More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2636 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  98.57 
 
 		 838 aa  1686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  60.69 
 
 		 843 aa  994    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  94.03 
 
 		 838 aa  1592    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  88.9 
 
 		 838 aa  1511    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  68.13 
 
 		 898 aa  1170    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  60.6 
 
 		 848 aa  986    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2009  excinuclease ABC, A subunit  67.75 
 
 		 880 aa  1108    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05010  Excinuclease ATPase subunit  48.38 
 
 		 875 aa  706    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  69.42 
 
 		 897 aa  1229    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  67.11 
 
 		 861 aa  1142    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  67.47 
 
 		 899 aa  1161    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  77.19 
 
 		 877 aa  1364    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  56.59 
 
 		 776 aa  860    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  68.44 
 
 		 894 aa  1166    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  66.55 
 
 		 832 aa  1093    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  56.35 
 
 		 827 aa  908    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1787  ABC transporter related  55.96 
 
 		 845 aa  886    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184754  normal  0.778498 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  66.19 
 
 		 844 aa  1140    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  69.05 
 
 		 885 aa  1178    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  70 
 
 		 899 aa  1233    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  67.71 
 
 		 843 aa  1171    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  63.37 
 
 		 853 aa  1088    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  59.17 
 
 		 863 aa  954    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  67.14 
 
 		 850 aa  1157    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  60.48 
 
 		 848 aa  987    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  64.81 
 
 		 822 aa  1093    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  69.23 
 
 		 950 aa  1223    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  55.23 
 
 		 834 aa  942    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  60.71 
 
 		 833 aa  961    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  59.33 
 
 		 880 aa  969    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  61.12 
 
 		 860 aa  1012    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  68.13 
 
 		 898 aa  1174    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  60.48 
 
 		 848 aa  987    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  100 
 
 		 838 aa  1715    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  59.88 
 
 		 851 aa  957    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2123  excinuclease ABC, A subunit  65.51 
 
 		 944 aa  1098    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429692 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  66.09 
 
 		 881 aa  1121    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  46.75 
 
 		 945 aa  610  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  43.04 
 
 		 968 aa  595  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  41.33 
 
 		 939 aa  595  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  43.91 
 
 		 954 aa  591  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  41.61 
 
 		 939 aa  591  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  42.6 
 
 		 942 aa  585  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  45.66 
 
 		 946 aa  588  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2191  excinuclease ABC, A subunit  46.05 
 
 		 946 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07070  Excinuclease ABC subunit A  44.44 
 
 		 954 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.478607 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1422  excinuclease ABC, A subunit  44.31 
 
 		 963 aa  583  1.0000000000000001e-165  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0151035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  44.49 
 
 		 987 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10450  Excinuclease ABC subunit A  42.41 
 
 		 960 aa  585  1.0000000000000001e-165  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0436929  hitchhiker  0.0000000651145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  44.21 
 
 		 1019 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  44.35 
 
 		 987 aa  580  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  43.79 
 
 		 955 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1631  excinuclease ABC subunit A  44.79 
 
 		 976 aa  579  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.978501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3137  excinuclease ABC, A subunit  44.14 
 
 		 961 aa  582  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.484359  normal  0.0493947 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  42.94 
 
 		 958 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  42.94 
 
 		 958 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  42.94 
 
 		 958 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  42.8 
 
 		 958 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  42.94 
 
 		 958 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  45.06 
 
 		 971 aa  578  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2178  excinuclease ABC subunit A  45.31 
 
 		 965 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5251  excinuclease ABC subunit A  42.94 
 
 		 958 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2057  excinuclease ABC subunit A  45.28 
 
 		 965 aa  576  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1542  excinuclease ABC, A subunit  45.97 
 
 		 965 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.464882  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  44.63 
 
 		 947 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5328  excinuclease ABC subunit A  42.8 
 
 		 958 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5285  excinuclease ABC subunit A  42.8 
 
 		 958 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2422  excinuclease ABC, A subunit  44.58 
 
 		 952 aa  575  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5672  excinuclease ABC subunit A  42.8 
 
 		 958 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3709  excinuclease ABC subunit A  42.49 
 
 		 956 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4958  excinuclease ABC subunit A  42.8 
 
 		 959 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3003  excinuclease ABC subunit A  44.92 
 
 		 973 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.855569  normal  0.034696 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0384  excinuclease ABC subunit A  43.56 
 
 		 954 aa  569  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000942847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6045  excinuclease ABC subunit A  44.12 
 
 		 946 aa  571  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.834052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25750  excinuclease ABC subunit A  44.77 
 
 		 953 aa  571  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3018  excinuclease ABC, A subunit  45.94 
 
 		 948 aa  572  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244171  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  41.09 
 
 		 942 aa  569  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  44.92 
 
 		 973 aa  572  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  42.52 
 
 		 952 aa  569  1e-161  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  44.92 
 
 		 973 aa  572  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  42.55 
 
 		 937 aa  566  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  40.76 
 
 		 927 aa  566  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11654  excinuclease ABC subunit A  44.49 
 
 		 972 aa  566  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550141 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  44.57 
 
 		 967 aa  567  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4379  excinuclease ABC, A subunit  41.99 
 
 		 962 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  43.36 
 
 		 964 aa  564  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20120  Excinuclease ABC subunit A  44.27 
 
 		 982 aa  565  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.578838  normal  0.503443 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0189  excinuclease ABC, A subunit  41.84 
 
 		 947 aa  561  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0119000000000001e-25 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1834  excinuclease ABC, A subunit  41.33 
 
 		 941 aa  561  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  43.42 
 
 		 957 aa  561  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  42.05 
 
 		 956 aa  559  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0128  excinuclease ABC subunit A  41.54 
 
 		 937 aa  560  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0206  excinuclease ABC, A subunit  41.84 
 
 		 947 aa  561  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000261219  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3548  excinuclease ABC subunit A  44.29 
 
 		 967 aa  561  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658203  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2851  excinuclease ABC, A subunit  43.88 
 
 		 960 aa  560  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.149004  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  44.13 
 
 		 946 aa  560  1e-158  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1322  excinuclease ABC, A subunit  41.73 
 
 		 934 aa  556  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0124703  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  43.58 
 
 		 966 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2079  excinuclease ABC subunit A  43.14 
 
 		 975 aa  557  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.224045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1820  excinuclease ABC subunit A  43.56 
 
 		 973 aa  556  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>