More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19620 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  57.18 
 
 		 843 aa  952    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  59.05 
 
 		 838 aa  972    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  59.86 
 
 		 838 aa  973    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  55.28 
 
 		 885 aa  892    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1787  ABC transporter related  61.38 
 
 		 845 aa  924    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184754  normal  0.778498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  56.52 
 
 		 898 aa  908    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  55.79 
 
 		 894 aa  898    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  62.7 
 
 		 880 aa  991    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  65.06 
 
 		 848 aa  1060    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  55.27 
 
 		 897 aa  936    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  57.29 
 
 		 832 aa  937    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  55.76 
 
 		 950 aa  946    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  56.76 
 
 		 877 aa  950    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  100 
 
 		 863 aa  1723    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  56.29 
 
 		 898 aa  907    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  58.72 
 
 		 838 aa  944    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  56.84 
 
 		 776 aa  843    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  49.77 
 
 		 834 aa  818    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  55.7 
 
 		 899 aa  884    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  59.43 
 
 		 827 aa  939    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  55.59 
 
 		 899 aa  937    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  56.61 
 
 		 853 aa  935    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  59.17 
 
 		 838 aa  970    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  73 
 
 		 843 aa  1218    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  57.09 
 
 		 850 aa  951    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05010  Excinuclease ATPase subunit  53.36 
 
 		 875 aa  766    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  57.03 
 
 		 844 aa  946    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  64.94 
 
 		 848 aa  1055    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  56.07 
 
 		 822 aa  921    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  65.96 
 
 		 833 aa  1065    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  72.82 
 
 		 860 aa  1238    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2009  excinuclease ABC, A subunit  53.95 
 
 		 880 aa  835    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  64.94 
 
 		 848 aa  1055    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  66.9 
 
 		 851 aa  1093    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2123  excinuclease ABC, A subunit  56.97 
 
 		 944 aa  903    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429692 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  55.67 
 
 		 881 aa  912    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  57.24 
 
 		 861 aa  942    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  46.29 
 
 		 968 aa  600  1e-170  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  45.36 
 
 		 987 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  45.36 
 
 		 987 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3137  excinuclease ABC, A subunit  44.43 
 
 		 961 aa  582  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.484359  normal  0.0493947 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  44.34 
 
 		 945 aa  581  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2851  excinuclease ABC, A subunit  44.56 
 
 		 960 aa  580  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.149004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  44.15 
 
 		 967 aa  579  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3003  excinuclease ABC subunit A  43.76 
 
 		 973 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.855569  normal  0.034696 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11654  excinuclease ABC subunit A  44.27 
 
 		 972 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550141 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2178  excinuclease ABC subunit A  45.5 
 
 		 965 aa  578  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  43.89 
 
 		 973 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6045  excinuclease ABC subunit A  44.81 
 
 		 946 aa  578  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.834052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  43.89 
 
 		 973 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  44.22 
 
 		 946 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3548  excinuclease ABC subunit A  43.54 
 
 		 967 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658203  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  41.32 
 
 		 939 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  44.23 
 
 		 947 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  43.45 
 
 		 1019 aa  575  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2422  excinuclease ABC, A subunit  44.27 
 
 		 952 aa  572  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1949  excinuclease ABC, A subunit  45.26 
 
 		 957 aa  570  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0876147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  40.91 
 
 		 939 aa  570  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0816  excinuclease ABC, A subunit  41.89 
 
 		 983 aa  570  1e-161  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2057  excinuclease ABC subunit A  44.9 
 
 		 965 aa  567  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20120  Excinuclease ABC subunit A  44.52 
 
 		 982 aa  568  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.578838  normal  0.503443 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1542  excinuclease ABC, A subunit  44.28 
 
 		 965 aa  567  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.464882  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1820  excinuclease ABC subunit A  43.84 
 
 		 973 aa  562  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2191  excinuclease ABC, A subunit  44.38 
 
 		 946 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11280  excinuclease ABC subunit A  44.65 
 
 		 994 aa  565  1.0000000000000001e-159  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.259511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  41.9 
 
 		 954 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2079  excinuclease ABC subunit A  43.64 
 
 		 975 aa  565  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.224045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5483  excinuclease ABC subunit A  44.93 
 
 		 954 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118727  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  44.09 
 
 		 963 aa  560  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25750  excinuclease ABC subunit A  43.81 
 
 		 953 aa  559  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2940  excinuclease ABC subunit A  43.78 
 
 		 995 aa  561  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  41.68 
 
 		 942 aa  559  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0572  excinuclease ABC, A subunit  44.41 
 
 		 976 aa  558  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.114911  normal  0.199492 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  40.16 
 
 		 927 aa  555  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3018  excinuclease ABC, A subunit  44.54 
 
 		 948 aa  552  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244171  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1631  excinuclease ABC subunit A  45.18 
 
 		 976 aa  553  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.978501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  42.17 
 
 		 955 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  42.8 
 
 		 957 aa  553  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0260  excinuclease ABC, A subunit  40.39 
 
 		 947 aa  551  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0669187  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0427  excinuclease ABC subunit A  42.18 
 
 		 1011 aa  550  1e-155  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659788  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  40.52 
 
 		 944 aa  551  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2585  excinuclease ABC subunit A  42.71 
 
 		 979 aa  552  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.771268  normal  0.888283 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2823  excinuclease ABC, A subunit  41.82 
 
 		 980 aa  551  1e-155  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179729  normal  0.122251 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  40.4 
 
 		 952 aa  551  1e-155  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0521  excinuclease ABC, A subunit  42.06 
 
 		 948 aa  546  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.276548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1251  excinuclease ABC subunit A  42.76 
 
 		 971 aa  547  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  40.22 
 
 		 942 aa  547  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  43.93 
 
 		 971 aa  547  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10450  Excinuclease ABC subunit A  42.52 
 
 		 960 aa  546  1e-154  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0436929  hitchhiker  0.0000000651145 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18501  excinuclease ABC subunit A  40.19 
 
 		 979 aa  548  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95453  normal  0.0541711 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1422  excinuclease ABC, A subunit  42.47 
 
 		 963 aa  546  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0151035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1104  excinuclease ABC subunit A  38.81 
 
 		 939 aa  543  1e-153  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3956  excinuclease ABC, A subunit  42.52 
 
 		 963 aa  545  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000293672  hitchhiker  0.00020375 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15150  Excinuclease ABC subunit A  42.99 
 
 		 958 aa  541  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096343  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  40.16 
 
 		 958 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5616  excinuclease ABC subunit A  43.01 
 
 		 1052 aa  542  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.239226 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  40.66 
 
 		 941 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2992  excinuclease ABC, A subunit  43.98 
 
 		 1055 aa  542  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00155304  hitchhiker  0.00399188 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5251  excinuclease ABC subunit A  40.16 
 
 		 958 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5328  excinuclease ABC subunit A  40.03 
 
 		 958 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>