More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1792 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1792  excinuclease ABC, A subunit  100 
 
 		 824 aa  1641    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  41.6 
 
 		 843 aa  552  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  39.03 
 
 		 843 aa  546  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  40.55 
 
 		 838 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  40.07 
 
 		 861 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  39.45 
 
 		 844 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  40.19 
 
 		 853 aa  538  1e-151  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  40.58 
 
 		 848 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  40.64 
 
 		 848 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  40.58 
 
 		 848 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  38.04 
 
 		 834 aa  534  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  39.81 
 
 		 860 aa  534  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  38.97 
 
 		 838 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  38.66 
 
 		 838 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  39.03 
 
 		 899 aa  528  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  40.48 
 
 		 832 aa  525  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  39.48 
 
 		 850 aa  522  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  40.05 
 
 		 827 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  41.29 
 
 		 833 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  37.86 
 
 		 877 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  38.9 
 
 		 950 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  39.62 
 
 		 838 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  38.37 
 
 		 897 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0654  excinuclease ABC, A subunit  42.07 
 
 		 992 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4520  excinuclease ABC subunit A  41.93 
 
 		 961 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308582 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0473  excinuclease ABC subunit A  41.85 
 
 		 941 aa  508  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.78914 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0816  excinuclease ABC, A subunit  41.41 
 
 		 983 aa  506  9.999999999999999e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3021  excinuclease ABC subunit A  42.84 
 
 		 953 aa  504  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5051  excinuclease ABC subunit A  42.22 
 
 		 944 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0371407 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  38.25 
 
 		 822 aa  505  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0483  excinuclease ABC subunit A  41.48 
 
 		 944 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0554  excinuclease ABC, A subunit  40.44 
 
 		 960 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3878  excinuclease ABC subunit A  40.16 
 
 		 946 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0579  excinuclease ABC, A subunit  40.3 
 
 		 960 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0529034  normal  0.0189499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0512  excinuclease ABC subunit A  41.48 
 
 		 944 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  40 
 
 		 863 aa  502  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0585  excinuclease ABC, A subunit  40.44 
 
 		 960 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0516  excinuclease ABC subunit A  41.48 
 
 		 944 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.567244  normal  0.0841787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3755  excinuclease ABC, A subunit  40.44 
 
 		 960 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0309833  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  42.25 
 
 		 776 aa  498  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0189  excinuclease ABC, A subunit  39.19 
 
 		 947 aa  496  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0119000000000001e-25 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4030  excinuclease ABC, A subunit  40.8 
 
 		 950 aa  498  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4419  excinuclease ABC, A subunit  40.03 
 
 		 1043 aa  496  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.834068  normal  0.3832 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  40.72 
 
 		 963 aa  498  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0638  excinuclease ABC, A subunit  40.41 
 
 		 958 aa  496  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00172923  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4720  excinuclease ABC subunit A  41.63 
 
 		 944 aa  499  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207707 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  41.58 
 
 		 966 aa  499  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1820  excinuclease ABC subunit A  40.06 
 
 		 954 aa  497  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.315317  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3438  excinuclease ABC, A subunit  40.64 
 
 		 1040 aa  498  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160486 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3421  excinuclease ABC subunit A  40.5 
 
 		 950 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00603968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0531  excinuclease ABC subunit A  40.5 
 
 		 950 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0391224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  38.52 
 
 		 881 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3616  excinuclease ABC subunit A  41.01 
 
 		 950 aa  498  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3592  excinuclease ABC subunit A  40.5 
 
 		 950 aa  498  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0287106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  38.78 
 
 		 851 aa  497  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2142  excinuclease ABC, A subunit  41.8 
 
 		 949 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.364139 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1568  excinuclease ABC subunit A  39.97 
 
 		 993 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.524179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  39.06 
 
 		 944 aa  494  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0375  excinuclease ABC, A subunit  39.91 
 
 		 954 aa  495  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00180738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0128  excinuclease ABC subunit A  38.59 
 
 		 937 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06520  excinuclease ABC subunit A  41.85 
 
 		 944 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2229  excinuclease ABC, A subunit  40.65 
 
 		 944 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.748559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1752  excinuclease ABC subunit A  41.19 
 
 		 950 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4379  excinuclease ABC, A subunit  39.04 
 
 		 962 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121684  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0533  excinuclease ABC, A subunit  40.62 
 
 		 941 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00348122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0993  excinuclease ABC subunit A  40.65 
 
 		 946 aa  495  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.883407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2426  excinuclease ABC subunit A  41.25 
 
 		 939 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2081  excinuclease ABC subunit A  39.86 
 
 		 1013 aa  495  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0851595  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  35.74 
 
 		 939 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1256  excinuclease ABC, A subunit  41.28 
 
 		 966 aa  495  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145328  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0206  excinuclease ABC, A subunit  39.04 
 
 		 947 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000261219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1187  excinuclease ABC, A subunit  41.13 
 
 		 965 aa  492  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2183  excinuclease ABC, A subunit  42.14 
 
 		 945 aa  490  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.666287  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2057  excinuclease ABC subunit A  42.07 
 
 		 965 aa  490  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4379  excinuclease ABC subunit A  39.55 
 
 		 1019 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612755  normal  0.0845587 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0436  excinuclease ABC subunit A  41.74 
 
 		 940 aa  490  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.64292  normal  0.354082 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0087  excinuclease ABC, A subunit  39.77 
 
 		 937 aa  491  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0569  excinuclease ABC, A subunit  40.38 
 
 		 947 aa  489  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.194002  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3156  excinuclease ABC subunit A  39.69 
 
 		 1005 aa  492  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  41.49 
 
 		 946 aa  489  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1905  excinuclease ABC, A subunit  40.84 
 
 		 962 aa  491  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  38.27 
 
 		 939 aa  492  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11654  excinuclease ABC subunit A  41.86 
 
 		 972 aa  491  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550141 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2295  excinuclease ABC, A subunit  41.53 
 
 		 949 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09180  excinuclease ABC subunit A  41.48 
 
 		 945 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  39.05 
 
 		 894 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  40.39 
 
 		 947 aa  489  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0866  excinuclease ABC subunit A  41.48 
 
 		 945 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1610  excinuclease ABC, A subunit  41.01 
 
 		 965 aa  491  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0746  excinuclease ABC, A subunit  41.04 
 
 		 940 aa  492  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0037  excinuclease ABC subunit A  37.31 
 
 		 920 aa  486  1e-136  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  38.86 
 
 		 937 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3709  excinuclease ABC subunit A  38.4 
 
 		 956 aa  487  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0800  excinuclease ABC subunit A  39.79 
 
 		 948 aa  488  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  37.04 
 
 		 885 aa  488  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2732  excinuclease ABC, A subunit  43.02 
 
 		 962 aa  487  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.102392  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  38.25 
 
 		 941 aa  487  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  40.27 
 
 		 880 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0783  excinuclease ABC subunit A  39.79 
 
 		 948 aa  488  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.686779  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  41.32 
 
 		 1019 aa  489  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>