More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03329 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  50.41 
 
 		 880 aa  815    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  54.99 
 
 		 838 aa  936    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  55.7 
 
 		 838 aa  940    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  49.52 
 
 		 776 aa  780    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  50.24 
 
 		 848 aa  840    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  49.82 
 
 		 833 aa  798    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1787  ABC transporter related  49.77 
 
 		 845 aa  789    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184754  normal  0.778498 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  53.44 
 
 		 897 aa  936    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  53.8 
 
 		 885 aa  917    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  53.86 
 
 		 877 aa  941    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  58.21 
 
 		 832 aa  964    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  50.41 
 
 		 843 aa  832    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05010  Excinuclease ATPase subunit  44.05 
 
 		 875 aa  661    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  53.9 
 
 		 950 aa  944    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  54.02 
 
 		 899 aa  911    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  52.19 
 
 		 894 aa  893    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2009  excinuclease ABC, A subunit  51.1 
 
 		 880 aa  849    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  53.54 
 
 		 899 aa  937    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  53.06 
 
 		 898 aa  911    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  100 
 
 		 834 aa  1714    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  60.02 
 
 		 853 aa  1043    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  49.77 
 
 		 863 aa  804    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  55.56 
 
 		 850 aa  956    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  56.25 
 
 		 844 aa  953    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  50.12 
 
 		 848 aa  840    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  52.83 
 
 		 898 aa  913    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  59.32 
 
 		 822 aa  1015    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  55.97 
 
 		 861 aa  952    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  50.85 
 
 		 827 aa  811    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  55.23 
 
 		 838 aa  919    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  51.47 
 
 		 860 aa  852    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  56.73 
 
 		 843 aa  982    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  50.12 
 
 		 848 aa  840    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  50.24 
 
 		 851 aa  798    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2123  excinuclease ABC, A subunit  53.42 
 
 		 944 aa  883    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429692 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  53.06 
 
 		 881 aa  889    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  55.23 
 
 		 838 aa  942    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  42.88 
 
 		 945 aa  552  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  40.51 
 
 		 939 aa  555  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  40.37 
 
 		 939 aa  555  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  39.36 
 
 		 968 aa  544  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  39.49 
 
 		 944 aa  544  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  41.27 
 
 		 947 aa  535  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  41.7 
 
 		 946 aa  535  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1750  excinuclease ABC, A subunit  41.2 
 
 		 951 aa  531  1e-149  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.173115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  41.31 
 
 		 955 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0853  excinuclease ABC subunit A  41.2 
 
 		 954 aa  530  1e-149  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3137  excinuclease ABC, A subunit  41.34 
 
 		 961 aa  529  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.484359  normal  0.0493947 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11280  excinuclease ABC subunit A  41.62 
 
 		 994 aa  532  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.259511  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  41.1 
 
 		 942 aa  528  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  40.69 
 
 		 947 aa  528  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0800  excinuclease ABC subunit A  41.67 
 
 		 948 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2191  excinuclease ABC, A subunit  41.64 
 
 		 946 aa  526  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1327  ABC transporter related  37.82 
 
 		 751 aa  527  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  40.49 
 
 		 956 aa  528  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1422  excinuclease ABC, A subunit  40.63 
 
 		 963 aa  527  1e-148  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0151035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10450  Excinuclease ABC subunit A  40.57 
 
 		 960 aa  526  1e-148  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0436929  hitchhiker  0.0000000651145 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0783  excinuclease ABC subunit A  41.67 
 
 		 948 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.686779  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3018  excinuclease ABC, A subunit  41.9 
 
 		 948 aa  528  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244171  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  35.32 
 
 		 823 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25750  excinuclease ABC subunit A  40.72 
 
 		 953 aa  524  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1834  excinuclease ABC, A subunit  39.97 
 
 		 941 aa  523  1e-147  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0157  excinuclease ABC, A subunit  40.06 
 
 		 954 aa  525  1e-147  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.352383  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  41.49 
 
 		 957 aa  525  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0704  excinuclease ABC, A subunit  40.53 
 
 		 939 aa  525  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  40.29 
 
 		 954 aa  525  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3616  excinuclease ABC subunit A  40.17 
 
 		 950 aa  523  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557208 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4379  excinuclease ABC, A subunit  39.43 
 
 		 962 aa  525  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1792  excinuclease ABC, A subunit  37.92 
 
 		 824 aa  521  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2422  excinuclease ABC, A subunit  40.39 
 
 		 952 aa  521  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0686  ABC transporter related  35.61 
 
 		 843 aa  522  1e-146  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.409076 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1406  excinuclease ABC, A subunit  40.14 
 
 		 935 aa  520  1e-146  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0128  excinuclease ABC subunit A  39.86 
 
 		 937 aa  522  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  41.48 
 
 		 971 aa  521  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0649  excinuclease ABC subunit A  38.64 
 
 		 1002 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11654  excinuclease ABC subunit A  40.58 
 
 		 972 aa  519  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550141 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1665  excinuclease ATPase subunit  35.38 
 
 		 846 aa  521  1e-146  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0375  excinuclease ABC, A subunit  39.46 
 
 		 954 aa  520  1e-146  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00180738  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  39.86 
 
 		 937 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1893  excinuclease ABC, A subunit  40.4 
 
 		 945 aa  518  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0808708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2467  excinuclease ABC, A subunit  41.57 
 
 		 934 aa  519  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6045  excinuclease ABC subunit A  40.34 
 
 		 946 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.834052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1820  excinuclease ABC subunit A  39.32 
 
 		 954 aa  518  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.315317  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2847  excinuclease ABC, A subunit  41.57 
 
 		 934 aa  519  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  38.83 
 
 		 927 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3843  excinuclease ABC subunit A  40.34 
 
 		 957 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2057  excinuclease ABC subunit A  41.38 
 
 		 965 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0572  excinuclease ABC, A subunit  39.7 
 
 		 976 aa  517  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.114911  normal  0.199492 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  40.03 
 
 		 941 aa  519  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  40.81 
 
 		 973 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2016  excinuclease ABC subunit A  40.8 
 
 		 923 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  38.71 
 
 		 964 aa  518  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0816  excinuclease ABC, A subunit  39.66 
 
 		 983 aa  517  1.0000000000000001e-145  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  40.06 
 
 		 952 aa  516  1.0000000000000001e-145  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0260  excinuclease ABC, A subunit  40.2 
 
 		 947 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0669187  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3003  excinuclease ABC subunit A  40.81 
 
 		 973 aa  519  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.855569  normal  0.034696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2079  excinuclease ABC subunit A  40.62 
 
 		 975 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.224045  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2992  excinuclease ABC, A subunit  41.31 
 
 		 1055 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00155304  hitchhiker  0.00399188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  40.81 
 
 		 973 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0206  excinuclease ABC, A subunit  37.88 
 
 		 947 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000261219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>