More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2085 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  59.62 
 
 		 838 aa  988    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  50.24 
 
 		 834 aa  817    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1787  ABC transporter related  60.74 
 
 		 845 aa  928    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184754  normal  0.778498 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  59.16 
 
 		 776 aa  889    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  59.98 
 
 		 832 aa  935    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  56.57 
 
 		 827 aa  884    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  57.32 
 
 		 897 aa  956    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  60.97 
 
 		 880 aa  981    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  56.05 
 
 		 899 aa  860    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  57.13 
 
 		 877 aa  954    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  56.4 
 
 		 885 aa  924    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  56.18 
 
 		 894 aa  916    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  56.47 
 
 		 898 aa  902    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  59.88 
 
 		 838 aa  994    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  58.98 
 
 		 843 aa  975    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  63.83 
 
 		 848 aa  1013    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  57.86 
 
 		 899 aa  967    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  57.45 
 
 		 844 aa  944    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  58.08 
 
 		 853 aa  937    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2009  excinuclease ABC, A subunit  55.25 
 
 		 880 aa  863    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  61.43 
 
 		 850 aa  994    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  63.47 
 
 		 848 aa  1008    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  56.75 
 
 		 822 aa  914    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  56.61 
 
 		 950 aa  963    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  65.59 
 
 		 833 aa  1023    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05010  Excinuclease ATPase subunit  51.71 
 
 		 875 aa  738    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  72.61 
 
 		 860 aa  1204    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  57.16 
 
 		 898 aa  912    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  59.18 
 
 		 861 aa  973    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  59.1 
 
 		 838 aa  954    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  66.9 
 
 		 863 aa  1103    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  63.47 
 
 		 848 aa  1008    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  100 
 
 		 851 aa  1721    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  69.1 
 
 		 843 aa  1146    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2123  excinuclease ABC, A subunit  56.81 
 
 		 944 aa  897    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429692 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  54.61 
 
 		 881 aa  876    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  59.39 
 
 		 838 aa  976    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  47.56 
 
 		 945 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  46.01 
 
 		 946 aa  589  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  45.58 
 
 		 1019 aa  590  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1422  excinuclease ABC, A subunit  44.96 
 
 		 963 aa  580  1e-164  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0151035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2422  excinuclease ABC, A subunit  45.95 
 
 		 952 aa  582  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2191  excinuclease ABC, A subunit  45.87 
 
 		 946 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  43.98 
 
 		 947 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  45.38 
 
 		 968 aa  578  1.0000000000000001e-163  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10450  Excinuclease ABC subunit A  44.54 
 
 		 960 aa  573  1.0000000000000001e-162  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0436929  hitchhiker  0.0000000651145 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07070  Excinuclease ABC subunit A  44.78 
 
 		 954 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.478607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3548  excinuclease ABC subunit A  45.52 
 
 		 967 aa  572  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658203  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16220  excinuclease ABC, A subunit  42.82 
 
 		 941 aa  570  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266346  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  43.06 
 
 		 942 aa  570  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2851  excinuclease ABC, A subunit  45.35 
 
 		 960 aa  570  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.149004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6045  excinuclease ABC subunit A  44.6 
 
 		 946 aa  569  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.834052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  45.66 
 
 		 967 aa  569  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11654  excinuclease ABC subunit A  44.93 
 
 		 972 aa  570  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  44.14 
 
 		 964 aa  564  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0189  excinuclease ABC, A subunit  42.29 
 
 		 947 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0119000000000001e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  43.2 
 
 		 956 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3137  excinuclease ABC, A subunit  43.97 
 
 		 961 aa  565  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.484359  normal  0.0493947 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0206  excinuclease ABC, A subunit  42.43 
 
 		 947 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000261219  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  44.44 
 
 		 947 aa  565  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1824  excinuclease ABC, A subunit  45.33 
 
 		 945 aa  561  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00152877  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3878  excinuclease ABC subunit A  43.61 
 
 		 946 aa  559  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3956  excinuclease ABC, A subunit  43.81 
 
 		 963 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000293672  hitchhiker  0.00020375 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2426  excinuclease ABC subunit A  45.05 
 
 		 939 aa  561  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  41.3 
 
 		 939 aa  562  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  43.67 
 
 		 987 aa  561  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  42.01 
 
 		 927 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  41.38 
 
 		 942 aa  556  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5483  excinuclease ABC subunit A  45.21 
 
 		 954 aa  558  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118727  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0816  excinuclease ABC, A subunit  43.32 
 
 		 983 aa  558  1e-157  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3003  excinuclease ABC subunit A  44.54 
 
 		 973 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.855569  normal  0.034696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  44.54 
 
 		 973 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  44.85 
 
 		 946 aa  558  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  40.91 
 
 		 939 aa  558  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4379  excinuclease ABC, A subunit  42.49 
 
 		 962 aa  558  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2057  excinuclease ABC subunit A  45.14 
 
 		 965 aa  558  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  44.54 
 
 		 973 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  43.24 
 
 		 944 aa  557  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  42.82 
 
 		 946 aa  553  1e-156  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  43.81 
 
 		 955 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  43.27 
 
 		 963 aa  553  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20120  Excinuclease ABC subunit A  44.95 
 
 		 982 aa  554  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.578838  normal  0.503443 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  43.39 
 
 		 954 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1631  excinuclease ABC subunit A  44.6 
 
 		 976 aa  555  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.978501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1820  excinuclease ABC subunit A  44.44 
 
 		 973 aa  553  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137397 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  43.39 
 
 		 942 aa  553  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  43.24 
 
 		 987 aa  554  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0704  excinuclease ABC, A subunit  42.86 
 
 		 939 aa  555  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1118  excinuclease ABC subunit A  43.53 
 
 		 996 aa  550  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0427  excinuclease ABC subunit A  41.64 
 
 		 951 aa  550  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5051  excinuclease ABC subunit A  43.18 
 
 		 944 aa  550  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0371407 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  44.7 
 
 		 971 aa  550  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  42.39 
 
 		 946 aa  549  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  42.64 
 
 		 957 aa  550  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1949  excinuclease ABC, A subunit  44.99 
 
 		 957 aa  552  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0876147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2079  excinuclease ABC subunit A  43.66 
 
 		 975 aa  552  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.224045  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0522  excinuclease ABC subunit A  41.82 
 
 		 944 aa  551  1e-155  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0045705  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2295  excinuclease ABC, A subunit  44.66 
 
 		 949 aa  549  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0993  excinuclease ABC subunit A  43.33 
 
 		 946 aa  546  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.883407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2016  excinuclease ABC subunit A  45.14 
 
 		 923 aa  546  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>