  1e-167  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.987216  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1560  putative excision nuclease ABC subunit  66.58 
 
 		 402 aa  538  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.228081  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  36.54 
 
 		 850 aa  482  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  35.71 
 
 		 843 aa  482  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  36.06 
 
 		 820 aa  478  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  35.71 
 
 		 823 aa  472  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  34.8 
 
 		 877 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  36.36 
 
 		 827 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  36.1 
 
 		 861 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  36.41 
 
 		 844 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  37.04 
 
 		 848 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  35.13 
 
 		 838 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  35.6 
 
 		 838 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  37.04 
 
 		 848 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  35.48 
 
 		 838 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  36.81 
 
 		 848 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  40.06 
 
 		 927 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  35.96 
 
 		 843 aa  452  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  35.84 
 
 		 860 aa  449  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  40.86 
 
 		 946 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  40.68 
 
 		 963 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  35.27 
 
 		 853 aa  444  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  38.7 
 
 		 947 aa  444  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  38.4 
 
 		 776 aa  446  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  40.41 
 
 		 945 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  33.33 
 
 		 897 aa  438  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  34.35 
 
 		 834 aa  437  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  35.18 
 
 		 822 aa  437  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5616  excinuclease ABC subunit A  42.17 
 
 		 1052 aa  439  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.239226 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1187  excinuclease ABC, A subunit  39 
 
 		 965 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0037  excinuclease ABC subunit A  38.84 
 
 		 920 aa  433  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  37.46 
 
 		 939 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1104  excinuclease ABC subunit A  38.12 
 
 		 939 aa  433  1e-120  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  36.2 
 
 		 863 aa  435  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  35.13 
 
 		 838 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  35.06 
 
 		 894 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  35.33 
 
 		 950 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1256  excinuclease ABC, A subunit  39 
 
 		 966 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145328  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  39.24 
 
 		 1019 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0314  excinuclease ABC, A subunit  37.24 
 
 		 988 aa  430  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634429  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  38.82 
 
 		 968 aa  427  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0087  excinuclease ABC, A subunit  38.85 
 
 		 937 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141309  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  37.41 
 
 		 942 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  37.17 
 
 		 939 aa  428  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  37.89 
 
 		 942 aa  427  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  40.35 
 
 		 947 aa  427  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1893  excinuclease ABC, A subunit  37.52 
 
 		 945 aa  429  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0808708  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04893  excinuclease ABC subunit A  37.21 
 
 		 988 aa  426  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000582008  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  37.74 
 
 		 944 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1263  excinuclease ABC, A subunit  36.38 
 
 		 987 aa  423  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.185131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>