More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0918 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  72.53 
 
 		 894 aa  1256    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  69.98 
 
 		 838 aa  1242    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  71.7 
 
 		 881 aa  1240    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2123  excinuclease ABC, A subunit  71.25 
 
 		 944 aa  1191    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429692 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  93.33 
 
 		 950 aa  1700    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  67.39 
 
 		 861 aa  1175    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  59.44 
 
 		 843 aa  988    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1787  ABC transporter related  51.25 
 
 		 845 aa  773    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184754  normal  0.778498 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  92.76 
 
 		 897 aa  1682    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  53.77 
 
 		 834 aa  938    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  72.3 
 
 		 898 aa  1278    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  72.96 
 
 		 877 aa  1313    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  54 
 
 		 776 aa  836    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  66.67 
 
 		 843 aa  1197    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  59.14 
 
 		 848 aa  993    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  69.78 
 
 		 838 aa  1212    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  70 
 
 		 838 aa  1233    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  72.47 
 
 		 899 aa  1243    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  100 
 
 		 899 aa  1830    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  65.45 
 
 		 844 aa  1146    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  64.68 
 
 		 853 aa  1132    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  54.15 
 
 		 827 aa  881    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  67.96 
 
 		 850 aa  1167    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  58.88 
 
 		 833 aa  956    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  86.76 
 
 		 885 aa  1562    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  55.59 
 
 		 863 aa  920    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  58.8 
 
 		 848 aa  986    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  57.86 
 
 		 851 aa  941    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  63.79 
 
 		 822 aa  1107    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  65.38 
 
 		 832 aa  1132    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  71.75 
 
 		 898 aa  1256    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  71.92 
 
 		 838 aa  1248    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  59.52 
 
 		 860 aa  1002    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  56.97 
 
 		 880 aa  934    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2009  excinuclease ABC, A subunit  71.41 
 
 		 880 aa  1189    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  58.8 
 
 		 848 aa  986    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  41.16 
 
 		 939 aa  572  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  40.63 
 
 		 939 aa  567  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  41.14 
 
 		 942 aa  561  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2178  excinuclease ABC subunit A  42.24 
 
 		 965 aa  557  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  41.49 
 
 		 955 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  42.1 
 
 		 946 aa  553  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  43.47 
 
 		 971 aa  552  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0572  excinuclease ABC, A subunit  44.21 
 
 		 976 aa  546  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.114911  normal  0.199492 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  40.9 
 
 		 942 aa  547  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5483  excinuclease ABC subunit A  42.4 
 
 		 954 aa  547  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118727  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1422  excinuclease ABC, A subunit  41.77 
 
 		 963 aa  547  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0151035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3137  excinuclease ABC, A subunit  41.84 
 
 		 961 aa  547  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.484359  normal  0.0493947 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0384  excinuclease ABC subunit A  40.85 
 
 		 954 aa  546  1e-154  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000942847  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3018  excinuclease ABC, A subunit  42.88 
 
 		 948 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244171  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1722  excinuclease ABC subunit A  41.51 
 
 		 941 aa  543  1e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  42.93 
 
 		 973 aa  542  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25750  excinuclease ABC subunit A  41.59 
 
 		 953 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3003  excinuclease ABC subunit A  42.93 
 
 		 973 aa  542  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.855569  normal  0.034696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  42.93 
 
 		 973 aa  542  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  41.11 
 
 		 947 aa  537  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  39.12 
 
 		 927 aa  538  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11654  excinuclease ABC subunit A  42.63 
 
 		 972 aa  536  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550141 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2940  excinuclease ABC subunit A  42.78 
 
 		 995 aa  538  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2422  excinuclease ABC, A subunit  42.59 
 
 		 952 aa  538  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  38.22 
 
 		 941 aa  535  1e-150  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2851  excinuclease ABC, A subunit  42.54 
 
 		 960 aa  533  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.149004  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3848  excinuclease ABC, A subunit  43.52 
 
 		 975 aa  534  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00424286  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3346  UvrA family protein  39.89 
 
 		 1929 aa  531  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.973275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2057  excinuclease ABC subunit A  41.93 
 
 		 965 aa  529  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  40.54 
 
 		 946 aa  532  1e-149  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1251  excinuclease ABC subunit A  41.22 
 
 		 971 aa  531  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11280  excinuclease ABC subunit A  41.9 
 
 		 994 aa  532  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.259511  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  42.8 
 
 		 967 aa  530  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0393  excinuclease ABC subunit A  40.74 
 
 		 952 aa  530  1e-149  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  40.67 
 
 		 946 aa  529  1e-148  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2585  excinuclease ABC subunit A  41.76 
 
 		 979 aa  527  1e-148  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.771268  normal  0.888283 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2823  excinuclease ABC, A subunit  40.82 
 
 		 980 aa  528  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179729  normal  0.122251 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2009  excinuclease ABC subunit A  40.13 
 
 		 943 aa  527  1e-148  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.407568  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2079  excinuclease ABC subunit A  40.28 
 
 		 975 aa  528  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.224045  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4419  excinuclease ABC, A subunit  41.01 
 
 		 1043 aa  524  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.834068  normal  0.3832 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0785  excinuclease ABC, A subunit  35.91 
 
 		 961 aa  523  1e-147  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0522  excinuclease ABC subunit A  40.03 
 
 		 944 aa  523  1e-147  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0045705  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1187  excinuclease ABC, A subunit  41.56 
 
 		 965 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2992  excinuclease ABC, A subunit  42.08 
 
 		 1055 aa  520  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00155304  hitchhiker  0.00399188 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0474  excinuclease ABC, A subunit  40.69 
 
 		 946 aa  522  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  41.3 
 
 		 946 aa  522  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1824  excinuclease ABC, A subunit  41.69 
 
 		 945 aa  519  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00152877  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0081  excinuclease ABC, A subunit  41.19 
 
 		 981 aa  521  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1256  excinuclease ABC, A subunit  41.95 
 
 		 966 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145328  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1662  excinuclease ABC subunit A  40.34 
 
 		 958 aa  520  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  39.66 
 
 		 931 aa  522  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0694  excinuclease ABC subunit A  40.21 
 
 		 1004 aa  520  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.641362 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0686  ABC transporter related  36.11 
 
 		 843 aa  522  1e-146  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.409076 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1820  excinuclease ABC subunit A  40.44 
 
 		 973 aa  520  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137397 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0143  excinuclease ABC, A subunit  38.85 
 
 		 1942 aa  520  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1406  excinuclease ABC, A subunit  40 
 
 		 935 aa  519  1.0000000000000001e-145  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0290  excinuclease ABC subunit A  36.09 
 
 		 950 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20120  Excinuclease ABC subunit A  40.79 
 
 		 982 aa  519  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.578838  normal  0.503443 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0075  excinuclease ABC, subunit A, form 2  38.04 
 
 		 2021 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3956  excinuclease ABC, A subunit  39.58 
 
 		 963 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000293672  hitchhiker  0.00020375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1549  excinuclease ABC, A subunit  37.75 
 
 		 1997 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0538  excinuclease ABC subunit A  42.65 
 
 		 970 aa  518  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0318  excinuclease ABC, A subunit  39.92 
 
 		 1006 aa  514  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  39.76 
 
 		 1008 aa  515  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>