More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1999 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1760  ABC transporter related protein  46.47 
 
 		 799 aa  661    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0491  ABC transporter related protein  46.33 
 
 		 794 aa  685    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544871  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0595  daunorubicin resistance protein DrrC, putative  45.47 
 
 		 752 aa  712    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0588759  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01950  Excinuclease ATPase subunit  44.92 
 
 		 798 aa  647    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0097  ABC transporter related  46.15 
 
 		 792 aa  681    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73348  normal  0.128909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2899  ABC transporter related  45.32 
 
 		 796 aa  657    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000977115  hitchhiker  0.0000331786 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1474  ABC transporter related  54.41 
 
 		 758 aa  797    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.891231  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0057  ABC transporter related  47.11 
 
 		 797 aa  664    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0413721  normal  0.79813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2074  ABC transporter related  45.83 
 
 		 798 aa  695    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012346  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2348  ABC transporter-like protein  47.27 
 
 		 790 aa  712    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.86691  normal  0.591253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3212  ABC transporter related protein  46.72 
 
 		 790 aa  702    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125335  hitchhiker  0.000000125221 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2061  ABC transporter related protein  50.13 
 
 		 756 aa  730    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1716  ABC transporter related  51.75 
 
 		 745 aa  781    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3201  ABC transporter related protein  45.23 
 
 		 790 aa  642    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0977104  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1286  ABC transporter related protein  46.13 
 
 		 827 aa  658    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19653  hitchhiker  0.00243826 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1327  ABC transporter related  52.09 
 
 		 751 aa  796    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28420  Excinuclease ATPase subunit  45.6 
 
 		 799 aa  669    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2501  ABC transporter related protein  46.46 
 
 		 805 aa  682    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2621  ABC transporter related  47.07 
 
 		 826 aa  659    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.12429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5845  ABC transporter related  52.55 
 
 		 790 aa  743    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3170  ABC transporter related  46.53 
 
 		 801 aa  664    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102444 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2335  ABC transporter related  44.8 
 
 		 797 aa  658    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0125219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2761  ABC transporter related protein  52.21 
 
 		 752 aa  778    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3513  ABC transporter related protein  44.47 
 
 		 752 aa  692    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0485409  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1980  ABC transporter related  51.27 
 
 		 753 aa  848    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5797  ABC transporter related protein  50.83 
 
 		 780 aa  786    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0852128  normal  0.68212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0727  ABC transporter related protein  56.48 
 
 		 752 aa  796    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6204  nogalamycin resistance protein SnorO  53.21 
 
 		 750 aa  795    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1738  ABC transporter related  46.87 
 
 		 793 aa  672    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1801  ABC transporter related  49.2 
 
 		 745 aa  778    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.344909  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3040  ABC transporter related  49.4 
 
 		 754 aa  772    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1706  ABC transporter related protein  45.77 
 
 		 795 aa  658    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2478  ABC transporter related  45.77 
 
 		 797 aa  669    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.704947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1999  ABC transporter related  100 
 
 		 761 aa  1562    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7895  excinuclease ABC subunit A  47 
 
 		 768 aa  669    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0889  excinuclease ATPase subunit  47.75 
 
 		 760 aa  719    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.470006  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0108  ABC transporter related  45.24 
 
 		 796 aa  690    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3531  ABC transporter related  51.97 
 
 		 754 aa  759    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114059  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0885  excinuclease ATPase subunit  44.16 
 
 		 750 aa  676    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.987216  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2199  ABC transporter related  46.02 
 
 		 794 aa  687    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424891  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18400  Excinuclease ATPase subunit  44.93 
 
 		 795 aa  652    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1659  ABC transporter related protein  45.89 
 
 		 792 aa  682    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.818321  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2679  ABC transporter related  45.91 
 
 		 795 aa  692    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.249669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1785  ABC transporter related  46.87 
 
 		 793 aa  672    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.806156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3727  ABC transporter related  45.5 
 
 		 810 aa  675    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2219  ABC transporter related protein  44.1 
 
 		 788 aa  646    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3006  ABC transporter-related protein  46.18 
 
 		 792 aa  668    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320548  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1600  ABC transporter related protein  46.23 
 
 		 798 aa  668    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.239381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0264  ABC transporter related  93.29 
 
 		 761 aa  1437    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1717  ABC transporter related  46.87 
 
 		 793 aa  672    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4179  ABC transporter related  46.66 
 
 		 795 aa  655    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706824  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  34.98 
 
 		 838 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  34.93 
 
 		 853 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  36.19 
 
 		 838 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  35.96 
 
 		 832 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  34.86 
 
 		 838 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  35.33 
 
 		 820 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  35.05 
 
 		 838 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  34.42 
 
 		 843 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  35.89 
 
 		 844 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  35.56 
 
 		 848 aa  452  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  35.56 
 
 		 848 aa  452  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  35.68 
 
 		 848 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  34.26 
 
 		 823 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  34.09 
 
 		 877 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  34.61 
 
 		 850 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  35.23 
 
 		 894 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  36.42 
 
 		 827 aa  449  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  33.57 
 
 		 834 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  33.93 
 
 		 861 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  34.23 
 
 		 860 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  36.23 
 
 		 947 aa  441  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  34.46 
 
 		 843 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16220  excinuclease ABC, A subunit  38.68 
 
 		 941 aa  438  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266346  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  34.61 
 
 		 899 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  34.63 
 
 		 822 aa  438  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  33.91 
 
 		 898 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  33.91 
 
 		 898 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  38.78 
 
 		 944 aa  436  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  39.41 
 
 		 945 aa  429  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1104  excinuclease ABC subunit A  36.78 
 
 		 939 aa  430  1e-119  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  36.68 
 
 		 776 aa  432  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  37.96 
 
 		 946 aa  427  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  38.53 
 
 		 968 aa  428  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0522  excinuclease ABC subunit A  37.22 
 
 		 944 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0045705  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  37.91 
 
 		 946 aa  428  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  38.89 
 
 		 916 aa  429  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  38.58 
 
 		 957 aa  425  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1084  excinuclease ABC, A subunit  37.34 
 
 		 936 aa  424  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4520  excinuclease ABC subunit A  36.86 
 
 		 961 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  37.63 
 
 		 964 aa  423  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0783  excinuclease ABC subunit A  37.68 
 
 		 948 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.686779  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0455  excinuclease ABC subunit A  38.65 
 
 		 916 aa  423  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0811639  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  36.76 
 
 		 939 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  36.76 
 
 		 939 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  37.87 
 
 		 942 aa  425  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  35.45 
 
 		 851 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0800  excinuclease ABC subunit A  37.68 
 
 		 948 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1322  excinuclease ABC, A subunit  38.64 
 
 		 934 aa  423  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0124703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  37.32 
 
 		 956 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>