More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13060 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03930  excinuclease ABC subunit A  55.53 
 
 
940 aa  1045    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3934  excinuclease ABC, A subunit  55.53 
 
 
940 aa  1043    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  55.25 
 
 
946 aa  1090    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  56.32 
 
 
937 aa  1075    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0483  excinuclease ABC subunit A  54.49 
 
 
944 aa  1039    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1010  excinuclease ABC subunit A  55.13 
 
 
954 aa  1071    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0427  excinuclease ABC subunit A  56.25 
 
 
944 aa  1087    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2694  excinuclease ABC, A subunit  55.75 
 
 
942 aa  1033    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  58.2 
 
 
958 aa  1161    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0920  excinuclease ABC, A subunit  54.08 
 
 
943 aa  1019    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1709  excinuclease ABC subunit A  55.83 
 
 
942 aa  1088    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0152505  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1104  excinuclease ABC subunit A  54.35 
 
 
974 aa  1028    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.807702  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4030  excinuclease ABC, A subunit  54.94 
 
 
950 aa  1043    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0654  excinuclease ABC, A subunit  54.38 
 
 
992 aa  1033    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  58.2 
 
 
958 aa  1162    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  58.09 
 
 
958 aa  1161    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  58.09 
 
 
958 aa  1160    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3095  excinuclease ABC, A subunit  53.92 
 
 
955 aa  998    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0451  excinuclease ABC subunit A  53.97 
 
 
951 aa  1039    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0427  excinuclease ABC subunit A  54.07 
 
 
951 aa  1040    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4520  excinuclease ABC subunit A  54.21 
 
 
961 aa  1035    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.308582 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1685  excinuclease ABC subunit A  53.44 
 
 
968 aa  1030    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0473  excinuclease ABC subunit A  55.45 
 
 
941 aa  1051    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.78914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  68.17 
 
 
945 aa  1325    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1323  excinuclease ABC subunit A  53.59 
 
 
980 aa  1052    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  54.08 
 
 
1008 aa  1040    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0436  excinuclease ABC subunit A  56.58 
 
 
940 aa  1041    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.64292  normal  0.354082 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1568  excinuclease ABC subunit A  54.91 
 
 
993 aa  1031    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.524179  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3591  excinuclease ABC subunit A  56.89 
 
 
965 aa  1088    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.240208  normal  0.0431372 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0779  excinuclease ABC, A subunit  53.92 
 
 
955 aa  998    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.159716  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3021  excinuclease ABC subunit A  54.08 
 
 
953 aa  1000    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5051  excinuclease ABC subunit A  55.22 
 
 
944 aa  1043    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0371407 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2966  excinuclease ABC subunit A  56.75 
 
 
952 aa  1041    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.741995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0087  excinuclease ABC, A subunit  56.95 
 
 
937 aa  1088    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141309  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2317  excinuclease ABC subunit A  55.73 
 
 
976 aa  1028    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458787  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2691  excinuclease ABC subunit A  55.9 
 
 
987 aa  1057    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0128  excinuclease ABC subunit A  55.8 
 
 
937 aa  1073    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0324  excinuclease ABC, A subunit  53.93 
 
 
935 aa  1011    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  58.2 
 
 
958 aa  1162    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1804  excinuclease ABC subunit A  54.51 
 
 
967 aa  1062    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0848  excinuclease ABC subunit A  56.03 
 
 
1003 aa  1075    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.23949 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2229  excinuclease ABC, A subunit  53.61 
 
 
944 aa  997    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.748559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1752  excinuclease ABC subunit A  57.38 
 
 
950 aa  1080    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  60.61 
 
 
971 aa  1150    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0498  excinuclease ABC, A subunit  53.61 
 
 
981 aa  994    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0382753  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  55.98 
 
 
966 aa  1038    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1631  excinuclease ABC subunit A  70.11 
 
 
976 aa  1326    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.978501  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2715  excinuclease ABC subunit A  54.5 
 
 
1011 aa  1021    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.199737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1192  excinuclease ABC subunit A  57.16 
 
 
970 aa  1109    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.548367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  53.92 
 
 
953 aa  1044    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1723  excinuclease ABC subunit A  57.25 
 
 
957 aa  1053    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.30006 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0993  excinuclease ABC subunit A  54.52 
 
 
946 aa  1038    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.883407  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2426  excinuclease ABC subunit A  54.71 
 
 
939 aa  1019    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4108  excinuclease ABC subunit A  53.29 
 
 
957 aa  995    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3315  excinuclease ABC, A subunit  54.55 
 
 
978 aa  1026    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000294803  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  56.35 
 
 
941 aa  1092    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2758  excinuclease ABC subunit A  54.46 
 
 
1008 aa  1016    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0448  excinuclease ABC subunit A  56.24 
 
 
957 aa  1037    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.775809  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2081  excinuclease ABC subunit A  54.94 
 
 
1013 aa  1030    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0851595  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1960  excinuclease ABC, A subunit  53.44 
 
 
968 aa  1029    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0694  excinuclease ABC subunit A  55.53 
 
 
1004 aa  1075    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.641362 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1098  excinuclease ABC subunit A  56.91 
 
 
963 aa  1051    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0926  excinuclease ABC subunit A  57.95 
 
 
967 aa  1109    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160818  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  66.87 
 
 
973 aa  1310    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2016  excinuclease ABC subunit A  63.86 
 
 
923 aa  1145    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0146  excinuclease ABC, A subunit  54.43 
 
 
942 aa  1021    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1396  excinuclease ABC subunit A  55.3 
 
 
970 aa  1029    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.398652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  58.04 
 
 
939 aa  1184    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  57.83 
 
 
939 aa  1181    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1128  excinuclease ABC subunit A  54.07 
 
 
943 aa  1018    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0168519  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4529  excinuclease ABC subunit A  54.22 
 
 
1004 aa  1090    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3421  excinuclease ABC subunit A  55.46 
 
 
950 aa  1047    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00603968  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0531  excinuclease ABC subunit A  55.36 
 
 
950 aa  1045    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0391224  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2748  excinuclease ABC subunit A  55.86 
 
 
940 aa  1001    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0880957  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3712  excinuclease ABC, A subunit  54.53 
 
 
953 aa  1030    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0944752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  56.07 
 
 
942 aa  1099    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1885  excinuclease ABC subunit A  56.43 
 
 
957 aa  1056    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.414426  normal  0.621255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09180  excinuclease ABC subunit A  54.49 
 
 
945 aa  1039    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2009  excinuclease ABC subunit A  55.38 
 
 
943 aa  1069    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.407568  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  53.97 
 
 
952 aa  1043    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1317  excinuclease ATPase subunit  55.33 
 
 
953 aa  1062    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.133455  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0393  excinuclease ABC subunit A  53.44 
 
 
952 aa  1025    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1722  excinuclease ABC subunit A  57.56 
 
 
941 aa  1117    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2079  excinuclease ABC subunit A  69.58 
 
 
975 aa  1368    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.224045  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3616  excinuclease ABC subunit A  56.69 
 
 
950 aa  1083    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0557208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3592  excinuclease ABC subunit A  55.25 
 
 
950 aa  1046    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0287106  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  66.49 
 
 
947 aa  1311    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3515  excinuclease ABC, A subunit  56.22 
 
 
954 aa  1072    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000620303  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2252  excinuclease ABC subunit A  57.87 
 
 
959 aa  1061    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174561  normal  0.0315795 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  68.67 
 
 
1019 aa  1347    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0514  excinuclease ABC, A subunit  54.86 
 
 
942 aa  1030    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  66.87 
 
 
973 aa  1310    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0369  excinuclease ABC, A subunit  54.23 
 
 
945 aa  1040    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  67.29 
 
 
967 aa  1314    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0746  excinuclease ABC, A subunit  54.55 
 
 
940 aa  1037    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4708  excinuclease ABC subunit A  53.25 
 
 
1023 aa  1018    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.879248  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3827  excinuclease ABC, A subunit  52.35 
 
 
1024 aa  994    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.67305 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0735  excinuclease ABC subunit A  53.66 
 
 
964 aa  1030    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0936204  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0063  excinuclease ABC, A subunit  53.92 
 
 
955 aa  998    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19211  excinuclease ABC subunit A  54.4 
 
 
967 aa  1062    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>