More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0866 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  56.61 
 
 		 863 aa  917    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2009  excinuclease ABC, A subunit  59.82 
 
 		 880 aa  1001    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  63.25 
 
 		 838 aa  1086    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  60.86 
 
 		 898 aa  1048    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  60.23 
 
 		 894 aa  1048    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1787  ABC transporter related  54.59 
 
 		 845 aa  842    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184754  normal  0.778498 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  62.85 
 
 		 897 aa  1121    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  56.48 
 
 		 843 aa  922    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  59.73 
 
 		 898 aa  1050    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  61.99 
 
 		 877 aa  1078    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  63.37 
 
 		 838 aa  1088    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  69.42 
 
 		 843 aa  1184    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  55.77 
 
 		 880 aa  920    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05010  Excinuclease ATPase subunit  46.98 
 
 		 875 aa  684    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  63.59 
 
 		 885 aa  1099    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  60.74 
 
 		 899 aa  1031    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  64.29 
 
 		 950 aa  1127    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  64.68 
 
 		 899 aa  1131    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  64.76 
 
 		 861 aa  1100    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  56.93 
 
 		 776 aa  872    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  100 
 
 		 853 aa  1753    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  65.82 
 
 		 844 aa  1104    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  66.39 
 
 		 850 aa  1127    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  56.58 
 
 		 848 aa  939    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  78.44 
 
 		 822 aa  1350    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  66.3 
 
 		 832 aa  1080    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  57.31 
 
 		 833 aa  916    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  62.77 
 
 		 838 aa  1056    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  57.46 
 
 		 860 aa  953    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  64.29 
 
 		 838 aa  1099    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  60.02 
 
 		 834 aa  1043    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  57.13 
 
 		 848 aa  944    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  54.33 
 
 		 827 aa  862    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  56.58 
 
 		 848 aa  939    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  58.08 
 
 		 851 aa  911    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2123  excinuclease ABC, A subunit  59.75 
 
 		 944 aa  1006    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429692 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  61.95 
 
 		 881 aa  1051    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  47.44 
 
 		 945 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2191  excinuclease ABC, A subunit  47.1 
 
 		 946 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3137  excinuclease ABC, A subunit  45.47 
 
 		 961 aa  602  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.484359  normal  0.0493947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  46.82 
 
 		 946 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3003  excinuclease ABC subunit A  47.5 
 
 		 973 aa  598  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.855569  normal  0.034696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  47.5 
 
 		 973 aa  598  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  47.5 
 
 		 973 aa  598  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  43.08 
 
 		 968 aa  593  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3548  excinuclease ABC subunit A  46.95 
 
 		 967 aa  592  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658203  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  45.47 
 
 		 1019 aa  590  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  46.58 
 
 		 967 aa  590  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25750  excinuclease ABC subunit A  46.59 
 
 		 953 aa  587  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1542  excinuclease ABC, A subunit  45.82 
 
 		 965 aa  588  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.464882  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11654  excinuclease ABC subunit A  46.56 
 
 		 972 aa  588  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550141 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  45.6 
 
 		 954 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2940  excinuclease ABC subunit A  46.09 
 
 		 995 aa  585  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1251  excinuclease ABC subunit A  45.95 
 
 		 971 aa  583  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2178  excinuclease ABC subunit A  45.2 
 
 		 965 aa  585  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2422  excinuclease ABC, A subunit  45.23 
 
 		 952 aa  580  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  44.68 
 
 		 963 aa  582  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3018  excinuclease ABC, A subunit  46.45 
 
 		 948 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244171  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1949  excinuclease ABC, A subunit  45.53 
 
 		 957 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0876147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5483  excinuclease ABC subunit A  45.14 
 
 		 954 aa  576  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118727  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  41.45 
 
 		 987 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  44.38 
 
 		 987 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2851  excinuclease ABC, A subunit  44.81 
 
 		 960 aa  575  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.149004  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20120  Excinuclease ABC subunit A  45.45 
 
 		 982 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.578838  normal  0.503443 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  43.3 
 
 		 927 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  44.82 
 
 		 955 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0816  excinuclease ABC, A subunit  43.47 
 
 		 983 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2079  excinuclease ABC subunit A  45.14 
 
 		 975 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.224045  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  44.82 
 
 		 947 aa  575  1.0000000000000001e-162  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15150  Excinuclease ABC subunit A  44.48 
 
 		 958 aa  569  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096343  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1820  excinuclease ABC subunit A  45.42 
 
 		 973 aa  572  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1631  excinuclease ABC subunit A  45.11 
 
 		 976 aa  570  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.978501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2057  excinuclease ABC subunit A  45.25 
 
 		 965 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  43.94 
 
 		 952 aa  570  1e-161  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2992  excinuclease ABC, A subunit  44.99 
 
 		 1055 aa  571  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00155304  hitchhiker  0.00399188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6045  excinuclease ABC subunit A  45.53 
 
 		 946 aa  570  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.834052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11280  excinuclease ABC subunit A  44.71 
 
 		 994 aa  566  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.259511  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  43.53 
 
 		 942 aa  567  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0783  excinuclease ABC subunit A  44.38 
 
 		 948 aa  565  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.686779  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  41.85 
 
 		 939 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5616  excinuclease ABC subunit A  45.02 
 
 		 1052 aa  562  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.239226 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0800  excinuclease ABC subunit A  44.38 
 
 		 948 aa  565  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  44.46 
 
 		 946 aa  562  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  44.81 
 
 		 947 aa  560  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  40.02 
 
 		 946 aa  561  1e-158  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1406  excinuclease ABC, A subunit  44.4 
 
 		 935 aa  559  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  43.86 
 
 		 956 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  42.33 
 
 		 942 aa  559  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0206  excinuclease ABC, A subunit  43.1 
 
 		 947 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000261219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2016  excinuclease ABC subunit A  44.95 
 
 		 923 aa  560  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  41.57 
 
 		 939 aa  562  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0189  excinuclease ABC, A subunit  42.96 
 
 		 947 aa  560  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0119000000000001e-25 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  46.79 
 
 		 916 aa  560  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  42.84 
 
 		 958 aa  555  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0384  excinuclease ABC subunit A  44.22 
 
 		 954 aa  556  1e-157  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000942847  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0311  excinuclease ABC subunit A  43.5 
 
 		 942 aa  556  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00463978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  42.84 
 
 		 944 aa  555  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0455  excinuclease ABC subunit A  47.08 
 
 		 916 aa  558  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0811639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3709  excinuclease ABC subunit A  42.53 
 
 		 956 aa  558  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  42.7 
 
 		 958 aa  555  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>