More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0889 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6204  nogalamycin resistance protein SnorO  45.82 
 
 
750 aa  705    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.846667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3727  ABC transporter related  43.77 
 
 
810 aa  675    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2478  ABC transporter related  43.43 
 
 
797 aa  657    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.704947  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1286  ABC transporter related protein  43.61 
 
 
827 aa  666    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19653  hitchhiker  0.00243826 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0595  daunorubicin resistance protein DrrC, putative  46.67 
 
 
752 aa  701    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0588759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0491  ABC transporter related protein  44.52 
 
 
794 aa  694    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544871  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0097  ABC transporter related  43.57 
 
 
792 aa  670    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73348  normal  0.128909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3212  ABC transporter related protein  45.03 
 
 
790 aa  696    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125335  hitchhiker  0.000000125221 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2219  ABC transporter related protein  44.19 
 
 
788 aa  669    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2501  ABC transporter related protein  43.73 
 
 
805 aa  679    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3531  ABC transporter related  45.99 
 
 
754 aa  697    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114059  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1600  ABC transporter related protein  43.43 
 
 
798 aa  652    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.239381 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0108  ABC transporter related  44.07 
 
 
796 aa  691    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0727  ABC transporter related protein  44.61 
 
 
752 aa  677    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2348  ABC transporter-like protein  45.41 
 
 
790 aa  702    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.86691  normal  0.591253 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3201  ABC transporter related protein  43.17 
 
 
790 aa  644    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0977104  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3040  ABC transporter related  45.45 
 
 
754 aa  682    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1659  ABC transporter related protein  44.85 
 
 
792 aa  696    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.818321  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2335  ABC transporter related  42.91 
 
 
797 aa  648    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0125219 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3513  ABC transporter related protein  46.53 
 
 
752 aa  661    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0485409  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2899  ABC transporter related  45.09 
 
 
796 aa  670    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000977115  hitchhiker  0.0000331786 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2621  ABC transporter related  43.97 
 
 
826 aa  655    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.12429 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1980  ABC transporter related  48.61 
 
 
753 aa  754    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5797  ABC transporter related protein  42.93 
 
 
780 aa  647    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0852128  normal  0.68212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0057  ABC transporter related  42.93 
 
 
797 aa  655    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0413721  normal  0.79813 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1760  ABC transporter related protein  44.99 
 
 
799 aa  674    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144756  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1738  ABC transporter related  44.14 
 
 
793 aa  660    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2074  ABC transporter related  43.21 
 
 
798 aa  678    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012346  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18400  Excinuclease ATPase subunit  43.37 
 
 
795 aa  669    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28420  Excinuclease ATPase subunit  44.17 
 
 
799 aa  662    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2761  ABC transporter related protein  44.87 
 
 
752 aa  687    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1999  ABC transporter related  47.75 
 
 
761 aa  700    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0889  excinuclease ATPase subunit  100 
 
 
760 aa  1568    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.470006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0885  excinuclease ATPase subunit  51.37 
 
 
750 aa  775    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.987216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4179  ABC transporter related  44.44 
 
 
795 aa  657    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706824  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1706  ABC transporter related protein  44.65 
 
 
795 aa  667    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2199  ABC transporter related  44.33 
 
 
794 aa  681    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424891  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7895  excinuclease ABC subunit A  45.61 
 
 
768 aa  688    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0264  ABC transporter related  47.26 
 
 
761 aa  704    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1716  ABC transporter related  46.73 
 
 
745 aa  716    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1801  ABC transporter related  46.08 
 
 
745 aa  703    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.344909  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2679  ABC transporter related  44.77 
 
 
795 aa  691    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.249669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1785  ABC transporter related  44.14 
 
 
793 aa  660    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.806156  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1327  ABC transporter related  46.46 
 
 
751 aa  720    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3006  ABC transporter-related protein  44.12 
 
 
792 aa  673    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320548  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1474  ABC transporter related  48.07 
 
 
758 aa  728    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.891231  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2061  ABC transporter related protein  46.26 
 
 
756 aa  678    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5845  ABC transporter related  42.44 
 
 
790 aa  638    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1717  ABC transporter related  43.89 
 
 
793 aa  655    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3170  ABC transporter related  44.77 
 
 
801 aa  665    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102444 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01950  Excinuclease ATPase subunit  41.67 
 
 
798 aa  634  1e-180  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  35.2 
 
 
838 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  34.93 
 
 
838 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  35.53 
 
 
843 aa  485  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  34.67 
 
 
838 aa  482  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  33.79 
 
 
877 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  34.05 
 
 
850 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  35.29 
 
 
838 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  33.81 
 
 
844 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  34.62 
 
 
853 aa  464  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  33.45 
 
 
894 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  35.27 
 
 
832 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  38.82 
 
 
939 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  38.82 
 
 
939 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  34.23 
 
 
822 aa  451  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  33.65 
 
 
848 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  34 
 
 
820 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  33.65 
 
 
848 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  33.77 
 
 
848 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  33.89 
 
 
834 aa  444  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  32.06 
 
 
861 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  33.9 
 
 
827 aa  445  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1834  excinuclease ABC, A subunit  37.96 
 
 
941 aa  441  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  33.93 
 
 
823 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  32.97 
 
 
843 aa  436  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  36.52 
 
 
968 aa  437  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  37.9 
 
 
931 aa  436  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0311  excinuclease ABC subunit A  38.91 
 
 
942 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00463978  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  38.27 
 
 
916 aa  435  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  38.37 
 
 
945 aa  434  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16220  excinuclease ABC, A subunit  37.17 
 
 
941 aa  434  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266346  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0800  excinuclease ABC subunit A  37.23 
 
 
948 aa  433  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0495  excinuclease ABC, A subunit  37.03 
 
 
952 aa  434  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204806  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  32.71 
 
 
860 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0783  excinuclease ABC subunit A  37.23 
 
 
948 aa  433  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.686779  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  37.32 
 
 
957 aa  429  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  37.85 
 
 
942 aa  429  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  36.19 
 
 
947 aa  430  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  31.93 
 
 
898 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1322  excinuclease ABC, A subunit  35.96 
 
 
934 aa  431  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0124703  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3137  excinuclease ABC, A subunit  37.35 
 
 
961 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.484359  normal  0.0493947 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0427  excinuclease ABC subunit A  37.54 
 
 
944 aa  427  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0384  excinuclease ABC subunit A  37.35 
 
 
954 aa  429  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000942847  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  36.9 
 
 
1008 aa  426  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0455  excinuclease ABC subunit A  37.74 
 
 
916 aa  429  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0811639  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  36.25 
 
 
954 aa  429  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0120  excinuclease ABC subunit A  37.43 
 
 
948 aa  427  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.973474  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2732  excinuclease ABC, A subunit  37.7 
 
 
962 aa  429  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.102392  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  32.26 
 
 
898 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  36.47 
 
 
963 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>