More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4722 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  64.91 
 
 
898 aa  1129    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  67.11 
 
 
838 aa  1142    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  54.25 
 
 
827 aa  885    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2009  excinuclease ABC, A subunit  60.25 
 
 
880 aa  1004    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  60.93 
 
 
894 aa  1053    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  68.61 
 
 
844 aa  1166    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  65.98 
 
 
897 aa  1155    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  66.01 
 
 
877 aa  1163    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  55.97 
 
 
834 aa  952    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  66.06 
 
 
838 aa  1110    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  68.76 
 
 
832 aa  1137    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  71.17 
 
 
843 aa  1215    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  66.67 
 
 
950 aa  1168    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  67.11 
 
 
838 aa  1142    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  67.07 
 
 
838 aa  1148    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  67.05 
 
 
899 aa  1172    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  64.76 
 
 
853 aa  1100    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  59.71 
 
 
848 aa  991    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  72.55 
 
 
850 aa  1219    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  63.88 
 
 
899 aa  1098    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  64.79 
 
 
898 aa  1126    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  59.59 
 
 
848 aa  989    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  64.42 
 
 
822 aa  1083    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  59.83 
 
 
833 aa  945    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1787  ABC transporter related  54.97 
 
 
845 aa  872    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184754  normal  0.778498 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  100 
 
 
861 aa  1763    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05010  Excinuclease ATPase subunit  48.13 
 
 
875 aa  705    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  65.94 
 
 
885 aa  1127    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  57.06 
 
 
776 aa  872    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  59.86 
 
 
860 aa  988    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  58.71 
 
 
843 aa  972    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  59.59 
 
 
848 aa  989    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  59.18 
 
 
851 aa  941    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  59.04 
 
 
880 aa  964    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2123  excinuclease ABC, A subunit  62.78 
 
 
944 aa  1042    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.429692 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  63.31 
 
 
881 aa  1074    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  57.13 
 
 
863 aa  926    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  43.53 
 
 
968 aa  589  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  43.78 
 
 
946 aa  581  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  41.83 
 
 
942 aa  579  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  41.71 
 
 
939 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  43.99 
 
 
945 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  43.71 
 
 
973 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  41.57 
 
 
939 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  42.48 
 
 
952 aa  572  1.0000000000000001e-162  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3003  excinuclease ABC subunit A  44.11 
 
 
973 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.855569  normal  0.034696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  43.71 
 
 
973 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  42.22 
 
 
954 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0384  excinuclease ABC subunit A  42.02 
 
 
954 aa  571  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000942847  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3137  excinuclease ABC, A subunit  42.6 
 
 
961 aa  571  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.484359  normal  0.0493947 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  42.68 
 
 
955 aa  568  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1422  excinuclease ABC, A subunit  43 
 
 
963 aa  566  1e-160  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0151035  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2191  excinuclease ABC, A subunit  43.02 
 
 
946 aa  566  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6045  excinuclease ABC subunit A  42.22 
 
 
946 aa  562  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.834052  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25750  excinuclease ABC subunit A  43.33 
 
 
953 aa  565  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0260  excinuclease ABC, A subunit  42.62 
 
 
947 aa  565  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0669187  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2851  excinuclease ABC, A subunit  42.93 
 
 
960 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.149004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  43.81 
 
 
967 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  41.26 
 
 
927 aa  561  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  42.86 
 
 
963 aa  559  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2422  excinuclease ABC, A subunit  43.11 
 
 
952 aa  562  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1406  excinuclease ABC, A subunit  42.32 
 
 
935 aa  559  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11654  excinuclease ABC subunit A  43.26 
 
 
972 aa  559  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.550141 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0311  excinuclease ABC subunit A  42.16 
 
 
942 aa  560  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00463978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  40.34 
 
 
942 aa  557  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  43.02 
 
 
947 aa  557  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3709  excinuclease ABC subunit A  40.72 
 
 
956 aa  556  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3548  excinuclease ABC subunit A  43.09 
 
 
967 aa  558  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658203  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10450  Excinuclease ABC subunit A  42.6 
 
 
960 aa  558  1e-157  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0436929  hitchhiker  0.0000000651145 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0783  excinuclease ABC subunit A  40.94 
 
 
948 aa  554  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.686779  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0800  excinuclease ABC subunit A  40.94 
 
 
948 aa  554  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0037  excinuclease ABC subunit A  40.36 
 
 
920 aa  550  1e-155  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0168  excinuclease ABC subunit A  40.14 
 
 
921 aa  552  1e-155  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  41.8 
 
 
956 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0572  excinuclease ABC, A subunit  42.72 
 
 
976 aa  550  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.114911  normal  0.199492 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  39.84 
 
 
958 aa  550  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2178  excinuclease ABC subunit A  42.92 
 
 
965 aa  549  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  39.97 
 
 
958 aa  551  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  39.84 
 
 
958 aa  551  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  40.03 
 
 
958 aa  551  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5285  excinuclease ABC subunit A  39.84 
 
 
958 aa  550  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1834  excinuclease ABC, A subunit  40.66 
 
 
941 aa  550  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  39.97 
 
 
958 aa  551  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0816  excinuclease ABC, A subunit  41.39 
 
 
983 aa  550  1e-155  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3018  excinuclease ABC, A subunit  43.25 
 
 
948 aa  549  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244171  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1542  excinuclease ABC, A subunit  43.95 
 
 
965 aa  551  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.464882  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2940  excinuclease ABC subunit A  43.09 
 
 
995 aa  551  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316727  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5251  excinuclease ABC subunit A  39.97 
 
 
958 aa  551  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1820  excinuclease ABC subunit A  42.37 
 
 
973 aa  549  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137397 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4958  excinuclease ABC subunit A  39.75 
 
 
959 aa  547  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  41 
 
 
987 aa  547  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5328  excinuclease ABC subunit A  39.7 
 
 
958 aa  548  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5672  excinuclease ABC subunit A  39.7 
 
 
958 aa  547  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3848  excinuclease ABC, A subunit  43.27 
 
 
975 aa  548  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00424286  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2016  excinuclease ABC subunit A  42.97 
 
 
923 aa  546  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2079  excinuclease ABC subunit A  41.68 
 
 
975 aa  546  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.224045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5483  excinuclease ABC subunit A  42.78 
 
 
954 aa  548  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118727  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  41.78 
 
 
957 aa  547  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  41.89 
 
 
1008 aa  544  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  40.39 
 
 
941 aa  543  1e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>