More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0595 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2061  ABC transporter related protein  43.09 
 
 		 756 aa  660    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2074  ABC transporter related  42.55 
 
 		 798 aa  659    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012346  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1760  ABC transporter related protein  42.84 
 
 		 799 aa  640    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144756  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0595  daunorubicin resistance protein DrrC, putative  100 
 
 		 752 aa  1542    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0588759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2761  ABC transporter related protein  43.22 
 
 		 752 aa  660    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3513  ABC transporter related protein  51.13 
 
 		 752 aa  763    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0485409  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1474  ABC transporter related  46.01 
 
 		 758 aa  681    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.891231  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6204  nogalamycin resistance protein SnorO  45.15 
 
 		 750 aa  681    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7895  excinuclease ABC subunit A  43.37 
 
 		 768 aa  650    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2348  ABC transporter-like protein  42.62 
 
 		 790 aa  675    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.86691  normal  0.591253 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0097  ABC transporter related  43.08 
 
 		 792 aa  674    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73348  normal  0.128909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0108  ABC transporter related  41.74 
 
 		 796 aa  658    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1716  ABC transporter related  47.66 
 
 		 745 aa  699    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1286  ABC transporter related protein  42.75 
 
 		 827 aa  648    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19653  hitchhiker  0.00243826 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1327  ABC transporter related  46.52 
 
 		 751 aa  709    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1717  ABC transporter related  43.35 
 
 		 793 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3201  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 790 aa  637    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0977104  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0264  ABC transporter related  46.01 
 
 		 761 aa  690    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2899  ABC transporter related  43.35 
 
 		 796 aa  641    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000977115  hitchhiker  0.0000331786 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1801  ABC transporter related  47.52 
 
 		 745 aa  696    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.344909  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3040  ABC transporter related  48.33 
 
 		 754 aa  693    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0727  ABC transporter related protein  43.69 
 
 		 752 aa  667    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0491  ABC transporter related protein  42.31 
 
 		 794 aa  656    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544871  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1738  ABC transporter related  43.61 
 
 		 793 aa  647    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3727  ABC transporter related  41.67 
 
 		 810 aa  655    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3531  ABC transporter related  44.49 
 
 		 754 aa  681    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114059  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5797  ABC transporter related protein  44.5 
 
 		 780 aa  690    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0852128  normal  0.68212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0057  ABC transporter related  41.41 
 
 		 797 aa  640    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0413721  normal  0.79813 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1999  ABC transporter related  45.47 
 
 		 761 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2335  ABC transporter related  42.09 
 
 		 797 aa  635    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0125219 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1980  ABC transporter related  50.4 
 
 		 753 aa  774    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0889  excinuclease ATPase subunit  46.67 
 
 		 760 aa  687    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.470006  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18400  Excinuclease ATPase subunit  42.38 
 
 		 795 aa  656    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0885  excinuclease ATPase subunit  48.94 
 
 		 750 aa  697    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.987216  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2199  ABC transporter related  40.97 
 
 		 794 aa  636    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424891  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2501  ABC transporter related protein  43.04 
 
 		 805 aa  663    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2219  ABC transporter related protein  42.13 
 
 		 788 aa  638    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1659  ABC transporter related protein  42.51 
 
 		 792 aa  670    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.818321  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2679  ABC transporter related  42.13 
 
 		 795 aa  669    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.249669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1785  ABC transporter related  43.61 
 
 		 793 aa  647    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.806156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3006  ABC transporter-related protein  42.06 
 
 		 792 aa  646    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320548  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3212  ABC transporter related protein  42.18 
 
 		 790 aa  655    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125335  hitchhiker  0.000000125221 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2478  ABC transporter related  42.22 
 
 		 797 aa  632  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.704947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1600  ABC transporter related protein  41.56 
 
 		 798 aa  635  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.239381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1706  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 795 aa  634  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3170  ABC transporter related  42.8 
 
 		 801 aa  629  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5845  ABC transporter related  41.17 
 
 		 790 aa  623  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2621  ABC transporter related  42.44 
 
 		 826 aa  622  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.12429 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28420  Excinuclease ATPase subunit  41.24 
 
 		 799 aa  620  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01950  Excinuclease ATPase subunit  40.46 
 
 		 798 aa  621  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4179  ABC transporter related  41.98 
 
 		 795 aa  617  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706824  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  32.65 
 
 		 838 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  35.52 
 
 		 853 aa  476  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  34.54 
 
 		 844 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  32.33 
 
 		 838 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  32.33 
 
 		 838 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  34.61 
 
 		 832 aa  475  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  32.11 
 
 		 877 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  33.85 
 
 		 843 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  34.3 
 
 		 834 aa  467  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  33.57 
 
 		 850 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  34.22 
 
 		 827 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  31.51 
 
 		 950 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  35.2 
 
 		 823 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  32.42 
 
 		 838 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  32.98 
 
 		 860 aa  452  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  31.86 
 
 		 861 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  33.33 
 
 		 822 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  32.69 
 
 		 843 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  32.3 
 
 		 894 aa  445  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  32.65 
 
 		 848 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  32.41 
 
 		 848 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  39.35 
 
 		 939 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  32.41 
 
 		 848 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  33.46 
 
 		 776 aa  439  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  39.2 
 
 		 939 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  32.51 
 
 		 863 aa  438  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  32.27 
 
 		 820 aa  437  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0522  excinuclease ABC subunit A  37.02 
 
 		 944 aa  433  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0045705  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  37.02 
 
 		 946 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  38.83 
 
 		 916 aa  432  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0774  excinuclease ABC, A subunit  39.03 
 
 		 946 aa  430  1e-119  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  30.47 
 
 		 898 aa  432  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  32.65 
 
 		 851 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  30.47 
 
 		 898 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  36.91 
 
 		 946 aa  427  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0495  excinuclease ABC, A subunit  37.3 
 
 		 952 aa  429  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204806  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0037  excinuclease ABC subunit A  37.5 
 
 		 920 aa  425  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0455  excinuclease ABC subunit A  38.53 
 
 		 916 aa  424  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0811639  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2026  ABC transporter related  32.89 
 
 		 818 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0539  excinuclease ABC subunit A  36.61 
 
 		 956 aa  420  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.111546  normal  0.557 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  36.71 
 
 		 955 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  37.05 
 
 		 953 aa  421  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  38.37 
 
 		 942 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  36.48 
 
 		 944 aa  416  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1084  excinuclease ABC, A subunit  36.15 
 
 		 936 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  36.63 
 
 		 954 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1104  excinuclease ABC subunit A  36.32 
 
 		 939 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  31.19 
 
 		 881 aa  419  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2429  excinuclease ABC, A subunit  38.02 
 
 		 931 aa  416  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>