More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1801 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3201  ABC transporter related protein  46.04 
 
 		 790 aa  716    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0977104  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3040  ABC transporter related  49.53 
 
 		 754 aa  725    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2074  ABC transporter related  46.3 
 
 		 798 aa  737    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012346  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7895  excinuclease ABC subunit A  48.61 
 
 		 768 aa  745    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0595  daunorubicin resistance protein DrrC, putative  47.52 
 
 		 752 aa  696    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0588759  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3531  ABC transporter related  49.8 
 
 		 754 aa  789    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3513  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 752 aa  680    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0485409  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0057  ABC transporter related  46.4 
 
 		 797 aa  720    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0413721  normal  0.79813 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0108  ABC transporter related  44.97 
 
 		 796 aa  731    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0097  ABC transporter related  46.46 
 
 		 792 aa  733    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73348  normal  0.128909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1659  ABC transporter related protein  47.75 
 
 		 792 aa  766    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.818321  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1286  ABC transporter related protein  46.9 
 
 		 827 aa  729    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19653  hitchhiker  0.00243826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2478  ABC transporter related  46.07 
 
 		 797 aa  720    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.704947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1600  ABC transporter related protein  45.65 
 
 		 798 aa  716    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.239381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2219  ABC transporter related protein  47.81 
 
 		 788 aa  735    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01950  Excinuclease ATPase subunit  45.17 
 
 		 798 aa  713    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1760  ABC transporter related protein  46.17 
 
 		 799 aa  701    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144756  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1801  ABC transporter related  100 
 
 		 745 aa  1524    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.344909  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1980  ABC transporter related  52.41 
 
 		 753 aa  820    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2761  ABC transporter related protein  53.87 
 
 		 752 aa  833    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3170  ABC transporter related  45.1 
 
 		 801 aa  702    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102444 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2899  ABC transporter related  46.85 
 
 		 796 aa  713    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000977115  hitchhiker  0.0000331786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5797  ABC transporter related protein  54.1 
 
 		 780 aa  841    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0852128  normal  0.68212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3727  ABC transporter related  45.31 
 
 		 810 aa  732    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0727  ABC transporter related protein  48.32 
 
 		 752 aa  724    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2621  ABC transporter related  46.82 
 
 		 826 aa  703    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.12429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4179  ABC transporter related  46.54 
 
 		 795 aa  704    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706824  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0264  ABC transporter related  49.33 
 
 		 761 aa  762    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1716  ABC transporter related  56.51 
 
 		 745 aa  873    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1738  ABC transporter related  46.29 
 
 		 793 aa  711    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6204  nogalamycin resistance protein SnorO  54.31 
 
 		 750 aa  851    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846667 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2348  ABC transporter-like protein  47.56 
 
 		 790 aa  768    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.86691  normal  0.591253 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1999  ABC transporter related  49.2 
 
 		 761 aa  754    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1327  ABC transporter related  62.17 
 
 		 751 aa  949    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0889  excinuclease ATPase subunit  46.08 
 
 		 760 aa  697    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.470006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1474  ABC transporter related  61.68 
 
 		 758 aa  912    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.891231  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0885  excinuclease ATPase subunit  47.8 
 
 		 750 aa  686    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.987216  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28420  Excinuclease ATPase subunit  46.06 
 
 		 799 aa  712    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2199  ABC transporter related  46.65 
 
 		 794 aa  744    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424891  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0491  ABC transporter related protein  46.4 
 
 		 794 aa  739    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544871  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1706  ABC transporter related protein  46.32 
 
 		 795 aa  718    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2679  ABC transporter related  45.62 
 
 		 795 aa  735    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.249669  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2061  ABC transporter related protein  49.26 
 
 		 756 aa  758    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1785  ABC transporter related  46.29 
 
 		 793 aa  711    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.806156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2335  ABC transporter related  44.85 
 
 		 797 aa  709    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0125219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3006  ABC transporter-related protein  46.89 
 
 		 792 aa  724    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320548  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5845  ABC transporter related  48.79 
 
 		 790 aa  733    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2501  ABC transporter related protein  45.7 
 
 		 805 aa  724    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18400  Excinuclease ATPase subunit  45.51 
 
 		 795 aa  710    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1717  ABC transporter related  46.29 
 
 		 793 aa  711    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3212  ABC transporter related protein  47.64 
 
 		 790 aa  751    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125335  hitchhiker  0.000000125221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  34.66 
 
 		 843 aa  500  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  34.95 
 
 		 850 aa  497  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  36.34 
 
 		 820 aa  491  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  33.25 
 
 		 838 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  32.93 
 
 		 838 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  34.9 
 
 		 844 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  34.86 
 
 		 853 aa  484  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  41.83 
 
 		 947 aa  481  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  32.89 
 
 		 838 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  34.75 
 
 		 827 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  35.23 
 
 		 822 aa  478  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  35.19 
 
 		 834 aa  477  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  37 
 
 		 823 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  34.45 
 
 		 894 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0037  excinuclease ABC subunit A  40.77 
 
 		 920 aa  476  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  40.18 
 
 		 987 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  41.88 
 
 		 939 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  42.09 
 
 		 939 aa  472  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  40.51 
 
 		 942 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  34.56 
 
 		 860 aa  472  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0641  excinuclease ABC, A subunit  42.38 
 
 		 938 aa  472  1.0000000000000001e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  40.06 
 
 		 947 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  40.74 
 
 		 955 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1036  excinuclease ABC, A subunit  41.7 
 
 		 967 aa  466  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000712855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  33.29 
 
 		 838 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16220  excinuclease ABC, A subunit  40.15 
 
 		 941 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4734  excinuclease ABC, A subunit  41.38 
 
 		 940 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.332226  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  34.59 
 
 		 843 aa  469  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  40.42 
 
 		 954 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  39.88 
 
 		 987 aa  469  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  42.04 
 
 		 942 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  40.36 
 
 		 946 aa  464  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3709  excinuclease ABC subunit A  40.48 
 
 		 956 aa  464  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  32.22 
 
 		 950 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  39.94 
 
 		 946 aa  464  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  32.19 
 
 		 897 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  32.57 
 
 		 899 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1893  excinuclease ABC, A subunit  42.31 
 
 		 945 aa  465  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0808708  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  33.86 
 
 		 832 aa  462  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  35.1 
 
 		 776 aa  464  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  39.19 
 
 		 931 aa  462  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  40.36 
 
 		 946 aa  465  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  33.29 
 
 		 877 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  33.13 
 
 		 861 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  41.42 
 
 		 944 aa  462  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  33.89 
 
 		 848 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0522  excinuclease ABC subunit A  40 
 
 		 944 aa  461  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0045705  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  35.84 
 
 		 851 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  33.77 
 
 		 848 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>