More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2061 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0264  ABC transporter related  50.13 
 
 		 761 aa  729    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28420  Excinuclease ATPase subunit  62.21 
 
 		 799 aa  950    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1327  ABC transporter related  53.55 
 
 		 751 aa  839    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0595  daunorubicin resistance protein DrrC, putative  43.09 
 
 		 752 aa  673    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0588759  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5797  ABC transporter related protein  51.68 
 
 		 780 aa  798    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0852128  normal  0.68212 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2761  ABC transporter related protein  52.41 
 
 		 752 aa  761    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2348  ABC transporter-like protein  63.58 
 
 		 790 aa  1000    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.86691  normal  0.591253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4179  ABC transporter related  67.82 
 
 		 795 aa  1018    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706824  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0108  ABC transporter related  62.26 
 
 		 796 aa  975    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1706  ABC transporter related protein  65.69 
 
 		 795 aa  993    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1659  ABC transporter related protein  66.62 
 
 		 792 aa  1049    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.818321  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01950  Excinuclease ATPase subunit  59.79 
 
 		 798 aa  927    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3531  ABC transporter related  72.02 
 
 		 754 aa  1100    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114059  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1716  ABC transporter related  53.25 
 
 		 745 aa  806    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1600  ABC transporter related protein  64.12 
 
 		 798 aa  997    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.239381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2899  ABC transporter related  64.37 
 
 		 796 aa  981    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000977115  hitchhiker  0.0000331786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3212  ABC transporter related protein  65.17 
 
 		 790 aa  1029    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125335  hitchhiker  0.000000125221 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2219  ABC transporter related protein  63.75 
 
 		 788 aa  976    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3727  ABC transporter related  65.05 
 
 		 810 aa  1021    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2478  ABC transporter related  62.44 
 
 		 797 aa  967    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.704947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2621  ABC transporter related  65.53 
 
 		 826 aa  983    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.12429 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2074  ABC transporter related  62.09 
 
 		 798 aa  967    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012346  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0491  ABC transporter related protein  64.01 
 
 		 794 aa  1004    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544871  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1738  ABC transporter related  64.07 
 
 		 793 aa  964    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0727  ABC transporter related protein  54.14 
 
 		 752 aa  728    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3040  ABC transporter related  47.18 
 
 		 754 aa  690    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1980  ABC transporter related  50.07 
 
 		 753 aa  794    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1999  ABC transporter related  50.13 
 
 		 761 aa  714    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2501  ABC transporter related protein  64.27 
 
 		 805 aa  1004    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0889  excinuclease ATPase subunit  46.26 
 
 		 760 aa  676    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.470006  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1286  ABC transporter related protein  63.75 
 
 		 827 aa  979    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19653  hitchhiker  0.00243826 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0885  excinuclease ATPase subunit  44.34 
 
 		 750 aa  642    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.987216  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2199  ABC transporter related  64.71 
 
 		 794 aa  1017    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424891  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1474  ABC transporter related  54.75 
 
 		 758 aa  808    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.891231  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3513  ABC transporter related protein  42.5 
 
 		 752 aa  644    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0485409  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3201  ABC transporter related protein  65.26 
 
 		 790 aa  990    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0977104  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2679  ABC transporter related  63.94 
 
 		 795 aa  1006    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.249669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1785  ABC transporter related  64.07 
 
 		 793 aa  964    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.806156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1760  ABC transporter related protein  62.69 
 
 		 799 aa  943    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3170  ABC transporter related  63.16 
 
 		 801 aa  959    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3006  ABC transporter-related protein  61.98 
 
 		 792 aa  956    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320548  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2061  ABC transporter related protein  100 
 
 		 756 aa  1536    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5845  ABC transporter related  52.05 
 
 		 790 aa  738    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6204  nogalamycin resistance protein SnorO  54.56 
 
 		 750 aa  813    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846667 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18400  Excinuclease ATPase subunit  65.34 
 
 		 795 aa  1007    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2335  ABC transporter related  62.4 
 
 		 797 aa  972    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0125219 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1717  ABC transporter related  63.68 
 
 		 793 aa  959    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0057  ABC transporter related  64.78 
 
 		 797 aa  989    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0413721  normal  0.79813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0097  ABC transporter related  60.61 
 
 		 792 aa  959    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73348  normal  0.128909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7895  excinuclease ABC subunit A  68.73 
 
 		 768 aa  1042    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1801  ABC transporter related  49.26 
 
 		 745 aa  774    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.344909  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  37.02 
 
 		 843 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  40.61 
 
 		 827 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  37.23 
 
 		 823 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  37.66 
 
 		 850 aa  482  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  39.48 
 
 		 848 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  39.48 
 
 		 848 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  37.03 
 
 		 861 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  37.07 
 
 		 838 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  37.11 
 
 		 844 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  39.24 
 
 		 848 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  35.96 
 
 		 877 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  36.88 
 
 		 838 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  35.41 
 
 		 820 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  40.95 
 
 		 776 aa  464  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  36.58 
 
 		 853 aa  466  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  36.61 
 
 		 834 aa  463  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  36.75 
 
 		 838 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  41.05 
 
 		 964 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  40.03 
 
 		 947 aa  457  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  37.24 
 
 		 894 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  38.04 
 
 		 843 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1560  putative excision nuclease ABC subunit  63.37 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.228081  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  38.69 
 
 		 939 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  38.83 
 
 		 939 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  37.01 
 
 		 898 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  36.46 
 
 		 832 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  36.89 
 
 		 898 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  38.87 
 
 		 944 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  37.46 
 
 		 860 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  39.39 
 
 		 942 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  42.02 
 
 		 945 aa  445  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0641  excinuclease ABC, A subunit  38.23 
 
 		 938 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  37.37 
 
 		 863 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0384  excinuclease ABC subunit A  36.73 
 
 		 954 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000942847  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  39.47 
 
 		 927 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0694  excinuclease ABC subunit A  39.42 
 
 		 1004 aa  438  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.641362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  36.07 
 
 		 838 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0143  excinuclease ABC, A subunit  38.73 
 
 		 1942 aa  437  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  38.08 
 
 		 880 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  36.37 
 
 		 881 aa  438  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0128  excinuclease ABC subunit A  39.57 
 
 		 937 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1834  excinuclease ABC, A subunit  38.53 
 
 		 941 aa  435  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  40.86 
 
 		 957 aa  435  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  41.69 
 
 		 971 aa  435  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1787  ABC transporter related  38.9 
 
 		 845 aa  433  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184754  normal  0.778498 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  38.37 
 
 		 942 aa  435  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  39.74 
 
 		 968 aa  434  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  38.54 
 
 		 958 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  39.97 
 
 		 942 aa  432  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>