More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1036 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03930  excinuclease ABC subunit A  50.37 
 
 		 940 aa  904    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3934  excinuclease ABC, A subunit  50.37 
 
 		 940 aa  904    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  51.01 
 
 		 946 aa  943    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  52.07 
 
 		 937 aa  950    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0483  excinuclease ABC subunit A  50.95 
 
 		 944 aa  930    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_002950  PG1036  excinuclease ABC, A subunit  100 
 
 		 967 aa  1992    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000712855 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1010  excinuclease ABC subunit A  50.16 
 
 		 954 aa  928    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0427  excinuclease ABC subunit A  51.43 
 
 		 944 aa  936    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2694  excinuclease ABC, A subunit  48.95 
 
 		 942 aa  887    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0916  excinuclease ABC, A subunit  49.53 
 
 		 931 aa  897    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0420  excinuclease ABC subunit A  47.6 
 
 		 954 aa  887    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790766  normal  0.236129 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  51.48 
 
 		 958 aa  973    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1709  excinuclease ABC subunit A  50.16 
 
 		 942 aa  903    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0152505  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1104  excinuclease ABC subunit A  51.35 
 
 		 974 aa  932    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.807702  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4030  excinuclease ABC, A subunit  50.21 
 
 		 950 aa  912    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0654  excinuclease ABC, A subunit  50.42 
 
 		 992 aa  932    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  51.37 
 
 		 958 aa  972    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  51.37 
 
 		 958 aa  972    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  51.27 
 
 		 958 aa  971    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3095  excinuclease ABC, A subunit  48.54 
 
 		 955 aa  883    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0451  excinuclease ABC subunit A  49.58 
 
 		 951 aa  891    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0427  excinuclease ABC subunit A  49.47 
 
 		 951 aa  888    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4520  excinuclease ABC subunit A  50.53 
 
 		 961 aa  933    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308582 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1685  excinuclease ABC subunit A  48.35 
 
 		 968 aa  881    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0473  excinuclease ABC subunit A  50.79 
 
 		 941 aa  917    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.78914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  51.16 
 
 		 945 aa  957    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1323  excinuclease ABC subunit A  47.66 
 
 		 980 aa  904    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0367  excinuclease ABC subunit A  48.18 
 
 		 954 aa  887    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  51.11 
 
 		 1008 aa  931    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0436  excinuclease ABC subunit A  51.38 
 
 		 940 aa  917    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.64292  normal  0.354082 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1568  excinuclease ABC subunit A  50.36 
 
 		 993 aa  912    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.524179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3591  excinuclease ABC subunit A  48.2 
 
 		 965 aa  889    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.240208  normal  0.0431372 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0779  excinuclease ABC, A subunit  48.8 
 
 		 955 aa  883    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.159716  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5051  excinuclease ABC subunit A  50.32 
 
 		 944 aa  931    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0371407 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2966  excinuclease ABC subunit A  50.63 
 
 		 952 aa  902    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.741995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0087  excinuclease ABC, A subunit  51.6 
 
 		 937 aa  963    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141309  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1662  excinuclease ABC subunit A  50.05 
 
 		 958 aa  931    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0154  excinuclease ABC subunit A  49.32 
 
 		 951 aa  937    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.676306  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2691  excinuclease ABC subunit A  47.29 
 
 		 987 aa  890    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0128  excinuclease ABC subunit A  52.67 
 
 		 937 aa  964    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0324  excinuclease ABC, A subunit  49.68 
 
 		 935 aa  892    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  51.37 
 
 		 958 aa  972    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1804  excinuclease ABC subunit A  46.56 
 
 		 967 aa  890    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2229  excinuclease ABC, A subunit  49.63 
 
 		 944 aa  898    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.748559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1752  excinuclease ABC subunit A  50.59 
 
 		 950 aa  924    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  52.17 
 
 		 971 aa  960    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0498  excinuclease ABC, A subunit  49.12 
 
 		 981 aa  886    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0382753  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  47.94 
 
 		 966 aa  897    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1631  excinuclease ABC subunit A  49.58 
 
 		 976 aa  905    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.978501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2715  excinuclease ABC subunit A  50.05 
 
 		 1011 aa  919    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.199737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1192  excinuclease ABC subunit A  50.21 
 
 		 970 aa  930    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.548367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  50.59 
 
 		 953 aa  891    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1723  excinuclease ABC subunit A  50.95 
 
 		 957 aa  916    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.30006 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0993  excinuclease ABC subunit A  49.79 
 
 		 946 aa  892    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.883407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2757  excinuclease ABC subunit A  49.75 
 
 		 1001 aa  895    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.30708  normal  0.666672 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2426  excinuclease ABC subunit A  50 
 
 		 939 aa  914    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4108  excinuclease ABC subunit A  48.38 
 
 		 957 aa  890    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3315  excinuclease ABC, A subunit  50.05 
 
 		 978 aa  882    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000294803  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  52.72 
 
 		 941 aa  952    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2758  excinuclease ABC subunit A  49.65 
 
 		 1008 aa  914    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0448  excinuclease ABC subunit A  51 
 
 		 957 aa  905    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.775809  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2081  excinuclease ABC subunit A  49.04 
 
 		 1013 aa  904    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0851595  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1960  excinuclease ABC, A subunit  48.66 
 
 		 968 aa  884    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0313  excinuclease ABC subunit A  48.65 
 
 		 955 aa  890    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0776  excinuclease ABC subunit A  51.84 
 
 		 981 aa  935    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.839433  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0694  excinuclease ABC subunit A  49.22 
 
 		 1004 aa  917    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.641362 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1098  excinuclease ABC subunit A  51.37 
 
 		 963 aa  920    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0926  excinuclease ABC subunit A  50.52 
 
 		 967 aa  928    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2165  excinuclease ABC, A subunit  48.8 
 
 		 961 aa  877    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611156  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  50.47 
 
 		 973 aa  919    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2016  excinuclease ABC subunit A  51.09 
 
 		 923 aa  895    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1396  excinuclease ABC subunit A  51.04 
 
 		 970 aa  921    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.398652  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0158  excinuclease ABC subunit A  58.24 
 
 		 947 aa  1152    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  51.27 
 
 		 939 aa  956    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  51.37 
 
 		 939 aa  957    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1128  excinuclease ABC subunit A  49.63 
 
 		 943 aa  890    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0168519  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4529  excinuclease ABC subunit A  47.68 
 
 		 1004 aa  905    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3421  excinuclease ABC subunit A  50.16 
 
 		 950 aa  912    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00603968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0531  excinuclease ABC subunit A  50.16 
 
 		 950 aa  914    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0391224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  49.63 
 
 		 942 aa  915    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1885  excinuclease ABC subunit A  52.05 
 
 		 957 aa  962    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.414426  normal  0.621255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09180  excinuclease ABC subunit A  51.05 
 
 		 945 aa  930    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2009  excinuclease ABC subunit A  51.01 
 
 		 943 aa  921    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.407568  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1317  excinuclease ATPase subunit  49.79 
 
 		 953 aa  894    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.133455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0393  excinuclease ABC subunit A  49.79 
 
 		 952 aa  882    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1722  excinuclease ABC subunit A  50.05 
 
 		 941 aa  905    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2079  excinuclease ABC subunit A  50.43 
 
 		 975 aa  913    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.224045  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2779  excinuclease ABC, A subunit  48.8 
 
 		 961 aa  877    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3616  excinuclease ABC subunit A  50.05 
 
 		 950 aa  905    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3592  excinuclease ABC subunit A  50.16 
 
 		 950 aa  913    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0287106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  52.43 
 
 		 947 aa  969    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3515  excinuclease ABC, A subunit  51.41 
 
 		 954 aa  942    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000620303  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0517  excinuclease ABC subunit A  51.11 
 
 		 962 aa  926    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.516633  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2252  excinuclease ABC subunit A  52.05 
 
 		 959 aa  929    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174561  normal  0.0315795 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  50.16 
 
 		 1019 aa  929    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0514  excinuclease ABC, A subunit  48.89 
 
 		 942 aa  884    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  50.47 
 
 		 973 aa  919    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  49.9 
 
 		 967 aa  912    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0746  excinuclease ABC, A subunit  49.58 
 
 		 940 aa  899    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0735  excinuclease ABC subunit A  50 
 
 		 964 aa  907    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0936204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>