More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1560 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1560  putative excision nuclease ABC subunit  100 
 
 		 402 aa  819    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.228081  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2348  ABC transporter-like protein  73.74 
 
 		 790 aa  591  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.86691  normal  0.591253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1659  ABC transporter related protein  73.28 
 
 		 792 aa  589  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.818321  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2621  ABC transporter related  74.93 
 
 		 826 aa  570  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.12429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3212  ABC transporter related protein  70.03 
 
 		 790 aa  566  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125335  hitchhiker  0.000000125221 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2501  ABC transporter related protein  70.29 
 
 		 805 aa  560  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4179  ABC transporter related  72.94 
 
 		 795 aa  558  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706824  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28420  Excinuclease ATPase subunit  71.69 
 
 		 799 aa  554  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3170  ABC transporter related  70.56 
 
 		 801 aa  555  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3727  ABC transporter related  70.29 
 
 		 810 aa  557  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3201  ABC transporter related protein  69.23 
 
 		 790 aa  552  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0977104  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1286  ABC transporter related protein  70.03 
 
 		 827 aa  548  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19653  hitchhiker  0.00243826 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18400  Excinuclease ATPase subunit  67.9 
 
 		 795 aa  548  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0491  ABC transporter related protein  68.17 
 
 		 794 aa  541  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544871  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2219  ABC transporter related protein  66.58 
 
 		 788 aa  536  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1600  ABC transporter related protein  70.63 
 
 		 798 aa  537  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.239381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3006  ABC transporter-related protein  66.93 
 
 		 792 aa  536  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320548  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0057  ABC transporter related  68.17 
 
 		 797 aa  532  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0413721  normal  0.79813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0097  ABC transporter related  65.78 
 
 		 792 aa  527  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73348  normal  0.128909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7895  excinuclease ABC subunit A  73.26 
 
 		 768 aa  522  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1738  ABC transporter related  70.03 
 
 		 793 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2478  ABC transporter related  69.31 
 
 		 797 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.704947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2199  ABC transporter related  64.81 
 
 		 794 aa  521  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424891  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1706  ABC transporter related protein  67.37 
 
 		 795 aa  521  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1785  ABC transporter related  70.03 
 
 		 793 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.806156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1717  ABC transporter related  69.76 
 
 		 793 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2899  ABC transporter related  66.58 
 
 		 796 aa  518  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000977115  hitchhiker  0.0000331786 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2335  ABC transporter related  67.46 
 
 		 797 aa  518  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0125219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2679  ABC transporter related  65.7 
 
 		 795 aa  519  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.249669  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2074  ABC transporter related  64.12 
 
 		 798 aa  512  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012346  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0108  ABC transporter related  61.38 
 
 		 796 aa  489  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3531  ABC transporter related  68.31 
 
 		 754 aa  486  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114059  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1760  ABC transporter related protein  60.58 
 
 		 799 aa  464  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144756  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2061  ABC transporter related protein  63.37 
 
 		 756 aa  450  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01950  Excinuclease ATPase subunit  56.43 
 
 		 798 aa  438  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1327  ABC transporter related  46.42 
 
 		 751 aa  340  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1980  ABC transporter related  45.98 
 
 		 753 aa  330  3e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5845  ABC transporter related  48.28 
 
 		 790 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1716  ABC transporter related  47.09 
 
 		 745 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1474  ABC transporter related  46.99 
 
 		 758 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.891231  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2761  ABC transporter related protein  46.44 
 
 		 752 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1801  ABC transporter related  41.15 
 
 		 745 aa  315  7e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.344909  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6204  nogalamycin resistance protein SnorO  46.44 
 
 		 750 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5797  ABC transporter related protein  45.11 
 
 		 780 aa  311  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0852128  normal  0.68212 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0264  ABC transporter related  44 
 
 		 761 aa  300  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0889  excinuclease ATPase subunit  41.95 
 
 		 760 aa  293  3e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.470006  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1999  ABC transporter related  44.29 
 
 		 761 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0727  ABC transporter related protein  50 
 
 		 752 aa  283  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0595  daunorubicin resistance protein DrrC, putative  40.8 
 
 		 752 aa  279  7e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0588759  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3040  ABC transporter related  41.26 
 
 		 754 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3513  ABC transporter related protein  35.42 
 
 		 752 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0485409  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0885  excinuclease ATPase subunit  36.96 
 
 		 750 aa  222  7e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.987216  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0455  excinuclease ABC subunit A  39.04 
 
 		 916 aa  218  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0811639  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  35.52 
 
 		 942 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2022  excinuclease ABC subunit A  37.25 
 
 		 973 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  35.71 
 
 		 947 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  38.2 
 
 		 916 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  36.22 
 
 		 968 aa  211  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  36.54 
 
 		 946 aa  210  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3091  excinuclease ABC, A subunit  34.27 
 
 		 987 aa  209  5e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1263  excinuclease ABC, A subunit  34.52 
 
 		 987 aa  209  7e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.185131  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1207  excinuclease ABC, A subunit  36.69 
 
 		 952 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143233 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  34.81 
 
 		 927 aa  207  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5616  excinuclease ABC subunit A  37.2 
 
 		 1052 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.239226 
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  35.22 
 
 		 946 aa  205  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1525  excinuclease ABC subunit A  37.71 
 
 		 925 aa  205  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000267289  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1893  excinuclease ABC, A subunit  33.96 
 
 		 945 aa  205  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0808708  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  34.22 
 
 		 942 aa  204  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  36.63 
 
 		 964 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  34.41 
 
 		 946 aa  203  4e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04893  excinuclease ABC subunit A  34.55 
 
 		 988 aa  203  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000582008  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2732  excinuclease ABC, A subunit  38.89 
 
 		 962 aa  203  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.102392  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1007  excinuclease ABC, A subunit  34.76 
 
 		 958 aa  202  7e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  33.33 
 
 		 939 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1036  excinuclease ABC, A subunit  34.52 
 
 		 967 aa  201  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000712855 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0539  excinuclease ABC subunit A  36.52 
 
 		 956 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.111546  normal  0.557 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0632  excinuclease ABC, A subunit  34.56 
 
 		 943 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.198677  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0314  excinuclease ABC, A subunit  34.35 
 
 		 988 aa  201  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634429  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  33.06 
 
 		 939 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4379  excinuclease ABC, A subunit  35.83 
 
 		 962 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121684  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3337  excinuclease ABC, A subunit  35.95 
 
 		 1008 aa  199  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.690978  normal  0.507312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6045  excinuclease ABC subunit A  36.46 
 
 		 946 aa  199  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.834052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2176  excinuclease ABC, A subunit  33.24 
 
 		 1840 aa  198  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0037  excinuclease ABC subunit A  33.61 
 
 		 920 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4192  excinuclease ABC, A subunit  33.93 
 
 		 1935 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000700694 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0128  excinuclease ABC subunit A  34.93 
 
 		 937 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0774  excinuclease ABC, A subunit  33.86 
 
 		 946 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1104  excinuclease ABC subunit A  34.4 
 
 		 939 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0522  excinuclease ABC subunit A  35.03 
 
 		 944 aa  197  3e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0045705  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4734  excinuclease ABC, A subunit  34.67 
 
 		 940 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.332226  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0735  excinuclease ABC subunit A  33.77 
 
 		 964 aa  197  3e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0936204  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1949  excinuclease ABC, A subunit  36.02 
 
 		 957 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0876147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0120  excinuclease ABC subunit A  35.11 
 
 		 948 aa  197  4.0000000000000005e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.973474  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0831  excinuclease ABC, A subunit  36.18 
 
 		 948 aa  196  6e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0795854  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  34.5 
 
 		 946 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  34.68 
 
 		 956 aa  196  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl059  repair endonuclease subunit A  34.84 
 
 		 949 aa  195  1e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  35.58 
 
 		 945 aa  195  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10878  excinuclease ABC subunit A  32.24 
 
 		 943 aa  195  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  37.37 
 
 		 963 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>