More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6320 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  69.2 
 
 		 838 aa  1206    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  69.92 
 
 		 838 aa  1213    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  72.14 
 
 		 898 aa  1228    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  65.39 
 
 		 832 aa  1105    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  85.25 
 
 		 897 aa  1544    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  68.04 
 
 		 838 aa  1164    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  71.87 
 
 		 877 aa  1278    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  63.71 
 
 		 844 aa  1127    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2009  excinuclease ABC, A subunit  69.94 
 
 		 880 aa  1162    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  53.8 
 
 		 834 aa  937    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  71.51 
 
 		 894 aa  1224    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  57.98 
 
 		 843 aa  963    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1787  ABC transporter related  53.68 
 
 		 845 aa  854    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184754  normal  0.778498 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  71.36 
 
 		 899 aa  1222    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  86.29 
 
 		 950 aa  1558    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  55.28 
 
 		 863 aa  890    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  100 
 
 		 885 aa  1807    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  86.41 
 
 		 899 aa  1574    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  53.7 
 
 		 776 aa  845    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  63.59 
 
 		 853 aa  1120    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  59.31 
 
 		 833 aa  963    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  67.17 
 
 		 850 aa  1150    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  54.35 
 
 		 827 aa  880    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  58.35 
 
 		 848 aa  981    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  63.23 
 
 		 822 aa  1097    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  55.6 
 
 		 880 aa  922    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  58 
 
 		 860 aa  976    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  58.47 
 
 		 848 aa  983    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  72.49 
 
 		 898 aa  1248    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  65.94 
 
 		 861 aa  1148    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  67.05 
 
 		 843 aa  1188    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  58.35 
 
 		 848 aa  981    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  56.4 
 
 		 851 aa  911    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2123  excinuclease ABC, A subunit  70.74 
 
 		 944 aa  1169    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429692 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  70.93 
 
 		 881 aa  1220    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  69.05 
 
 		 838 aa  1198    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  42.67 
 
 		 945 aa  570  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  41.04 
 
 		 939 aa  568  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  40.78 
 
 		 939 aa  566  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10450  Excinuclease ABC subunit A  41.06 
 
 		 960 aa  563  1.0000000000000001e-159  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0436929  hitchhiker  0.0000000651145 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  40.45 
 
 		 942 aa  560  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  41.68 
 
 		 968 aa  557  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3137  excinuclease ABC, A subunit  41.04 
 
 		 961 aa  554  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.484359  normal  0.0493947 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1422  excinuclease ABC, A subunit  40.84 
 
 		 963 aa  550  1e-155  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0151035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  41.42 
 
 		 947 aa  546  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  40.35 
 
 		 952 aa  546  1e-154  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  41.36 
 
 		 946 aa  543  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  40.27 
 
 		 954 aa  545  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2191  excinuclease ABC, A subunit  42.54 
 
 		 946 aa  545  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  39.97 
 
 		 942 aa  545  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  39.54 
 
 		 927 aa  544  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2178  excinuclease ABC subunit A  41.71 
 
 		 965 aa  540  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3018  excinuclease ABC, A subunit  42.15 
 
 		 948 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244171  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  41.1 
 
 		 987 aa  540  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  42.9 
 
 		 973 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1722  excinuclease ABC subunit A  41.46 
 
 		 941 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3003  excinuclease ABC subunit A  42.76 
 
 		 973 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.855569  normal  0.034696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  42.9 
 
 		 973 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1834  excinuclease ABC, A subunit  38.86 
 
 		 941 aa  538  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3709  excinuclease ABC subunit A  39.41 
 
 		 956 aa  536  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0168  excinuclease ABC subunit A  38.83 
 
 		 921 aa  539  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  42.57 
 
 		 971 aa  537  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  40.97 
 
 		 987 aa  538  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2016  excinuclease ABC subunit A  40.72 
 
 		 923 aa  538  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1893  excinuclease ABC, A subunit  38.89 
 
 		 945 aa  538  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0808708  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25750  excinuclease ABC subunit A  41.08 
 
 		 953 aa  535  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  40.13 
 
 		 955 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6045  excinuclease ABC subunit A  41.5 
 
 		 946 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.834052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1631  excinuclease ABC subunit A  41.66 
 
 		 976 aa  533  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.978501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2940  excinuclease ABC subunit A  42.15 
 
 		 995 aa  533  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  40.92 
 
 		 964 aa  533  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  41.77 
 
 		 947 aa  533  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  38.66 
 
 		 958 aa  532  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  38.66 
 
 		 958 aa  531  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  38.52 
 
 		 958 aa  531  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  38.52 
 
 		 958 aa  530  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11654  excinuclease ABC subunit A  42.06 
 
 		 972 aa  531  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550141 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5251  excinuclease ABC subunit A  38.66 
 
 		 958 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  38.66 
 
 		 958 aa  531  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0572  excinuclease ABC, A subunit  42.67 
 
 		 976 aa  531  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.114911  normal  0.199492 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  38.87 
 
 		 944 aa  532  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  40.45 
 
 		 957 aa  531  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5328  excinuclease ABC subunit A  38.52 
 
 		 958 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1317  excinuclease ATPase subunit  40.4 
 
 		 953 aa  531  1e-149  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.133455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5483  excinuclease ABC subunit A  40.8 
 
 		 954 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118727  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  40.34 
 
 		 1019 aa  531  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  42.32 
 
 		 967 aa  531  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  41.05 
 
 		 946 aa  530  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  41.42 
 
 		 963 aa  528  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5672  excinuclease ABC subunit A  38.39 
 
 		 958 aa  527  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3548  excinuclease ABC subunit A  41.79 
 
 		 967 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658203  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1820  excinuclease ABC subunit A  40.86 
 
 		 973 aa  526  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137397 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11280  excinuclease ABC subunit A  41.41 
 
 		 994 aa  527  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.259511  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0816  excinuclease ABC, A subunit  39.73 
 
 		 983 aa  527  1e-148  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3848  excinuclease ABC, A subunit  42.88 
 
 		 975 aa  526  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00424286  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0694  excinuclease ABC subunit A  41.01 
 
 		 1004 aa  527  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.641362 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4958  excinuclease ABC subunit A  38.52 
 
 		 959 aa  528  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5285  excinuclease ABC subunit A  38.52 
 
 		 958 aa  529  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2009  excinuclease ABC subunit A  40.69 
 
 		 943 aa  529  1e-148  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.407568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  39.97 
 
 		 956 aa  528  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>