More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2026 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2026  ABC transporter related  100 
 
 		 818 aa  1691    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  35.36 
 
 		 843 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  36.58 
 
 		 820 aa  513  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  40.55 
 
 		 942 aa  515  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  40.32 
 
 		 958 aa  511  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  40.17 
 
 		 958 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  40.17 
 
 		 958 aa  509  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  40.17 
 
 		 958 aa  510  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5328  excinuclease ABC subunit A  40.17 
 
 		 958 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  40.17 
 
 		 958 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5251  excinuclease ABC subunit A  40.17 
 
 		 958 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5285  excinuclease ABC subunit A  40.03 
 
 		 958 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4958  excinuclease ABC subunit A  40.17 
 
 		 959 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5672  excinuclease ABC subunit A  40.03 
 
 		 958 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  33.96 
 
 		 838 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3709  excinuclease ABC subunit A  40.17 
 
 		 956 aa  505  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  34.98 
 
 		 850 aa  503  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  35.49 
 
 		 844 aa  505  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  40.2 
 
 		 946 aa  501  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  39.17 
 
 		 942 aa  501  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  40.46 
 
 		 954 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  35.86 
 
 		 853 aa  501  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  39.63 
 
 		 939 aa  500  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  38.76 
 
 		 927 aa  496  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  34.39 
 
 		 861 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  39.45 
 
 		 945 aa  498  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  33.48 
 
 		 877 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  38.7 
 
 		 946 aa  498  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  39.49 
 
 		 939 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  40.51 
 
 		 956 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  34.59 
 
 		 880 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0596  excinuclease ABC, A subunit  39.37 
 
 		 943 aa  493  9.999999999999999e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.56752e-16 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1820  excinuclease ABC subunit A  35.42 
 
 		 973 aa  495  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137397 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  40.4 
 
 		 955 aa  496  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16220  excinuclease ABC, A subunit  39.32 
 
 		 941 aa  496  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266346  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0384  excinuclease ABC subunit A  40.32 
 
 		 954 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000942847  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  32.94 
 
 		 838 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  34.6 
 
 		 822 aa  490  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1820  excinuclease ABC subunit A  39.19 
 
 		 954 aa  489  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.315317  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  35 
 
 		 823 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  40.47 
 
 		 957 aa  488  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6045  excinuclease ABC subunit A  37.24 
 
 		 946 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.834052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0375  excinuclease ABC, A subunit  39.19 
 
 		 954 aa  489  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00180738  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  38.55 
 
 		 947 aa  486  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0816  excinuclease ABC, A subunit  38.46 
 
 		 983 aa  486  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  37.42 
 
 		 947 aa  487  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0081  excinuclease ABC, A subunit  39.03 
 
 		 981 aa  486  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  36.77 
 
 		 963 aa  487  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  37.4 
 
 		 964 aa  483  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  40.7 
 
 		 971 aa  484  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  38.05 
 
 		 953 aa  485  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  33.02 
 
 		 838 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1010  excinuclease ABC subunit A  38.14 
 
 		 954 aa  482  1e-134  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  33.77 
 
 		 843 aa  480  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0260  excinuclease ABC, A subunit  38.71 
 
 		 947 aa  481  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0669187  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1194  excinuclease ABC subunit A  39.74 
 
 		 932 aa  481  1e-134  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  38.69 
 
 		 987 aa  480  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0926  excinuclease ABC subunit A  38.82 
 
 		 967 aa  481  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  39.91 
 
 		 944 aa  479  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1170  excinuclease ABC, A subunit  39.07 
 
 		 973 aa  482  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  39.91 
 
 		 952 aa  482  1e-134  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0311  excinuclease ABC subunit A  39.46 
 
 		 942 aa  478  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00463978  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1804  excinuclease ABC subunit A  38.25 
 
 		 967 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1192  excinuclease ABC subunit A  37.15 
 
 		 970 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.548367  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2585  excinuclease ABC subunit A  38.06 
 
 		 979 aa  477  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.771268  normal  0.888283 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  38.5 
 
 		 931 aa  478  1e-133  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4529  excinuclease ABC subunit A  39.06 
 
 		 1004 aa  477  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19021  excinuclease ABC subunit A  38.34 
 
 		 967 aa  479  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3956  excinuclease ABC, A subunit  39.29 
 
 		 963 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000293672  hitchhiker  0.00020375 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0704  excinuclease ABC, A subunit  38.26 
 
 		 939 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3515  excinuclease ABC, A subunit  39.05 
 
 		 954 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000620303  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1256  excinuclease ABC, A subunit  38.12 
 
 		 966 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145328  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2057  excinuclease ABC subunit A  38 
 
 		 965 aa  479  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19211  excinuclease ABC subunit A  38.62 
 
 		 967 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1703  excinuclease ABC subunit A  38.98 
 
 		 949 aa  473  1e-132  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  38.26 
 
 		 937 aa  473  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  38.43 
 
 		 1008 aa  475  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0087  excinuclease ABC, A subunit  38.94 
 
 		 937 aa  475  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141309  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  39.05 
 
 		 968 aa  475  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  34.04 
 
 		 832 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  38.12 
 
 		 987 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1631  excinuclease ABC subunit A  37.18 
 
 		 976 aa  475  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.978501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1187  excinuclease ABC, A subunit  37.98 
 
 		 965 aa  475  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  33.33 
 
 		 848 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0206  excinuclease ABC, A subunit  37.82 
 
 		 947 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000261219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0189  excinuclease ABC, A subunit  37.61 
 
 		 947 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0119000000000001e-25 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  33.33 
 
 		 848 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0992  excinuclease ABC subunit A  39.57 
 
 		 942 aa  473  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1322  excinuclease ABC, A subunit  37.55 
 
 		 934 aa  474  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0124703  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  38.21 
 
 		 1019 aa  473  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  33.33 
 
 		 848 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0649  excinuclease ABC subunit A  39.66 
 
 		 1002 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0427  excinuclease ABC subunit A  39.71 
 
 		 944 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1893  excinuclease ABC, A subunit  38 
 
 		 945 aa  469  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0808708  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1007  excinuclease ABC, A subunit  39.2 
 
 		 958 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  37.84 
 
 		 966 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10450  Excinuclease ABC subunit A  38.85 
 
 		 960 aa  470  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0436929  hitchhiker  0.0000000651145 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3337  excinuclease ABC, A subunit  39.01 
 
 		 1008 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.690978  normal  0.507312 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  33.03 
 
 		 885 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2191  excinuclease ABC, A subunit  38.95 
 
 		 946 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>