More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0264 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28420  Excinuclease ATPase subunit  45.92 
 
 		 799 aa  679    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0491  ABC transporter related protein  47.12 
 
 		 794 aa  696    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544871  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1286  ABC transporter related protein  45.88 
 
 		 827 aa  660    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19653  hitchhiker  0.00243826 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3040  ABC transporter related  49.26 
 
 		 754 aa  766    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0595  daunorubicin resistance protein DrrC, putative  46.01 
 
 		 752 aa  711    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0588759  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0108  ABC transporter related  45.96 
 
 		 796 aa  700    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4179  ABC transporter related  47.83 
 
 		 795 aa  667    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706824  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1760  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 799 aa  672    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2348  ABC transporter-like protein  46.89 
 
 		 790 aa  715    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.86691  normal  0.591253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7895  excinuclease ABC subunit A  47.79 
 
 		 768 aa  676    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1600  ABC transporter related protein  46.85 
 
 		 798 aa  683    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.239381 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3201  ABC transporter related protein  45.3 
 
 		 790 aa  649    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0977104  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2074  ABC transporter related  46.08 
 
 		 798 aa  702    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012346  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3513  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 752 aa  678    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0485409  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2478  ABC transporter related  45.68 
 
 		 797 aa  667    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.704947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2621  ABC transporter related  47.69 
 
 		 826 aa  667    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.12429 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2501  ABC transporter related protein  46.3 
 
 		 805 aa  694    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1659  ABC transporter related protein  46.38 
 
 		 792 aa  692    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.818321  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1801  ABC transporter related  49.33 
 
 		 745 aa  775    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.344909  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3531  ABC transporter related  51.65 
 
 		 754 aa  762    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114059  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1738  ABC transporter related  47.31 
 
 		 793 aa  676    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5845  ABC transporter related  52.82 
 
 		 790 aa  751    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1706  ABC transporter related protein  46.44 
 
 		 795 aa  671    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3212  ABC transporter related protein  46.85 
 
 		 790 aa  710    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125335  hitchhiker  0.000000125221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1999  ABC transporter related  93.29 
 
 		 761 aa  1417    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0727  ABC transporter related protein  55.29 
 
 		 752 aa  773    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18400  Excinuclease ATPase subunit  45.56 
 
 		 795 aa  661    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0889  excinuclease ATPase subunit  47.26 
 
 		 760 aa  709    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.470006  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2219  ABC transporter related protein  44.25 
 
 		 788 aa  654    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1327  ABC transporter related  52.69 
 
 		 751 aa  801    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0885  excinuclease ATPase subunit  44.03 
 
 		 750 aa  669    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.987216  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5797  ABC transporter related protein  50.96 
 
 		 780 aa  782    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0852128  normal  0.68212 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2199  ABC transporter related  46.14 
 
 		 794 aa  694    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424891  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0057  ABC transporter related  47.24 
 
 		 797 aa  673    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0413721  normal  0.79813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0097  ABC transporter related  46.27 
 
 		 792 aa  691    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73348  normal  0.128909 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1474  ABC transporter related  53.82 
 
 		 758 aa  790    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.891231  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01950  Excinuclease ATPase subunit  44.69 
 
 		 798 aa  647    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2679  ABC transporter related  46.29 
 
 		 795 aa  702    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.249669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1785  ABC transporter related  47.31 
 
 		 793 aa  676    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.806156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1716  ABC transporter related  51.48 
 
 		 745 aa  786    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3727  ABC transporter related  45.95 
 
 		 810 aa  684    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6204  nogalamycin resistance protein SnorO  53.81 
 
 		 750 aa  805    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3006  ABC transporter-related protein  46.56 
 
 		 792 aa  681    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320548  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2899  ABC transporter related  45.44 
 
 		 796 aa  664    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000977115  hitchhiker  0.0000331786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3170  ABC transporter related  46.53 
 
 		 801 aa  672    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102444 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1717  ABC transporter related  47.31 
 
 		 793 aa  676    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0264  ABC transporter related  100 
 
 		 761 aa  1567    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2061  ABC transporter related protein  50.13 
 
 		 756 aa  730    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1980  ABC transporter related  51.81 
 
 		 753 aa  851    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2335  ABC transporter related  45.4 
 
 		 797 aa  664    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0125219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2761  ABC transporter related protein  52.21 
 
 		 752 aa  770    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  35.46 
 
 		 838 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  36.32 
 
 		 832 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  35.41 
 
 		 853 aa  474  1e-132  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  35.34 
 
 		 838 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  36.11 
 
 		 838 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  35.69 
 
 		 820 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  35.52 
 
 		 850 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  37.15 
 
 		 827 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  35.89 
 
 		 838 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  34.61 
 
 		 843 aa  458  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  36.37 
 
 		 844 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  34.58 
 
 		 823 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  35.22 
 
 		 894 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  34.9 
 
 		 848 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  34.9 
 
 		 848 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  36.47 
 
 		 947 aa  449  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  34.49 
 
 		 877 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  34.88 
 
 		 899 aa  452  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  33.77 
 
 		 834 aa  452  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  35.02 
 
 		 848 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  34.45 
 
 		 861 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  34.41 
 
 		 898 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  35.18 
 
 		 843 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  33.96 
 
 		 860 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  34.95 
 
 		 822 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  34.49 
 
 		 898 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16220  excinuclease ABC, A subunit  38.53 
 
 		 941 aa  432  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266346  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  38.47 
 
 		 944 aa  435  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  38.79 
 
 		 968 aa  434  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1322  excinuclease ABC, A subunit  39.44 
 
 		 934 aa  434  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0124703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  38.11 
 
 		 956 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0654  excinuclease ABC, A subunit  37.09 
 
 		 992 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4520  excinuclease ABC subunit A  36.87 
 
 		 961 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308582 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  37.91 
 
 		 946 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  36.77 
 
 		 776 aa  432  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0866  excinuclease ABC subunit A  35.65 
 
 		 950 aa  429  1e-119  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1084  excinuclease ABC, A subunit  37.83 
 
 		 936 aa  431  1e-119  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  38.11 
 
 		 946 aa  429  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0455  excinuclease ABC subunit A  38.96 
 
 		 916 aa  426  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0811639  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0451  excinuclease ABC subunit A  37.85 
 
 		 951 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  37.15 
 
 		 1008 aa  429  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0384  excinuclease ABC subunit A  37.88 
 
 		 954 aa  426  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000942847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  39.1 
 
 		 916 aa  429  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1104  excinuclease ABC subunit A  36.63 
 
 		 939 aa  427  1e-118  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0522  excinuclease ABC subunit A  37.08 
 
 		 944 aa  428  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0045705  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  37.66 
 
 		 931 aa  428  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4734  excinuclease ABC, A subunit  38.44 
 
 		 940 aa  425  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.332226  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  37.35 
 
 		 939 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0800  excinuclease ABC subunit A  37.82 
 
 		 948 aa  423  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>