More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5797 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3040  ABC transporter related  46.41 
 
 		 754 aa  716    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1659  ABC transporter related protein  50.44 
 
 		 792 aa  779    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.818321  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0097  ABC transporter related  48.62 
 
 		 792 aa  756    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73348  normal  0.128909 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0595  daunorubicin resistance protein DrrC, putative  44.5 
 
 		 752 aa  690    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0588759  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2061  ABC transporter related protein  51.68 
 
 		 756 aa  779    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3201  ABC transporter related protein  49.81 
 
 		 790 aa  739    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0977104  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0264  ABC transporter related  50.96 
 
 		 761 aa  766    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2899  ABC transporter related  50.37 
 
 		 796 aa  744    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000977115  hitchhiker  0.0000331786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0727  ABC transporter related protein  48.32 
 
 		 752 aa  697    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1600  ABC transporter related protein  48.25 
 
 		 798 aa  728    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.239381 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1801  ABC transporter related  54.1 
 
 		 745 aa  841    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.344909  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7895  excinuclease ABC subunit A  51.81 
 
 		 768 aa  770    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1327  ABC transporter related  58.98 
 
 		 751 aa  921    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3531  ABC transporter related  54.36 
 
 		 754 aa  836    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114059  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4179  ABC transporter related  50.25 
 
 		 795 aa  739    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706824  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2348  ABC transporter-like protein  49.94 
 
 		 790 aa  783    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.86691  normal  0.591253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2478  ABC transporter related  46.43 
 
 		 797 aa  712    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.704947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2621  ABC transporter related  49.75 
 
 		 826 aa  728    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.12429 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1760  ABC transporter related protein  48.82 
 
 		 799 aa  730    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144756  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01950  Excinuclease ATPase subunit  46.44 
 
 		 798 aa  698    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0108  ABC transporter related  48.06 
 
 		 796 aa  749    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1980  ABC transporter related  52.27 
 
 		 753 aa  822    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1738  ABC transporter related  49.62 
 
 		 793 aa  740    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0491  ABC transporter related protein  49 
 
 		 794 aa  753    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544871  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2219  ABC transporter related protein  50 
 
 		 788 aa  731    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3212  ABC transporter related protein  49.19 
 
 		 790 aa  768    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125335  hitchhiker  0.000000125221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1999  ABC transporter related  50.83 
 
 		 761 aa  761    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2074  ABC transporter related  48.5 
 
 		 798 aa  749    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012346  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3727  ABC transporter related  50.44 
 
 		 810 aa  787    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0889  excinuclease ATPase subunit  42.93 
 
 		 760 aa  637    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.470006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1474  ABC transporter related  58.44 
 
 		 758 aa  881    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.891231  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0885  excinuclease ATPase subunit  44.43 
 
 		 750 aa  660    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.987216  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5845  ABC transporter related  52.43 
 
 		 790 aa  795    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2199  ABC transporter related  49.94 
 
 		 794 aa  763    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424891  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1706  ABC transporter related protein  49 
 
 		 795 aa  723    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1286  ABC transporter related protein  49.81 
 
 		 827 aa  756    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19653  hitchhiker  0.00243826 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18400  Excinuclease ATPase subunit  49.32 
 
 		 795 aa  754    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3170  ABC transporter related  48.64 
 
 		 801 aa  729    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102444 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2679  ABC transporter related  48.94 
 
 		 795 aa  756    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.249669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1785  ABC transporter related  49.62 
 
 		 793 aa  740    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.806156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6204  nogalamycin resistance protein SnorO  61.5 
 
 		 750 aa  958    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3006  ABC transporter-related protein  49.07 
 
 		 792 aa  757    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320548  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2335  ABC transporter related  46.93 
 
 		 797 aa  728    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0125219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1716  ABC transporter related  58.93 
 
 		 745 aa  946    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3513  ABC transporter related protein  42.71 
 
 		 752 aa  642    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0485409  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28420  Excinuclease ATPase subunit  49.32 
 
 		 799 aa  746    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2501  ABC transporter related protein  50.38 
 
 		 805 aa  776    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1717  ABC transporter related  49.62 
 
 		 793 aa  743    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0057  ABC transporter related  50.88 
 
 		 797 aa  766    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0413721  normal  0.79813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2761  ABC transporter related protein  55.11 
 
 		 752 aa  860    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5797  ABC transporter related protein  100 
 
 		 780 aa  1602    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0852128  normal  0.68212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  37.74 
 
 		 853 aa  532  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  36.96 
 
 		 838 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  37.65 
 
 		 838 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  36.83 
 
 		 838 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  36.85 
 
 		 843 aa  521  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  35.71 
 
 		 950 aa  511  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  36.12 
 
 		 877 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  37.38 
 
 		 844 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  37.83 
 
 		 827 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  36.45 
 
 		 838 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  35.95 
 
 		 850 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  36.71 
 
 		 820 aa  490  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  36.71 
 
 		 861 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  35.6 
 
 		 823 aa  492  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  36.76 
 
 		 822 aa  491  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  36.33 
 
 		 843 aa  488  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  34.63 
 
 		 897 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  37.7 
 
 		 832 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  36.43 
 
 		 860 aa  488  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  36.63 
 
 		 885 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  35.36 
 
 		 834 aa  476  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  41.14 
 
 		 946 aa  473  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  41.01 
 
 		 946 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  35.49 
 
 		 894 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  38.56 
 
 		 947 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  39.97 
 
 		 944 aa  470  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  34.45 
 
 		 898 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  39 
 
 		 939 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  37.74 
 
 		 851 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  34.34 
 
 		 898 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  39.6 
 
 		 941 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1834  excinuclease ABC, A subunit  38.74 
 
 		 941 aa  467  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  38.86 
 
 		 939 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  40.77 
 
 		 987 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  35.72 
 
 		 848 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  38.05 
 
 		 776 aa  463  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  38.02 
 
 		 942 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  39.23 
 
 		 942 aa  464  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1256  excinuclease ABC, A subunit  40.46 
 
 		 966 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145328  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3137  excinuclease ABC, A subunit  40.66 
 
 		 961 aa  464  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.484359  normal  0.0493947 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  40.31 
 
 		 966 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  35.71 
 
 		 881 aa  464  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  40.49 
 
 		 987 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2191  excinuclease ABC, A subunit  41.14 
 
 		 946 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  35.49 
 
 		 848 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0783  excinuclease ABC subunit A  40.14 
 
 		 948 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.686779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  35.49 
 
 		 848 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0800  excinuclease ABC subunit A  40.14 
 
 		 948 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0081  excinuclease ABC, A subunit  40.65 
 
 		 981 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>