More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0207 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  100 
 
 		 898 aa  1796    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  68.63 
 
 		 838 aa  1180    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  68.13 
 
 		 838 aa  1178    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  69.92 
 
 		 894 aa  1166    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  72.05 
 
 		 897 aa  1262    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  60.86 
 
 		 844 aa  1052    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  68.89 
 
 		 838 aa  1160    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  63.35 
 
 		 843 aa  1102    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  71.23 
 
 		 877 aa  1271    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  58.59 
 
 		 848 aa  931    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  69.03 
 
 		 838 aa  1190    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05010  Excinuclease ATPase subunit  47.74 
 
 		 875 aa  680    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  72.65 
 
 		 950 aa  1272    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  52.88 
 
 		 834 aa  917    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  58.87 
 
 		 833 aa  928    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  57.57 
 
 		 843 aa  921    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  54.45 
 
 		 827 aa  865    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  56.35 
 
 		 863 aa  895    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  71.89 
 
 		 899 aa  1284    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1787  ABC transporter related  53.14 
 
 		 845 aa  791    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184754  normal  0.778498 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2009  excinuclease ABC, A subunit  68.34 
 
 		 880 aa  1118    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  59.75 
 
 		 853 aa  1053    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  91.86 
 
 		 899 aa  1583    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  62.7 
 
 		 850 aa  1086    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  63.15 
 
 		 832 aa  1072    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  64.79 
 
 		 861 aa  1135    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  58.59 
 
 		 848 aa  926    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  61 
 
 		 822 aa  1038    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  98.78 
 
 		 898 aa  1778    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  72.25 
 
 		 885 aa  1235    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  57.63 
 
 		 860 aa  937    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  54.52 
 
 		 776 aa  827    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  58.2 
 
 		 880 aa  923    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  58.59 
 
 		 848 aa  926    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  56.38 
 
 		 851 aa  880    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2123  excinuclease ABC, A subunit  70.42 
 
 		 944 aa  1140    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429692 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  68.24 
 
 		 881 aa  1150    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  39.78 
 
 		 939 aa  560  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  43.51 
 
 		 945 aa  557  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  40.86 
 
 		 968 aa  552  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  39.38 
 
 		 939 aa  551  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  41.06 
 
 		 954 aa  549  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  41.87 
 
 		 955 aa  545  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2178  excinuclease ABC subunit A  43.64 
 
 		 965 aa  544  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1422  excinuclease ABC, A subunit  41.41 
 
 		 963 aa  542  1e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0151035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2191  excinuclease ABC, A subunit  43.67 
 
 		 946 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  42.2 
 
 		 946 aa  538  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1722  excinuclease ABC subunit A  40.77 
 
 		 941 aa  536  1e-151  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10450  Excinuclease ABC subunit A  40.46 
 
 		 960 aa  536  1e-151  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0436929  hitchhiker  0.0000000651145 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  39.84 
 
 		 942 aa  535  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  41.55 
 
 		 964 aa  533  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  41.34 
 
 		 987 aa  535  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3003  excinuclease ABC subunit A  42.75 
 
 		 973 aa  535  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.855569  normal  0.034696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  41.24 
 
 		 987 aa  533  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  42.75 
 
 		 973 aa  535  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2016  excinuclease ABC subunit A  41.96 
 
 		 923 aa  533  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  42.61 
 
 		 947 aa  534  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  42.75 
 
 		 973 aa  535  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3137  excinuclease ABC, A subunit  40.89 
 
 		 961 aa  530  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.484359  normal  0.0493947 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0427  excinuclease ABC subunit A  41.22 
 
 		 1011 aa  531  1e-149  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659788  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0384  excinuclease ABC subunit A  40.03 
 
 		 954 aa  530  1e-149  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000942847  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2422  excinuclease ABC, A subunit  42.22 
 
 		 952 aa  530  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  39.08 
 
 		 942 aa  528  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3956  excinuclease ABC, A subunit  40.43 
 
 		 963 aa  528  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000293672  hitchhiker  0.00020375 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  38.14 
 
 		 927 aa  526  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  40 
 
 		 952 aa  526  1e-148  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1251  excinuclease ABC subunit A  41.91 
 
 		 971 aa  527  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  42.08 
 
 		 967 aa  528  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6045  excinuclease ABC subunit A  41.68 
 
 		 946 aa  524  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.834052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0168  excinuclease ABC subunit A  38.36 
 
 		 921 aa  525  1e-147  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  38.33 
 
 		 958 aa  525  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07070  Excinuclease ABC subunit A  41.15 
 
 		 954 aa  522  1e-147  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.478607 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  38.33 
 
 		 958 aa  525  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  38.19 
 
 		 958 aa  525  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  38.19 
 
 		 958 aa  523  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  41.42 
 
 		 963 aa  525  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5285  excinuclease ABC subunit A  38.19 
 
 		 958 aa  523  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2940  excinuclease ABC subunit A  42.72 
 
 		 995 aa  524  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5328  excinuclease ABC subunit A  38.19 
 
 		 958 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11280  excinuclease ABC subunit A  42.19 
 
 		 994 aa  525  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.259511  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  38.33 
 
 		 958 aa  525  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1406  excinuclease ABC, A subunit  38.98 
 
 		 935 aa  526  1e-147  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1631  excinuclease ABC subunit A  42.61 
 
 		 976 aa  525  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.978501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5251  excinuclease ABC subunit A  38.33 
 
 		 958 aa  525  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11654  excinuclease ABC subunit A  42.9 
 
 		 972 aa  525  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2057  excinuclease ABC subunit A  42.03 
 
 		 965 aa  524  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  39.57 
 
 		 1019 aa  526  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25750  excinuclease ABC subunit A  41.63 
 
 		 953 aa  521  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5672  excinuclease ABC subunit A  38.06 
 
 		 958 aa  520  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3548  excinuclease ABC subunit A  41.56 
 
 		 967 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658203  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  41.33 
 
 		 971 aa  520  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0816  excinuclease ABC, A subunit  39.89 
 
 		 983 aa  520  1e-146  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2823  excinuclease ABC, A subunit  41.51 
 
 		 980 aa  520  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179729  normal  0.122251 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2343  excinuclease ABC, A subunit  41.66 
 
 		 1004 aa  521  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.684635  decreased coverage  0.00406706 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1665  excinuclease ATPase subunit  34.46 
 
 		 846 aa  522  1e-146  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4958  excinuclease ABC subunit A  38.06 
 
 		 959 aa  522  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5040  excinuclease ABC, A subunit  37.72 
 
 		 971 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0311  excinuclease ABC subunit A  38.87 
 
 		 942 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00463978  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2851  excinuclease ABC, A subunit  41.12 
 
 		 960 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.149004  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1949  excinuclease ABC, A subunit  42.9 
 
 		 957 aa  519  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0876147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>