More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3513 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6204  nogalamycin resistance protein SnorO  43.48 
 
 
750 aa  655    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.846667 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0595  daunorubicin resistance protein DrrC, putative  51.13 
 
 
752 aa  773    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0588759  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3513  ABC transporter related protein  100 
 
 
752 aa  1520    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0485409  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0264  ABC transporter related  44.21 
 
 
761 aa  674    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1801  ABC transporter related  46.98 
 
 
745 aa  693    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.344909  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1327  ABC transporter related  46.72 
 
 
751 aa  693    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1716  ABC transporter related  43.91 
 
 
745 aa  640    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3040  ABC transporter related  49.53 
 
 
754 aa  730    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2061  ABC transporter related protein  42.5 
 
 
756 aa  642    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0727  ABC transporter related protein  42.38 
 
 
752 aa  647    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2348  ABC transporter-like protein  41.49 
 
 
790 aa  645    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.86691  normal  0.591253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3531  ABC transporter related  42.38 
 
 
754 aa  642    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114059  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1474  ABC transporter related  47.21 
 
 
758 aa  692    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.891231  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1999  ABC transporter related  44.47 
 
 
761 aa  682    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0889  excinuclease ATPase subunit  46.53 
 
 
760 aa  668    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.470006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0885  excinuclease ATPase subunit  48.93 
 
 
750 aa  703    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.987216  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5797  ABC transporter related protein  42.71 
 
 
780 aa  655    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0852128  normal  0.68212 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2761  ABC transporter related protein  43.16 
 
 
752 aa  671    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1980  ABC transporter related  49 
 
 
753 aa  759    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0097  ABC transporter related  41.15 
 
 
792 aa  634  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73348  normal  0.128909 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2199  ABC transporter related  40.1 
 
 
794 aa  619  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424891  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1659  ABC transporter related protein  40.49 
 
 
792 aa  621  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.818321  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3212  ABC transporter related protein  39.87 
 
 
790 aa  620  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125335  hitchhiker  0.000000125221 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0491  ABC transporter related protein  39.36 
 
 
794 aa  613  9.999999999999999e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544871  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2219  ABC transporter related protein  41.3 
 
 
788 aa  613  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3006  ABC transporter-related protein  40.56 
 
 
792 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320548  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2679  ABC transporter related  39.15 
 
 
795 aa  610  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.249669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7895  excinuclease ABC subunit A  40.9 
 
 
768 aa  608  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18400  Excinuclease ATPase subunit  38.85 
 
 
795 aa  607  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2501  ABC transporter related protein  39.97 
 
 
805 aa  608  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2074  ABC transporter related  38.49 
 
 
798 aa  607  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012346  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3727  ABC transporter related  39.23 
 
 
810 aa  607  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3170  ABC transporter related  39.82 
 
 
801 aa  608  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102444 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0108  ABC transporter related  38.54 
 
 
796 aa  599  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1760  ABC transporter related protein  39.69 
 
 
799 aa  597  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144756  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28420  Excinuclease ATPase subunit  39.37 
 
 
799 aa  594  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0057  ABC transporter related  39.23 
 
 
797 aa  592  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0413721  normal  0.79813 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3201  ABC transporter related protein  39.41 
 
 
790 aa  593  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0977104  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2621  ABC transporter related  39.85 
 
 
826 aa  593  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.12429 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01950  Excinuclease ATPase subunit  38.85 
 
 
798 aa  594  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1286  ABC transporter related protein  39.34 
 
 
827 aa  595  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19653  hitchhiker  0.00243826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2478  ABC transporter related  39.59 
 
 
797 aa  592  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.704947  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1600  ABC transporter related protein  38.78 
 
 
798 aa  590  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.239381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1738  ABC transporter related  40.23 
 
 
793 aa  592  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2335  ABC transporter related  39.95 
 
 
797 aa  591  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0125219 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1785  ABC transporter related  40.23 
 
 
793 aa  592  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.806156  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1717  ABC transporter related  39.85 
 
 
793 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1706  ABC transporter related protein  39.2 
 
 
795 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2899  ABC transporter related  40.13 
 
 
796 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000977115  hitchhiker  0.0000331786 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4179  ABC transporter related  39.97 
 
 
795 aa  582  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706824  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5845  ABC transporter related  38.3 
 
 
790 aa  567  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  34.45 
 
 
820 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  35.77 
 
 
823 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  33.29 
 
 
843 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  33.73 
 
 
834 aa  448  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  33.01 
 
 
853 aa  449  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  33.09 
 
 
822 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  32.49 
 
 
861 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  34.31 
 
 
832 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  32.85 
 
 
850 aa  443  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  33.46 
 
 
776 aa  445  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  30.51 
 
 
838 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  30.43 
 
 
838 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  32.96 
 
 
844 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  30.55 
 
 
838 aa  439  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  30.85 
 
 
950 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  31.84 
 
 
881 aa  431  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16220  excinuclease ABC, A subunit  36.8 
 
 
941 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  32.12 
 
 
827 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0037  excinuclease ABC subunit A  36.05 
 
 
920 aa  424  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  30.35 
 
 
897 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  29.95 
 
 
877 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  30.83 
 
 
843 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1104  excinuclease ABC subunit A  37.43 
 
 
939 aa  425  1e-117  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  30.82 
 
 
848 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  30.82 
 
 
848 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  31.06 
 
 
848 aa  426  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  30.3 
 
 
894 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  32.44 
 
 
851 aa  420  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2026  ABC transporter related  32.96 
 
 
818 aa  420  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  34.64 
 
 
957 aa  418  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  30.18 
 
 
885 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  37.19 
 
 
931 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1834  excinuclease ABC, A subunit  38.17 
 
 
941 aa  412  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  38.87 
 
 
916 aa  416  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3878  excinuclease ABC subunit A  32.16 
 
 
946 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847875  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  30.36 
 
 
838 aa  416  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  35.59 
 
 
954 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  35.59 
 
 
955 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1118  excinuclease ABC subunit A  34.54 
 
 
996 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0654  excinuclease ABC, A subunit  32.59 
 
 
992 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4520  excinuclease ABC subunit A  32.59 
 
 
961 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.308582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  36.18 
 
 
1008 aa  411  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2229  excinuclease ABC, A subunit  35.04 
 
 
944 aa  409  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.748559  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0157  excinuclease ABC, A subunit  35.97 
 
 
954 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.352383  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  35.24 
 
 
953 aa  409  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04893  excinuclease ABC subunit A  34.4 
 
 
988 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000582008  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09180  excinuclease ABC subunit A  32.38 
 
 
945 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0455  excinuclease ABC subunit A  39.02 
 
 
916 aa  410  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0811639  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0853  excinuclease ABC subunit A  36.16 
 
 
954 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>