More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3531 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_18400  Excinuclease ATPase subunit  67.44 
 
 		 795 aa  1045    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1716  ABC transporter related  52.98 
 
 		 745 aa  825    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1474  ABC transporter related  55.25 
 
 		 758 aa  832    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.891231  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0595  daunorubicin resistance protein DrrC, putative  44.49 
 
 		 752 aa  681    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0588759  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1980  ABC transporter related  51.6 
 
 		 753 aa  828    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2061  ABC transporter related protein  72.02 
 
 		 756 aa  1076    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2899  ABC transporter related  66.54 
 
 		 796 aa  1018    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000977115  hitchhiker  0.0000331786 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0108  ABC transporter related  64.88 
 
 		 796 aa  1032    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0264  ABC transporter related  51.65 
 
 		 761 aa  743    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28420  Excinuclease ATPase subunit  66.62 
 
 		 799 aa  1028    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0727  ABC transporter related protein  55.94 
 
 		 752 aa  749    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3201  ABC transporter related protein  69.41 
 
 		 790 aa  1040    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0977104  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2219  ABC transporter related protein  65.55 
 
 		 788 aa  1018    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2074  ABC transporter related  64.92 
 
 		 798 aa  1018    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012346  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2501  ABC transporter related protein  67.22 
 
 		 805 aa  1058    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1327  ABC transporter related  54.08 
 
 		 751 aa  842    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2621  ABC transporter related  70.56 
 
 		 826 aa  1066    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.12429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1659  ABC transporter related protein  68.84 
 
 		 792 aa  1092    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.818321  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0057  ABC transporter related  69.7 
 
 		 797 aa  1070    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0413721  normal  0.79813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4179  ABC transporter related  70.57 
 
 		 795 aa  1063    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706824  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5797  ABC transporter related protein  54.36 
 
 		 780 aa  836    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0852128  normal  0.68212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2478  ABC transporter related  66.58 
 
 		 797 aa  1034    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.704947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1738  ABC transporter related  65.35 
 
 		 793 aa  1005    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0097  ABC transporter related  66.8 
 
 		 792 aa  1046    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73348  normal  0.128909 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1999  ABC transporter related  51.97 
 
 		 761 aa  728    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1286  ABC transporter related protein  67.05 
 
 		 827 aa  1041    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19653  hitchhiker  0.00243826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7895  excinuclease ABC subunit A  72.85 
 
 		 768 aa  1104    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0889  excinuclease ATPase subunit  45.99 
 
 		 760 aa  685    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.470006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2348  ABC transporter-like protein  68.46 
 
 		 790 aa  1087    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.86691  normal  0.591253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2199  ABC transporter related  67.65 
 
 		 794 aa  1065    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424891  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3170  ABC transporter related  67.69 
 
 		 801 aa  1036    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102444 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1801  ABC transporter related  49.8 
 
 		 745 aa  789    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.344909  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5845  ABC transporter related  54.01 
 
 		 790 aa  755    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2679  ABC transporter related  66.37 
 
 		 795 aa  1036    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.249669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1785  ABC transporter related  65.35 
 
 		 793 aa  1005    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.806156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3006  ABC transporter-related protein  65.57 
 
 		 792 aa  1026    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320548  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1706  ABC transporter related protein  66.84 
 
 		 795 aa  1016    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3040  ABC transporter related  48.19 
 
 		 754 aa  706    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0491  ABC transporter related protein  65.86 
 
 		 794 aa  1048    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544871  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6204  nogalamycin resistance protein SnorO  55.5 
 
 		 750 aa  830    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3531  ABC transporter related  100 
 
 		 754 aa  1526    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1717  ABC transporter related  65.1 
 
 		 793 aa  1001    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3727  ABC transporter related  67.22 
 
 		 810 aa  1058    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3212  ABC transporter related protein  68.08 
 
 		 790 aa  1087    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125335  hitchhiker  0.000000125221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2761  ABC transporter related protein  54.81 
 
 		 752 aa  790    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1600  ABC transporter related protein  68.84 
 
 		 798 aa  1050    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.239381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2335  ABC transporter related  66.37 
 
 		 797 aa  1038    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0125219 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1760  ABC transporter related protein  64.29 
 
 		 799 aa  983    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144756  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01950  Excinuclease ATPase subunit  57.35 
 
 		 798 aa  885    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3513  ABC transporter related protein  42.38 
 
 		 752 aa  631  1e-179  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0485409  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0885  excinuclease ATPase subunit  43.22 
 
 		 750 aa  614  9.999999999999999e-175  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.987216  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  38.54 
 
 		 843 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  38.34 
 
 		 853 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  36.77 
 
 		 823 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  37.8 
 
 		 850 aa  491  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  38.08 
 
 		 861 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1560  putative excision nuclease ABC subunit  68.31 
 
 		 402 aa  488  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.228081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  37.23 
 
 		 820 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  37.7 
 
 		 838 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  38.12 
 
 		 838 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  38.52 
 
 		 844 aa  485  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  37.55 
 
 		 838 aa  479  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  39.56 
 
 		 827 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  39.52 
 
 		 848 aa  475  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  39.52 
 
 		 848 aa  475  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  41.44 
 
 		 776 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  38.86 
 
 		 832 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  39.28 
 
 		 848 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  36.49 
 
 		 877 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  38.1 
 
 		 822 aa  464  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  40.03 
 
 		 947 aa  460  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  36.15 
 
 		 897 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  36.45 
 
 		 899 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  39 
 
 		 939 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  39.29 
 
 		 939 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  35.84 
 
 		 834 aa  456  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  41.8 
 
 		 946 aa  456  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  37.87 
 
 		 838 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  40.38 
 
 		 946 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  40.09 
 
 		 927 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  38.19 
 
 		 843 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0455  excinuclease ABC subunit A  41.46 
 
 		 916 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0811639  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  38.43 
 
 		 863 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  40 
 
 		 942 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0384  excinuclease ABC subunit A  36.92 
 
 		 954 aa  455  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000942847  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  41.96 
 
 		 946 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4379  excinuclease ABC, A subunit  40.62 
 
 		 962 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  41.37 
 
 		 964 aa  452  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  41.31 
 
 		 916 aa  451  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  37.98 
 
 		 860 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16220  excinuclease ABC, A subunit  37.88 
 
 		 941 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266346  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  36.76 
 
 		 898 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  41.19 
 
 		 945 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0189  excinuclease ABC, A subunit  40.32 
 
 		 947 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0119000000000001e-25 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  37.11 
 
 		 898 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  38.54 
 
 		 942 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  39.64 
 
 		 946 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  37.59 
 
 		 881 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6045  excinuclease ABC subunit A  41.53 
 
 		 946 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.834052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0522  excinuclease ABC subunit A  39.94 
 
 		 944 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0045705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>