More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05010 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  49.77 
 
 		 838 aa  771    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  49.14 
 
 		 838 aa  779    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  49.19 
 
 		 861 aa  775    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  44.79 
 
 		 834 aa  725    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  48.62 
 
 		 899 aa  743    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  47.51 
 
 		 897 aa  749    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  51 
 
 		 827 aa  747    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1787  ABC transporter related  53.23 
 
 		 845 aa  752    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184754  normal  0.778498 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2009  excinuclease ABC, A subunit  48.83 
 
 		 880 aa  696    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  46.84 
 
 		 877 aa  747    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  53.71 
 
 		 863 aa  824    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  48.23 
 
 		 898 aa  745    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  54.46 
 
 		 848 aa  829    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  48.39 
 
 		 898 aa  745    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  52.91 
 
 		 843 aa  829    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  47.5 
 
 		 885 aa  721    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  53.86 
 
 		 833 aa  806    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  48.34 
 
 		 844 aa  779    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  47.73 
 
 		 899 aa  757    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  47.67 
 
 		 853 aa  746    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  49.71 
 
 		 850 aa  774    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  54.46 
 
 		 848 aa  831    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  48.1 
 
 		 843 aa  771    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  47.6 
 
 		 822 aa  742    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05010  Excinuclease ATPase subunit  100 
 
 		 875 aa  1734    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  52.46 
 
 		 776 aa  773    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  49.6 
 
 		 838 aa  761    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  54.59 
 
 		 880 aa  804    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  48.81 
 
 		 838 aa  776    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  54.24 
 
 		 860 aa  849    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  54.46 
 
 		 848 aa  831    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  52.55 
 
 		 851 aa  775    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  47.94 
 
 		 950 aa  762    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  49.62 
 
 		 894 aa  754    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2123  excinuclease ABC, A subunit  50.11 
 
 		 944 aa  729    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  48.86 
 
 		 832 aa  742    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  45.57 
 
 		 881 aa  687    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  40.47 
 
 		 945 aa  497  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  40.24 
 
 		 947 aa  497  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  40.3 
 
 		 946 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3003  excinuclease ABC subunit A  40.11 
 
 		 973 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.855569  normal  0.034696 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11654  excinuclease ABC subunit A  40.27 
 
 		 972 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550141 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  40.21 
 
 		 973 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  40.21 
 
 		 973 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2851  excinuclease ABC, A subunit  40.16 
 
 		 960 aa  490  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.149004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  39.84 
 
 		 967 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3018  excinuclease ABC, A subunit  41.01 
 
 		 948 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244171  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2191  excinuclease ABC, A subunit  40.19 
 
 		 946 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  39.49 
 
 		 987 aa  480  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6045  excinuclease ABC subunit A  39.04 
 
 		 946 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.834052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25750  excinuclease ABC subunit A  40.16 
 
 		 953 aa  479  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3548  excinuclease ABC subunit A  39.57 
 
 		 967 aa  482  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658203  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2422  excinuclease ABC, A subunit  39.87 
 
 		 952 aa  482  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  39.38 
 
 		 1019 aa  481  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  38.95 
 
 		 968 aa  478  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2057  excinuclease ABC subunit A  40.82 
 
 		 965 aa  479  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5483  excinuclease ABC subunit A  39.84 
 
 		 954 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118727  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  39.62 
 
 		 987 aa  478  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0260  excinuclease ABC, A subunit  37.6 
 
 		 947 aa  473  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0669187  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1792  excinuclease ABC, A subunit  38.58 
 
 		 824 aa  475  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1820  excinuclease ABC subunit A  38.7 
 
 		 973 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137397 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  34.77 
 
 		 939 aa  472  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2079  excinuclease ABC subunit A  38.29 
 
 		 975 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.224045  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2178  excinuclease ABC subunit A  39.78 
 
 		 965 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1949  excinuclease ABC, A subunit  39.51 
 
 		 957 aa  467  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0876147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3137  excinuclease ABC, A subunit  38.7 
 
 		 961 aa  469  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.484359  normal  0.0493947 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  34.64 
 
 		 939 aa  469  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15150  Excinuclease ABC subunit A  39.49 
 
 		 958 aa  468  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096343  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20120  Excinuclease ABC subunit A  38.86 
 
 		 982 aa  464  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.578838  normal  0.503443 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2992  excinuclease ABC, A subunit  40.35 
 
 		 1055 aa  466  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00155304  hitchhiker  0.00399188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1631  excinuclease ABC subunit A  39.97 
 
 		 976 aa  466  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.978501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  37.45 
 
 		 963 aa  464  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2940  excinuclease ABC subunit A  39.89 
 
 		 995 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  39.67 
 
 		 971 aa  461  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3848  excinuclease ABC, A subunit  39.76 
 
 		 975 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00424286  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1542  excinuclease ABC, A subunit  38.4 
 
 		 965 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.464882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  35.9 
 
 		 956 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5616  excinuclease ABC subunit A  38.72 
 
 		 1052 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.239226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  32.92 
 
 		 820 aa  459  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2823  excinuclease ABC, A subunit  36.96 
 
 		 980 aa  455  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179729  normal  0.122251 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0427  excinuclease ABC subunit A  37.55 
 
 		 1011 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659788  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  35.01 
 
 		 927 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0572  excinuclease ABC, A subunit  39.29 
 
 		 976 aa  451  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.114911  normal  0.199492 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  38.4 
 
 		 946 aa  451  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  37.67 
 
 		 964 aa  452  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  36.28 
 
 		 931 aa  450  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1104  excinuclease ABC subunit A  34.33 
 
 		 939 aa  449  1e-125  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1251  excinuclease ABC subunit A  37.7 
 
 		 971 aa  449  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1665  excinuclease ATPase subunit  32.04 
 
 		 846 aa  450  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0816  excinuclease ABC, A subunit  37.24 
 
 		 983 aa  451  1e-125  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  34.49 
 
 		 942 aa  451  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0311  excinuclease ABC subunit A  36.41 
 
 		 942 aa  452  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00463978  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  36.02 
 
 		 947 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10450  Excinuclease ABC subunit A  36.49 
 
 		 960 aa  446  1.0000000000000001e-124  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0436929  hitchhiker  0.0000000651145 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11280  excinuclease ABC subunit A  37.84 
 
 		 994 aa  449  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.259511  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  35.94 
 
 		 946 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  34.58 
 
 		 942 aa  449  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  35.54 
 
 		 1008 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0993  excinuclease ABC subunit A  37.26 
 
 		 946 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.883407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1750  excinuclease ABC, A subunit  35.31 
 
 		 951 aa  445  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.173115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>