More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1207 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03930  excinuclease ABC subunit A  43.74 
 
 		 940 aa  729    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3934  excinuclease ABC, A subunit  43.74 
 
 		 940 aa  729    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  46.46 
 
 		 946 aa  800    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2758  excinuclease ABC family protein  42.48 
 
 		 1855 aa  743    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  47.88 
 
 		 937 aa  849    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0483  excinuclease ABC subunit A  44.89 
 
 		 944 aa  775    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_002950  PG1036  excinuclease ABC, A subunit  45.07 
 
 		 967 aa  735    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000712855 
 
 
-
 
NC_002950  PG2210  excinuclease ABC, A subunit  53.81 
 
 		 952 aa  995    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1010  excinuclease ABC subunit A  44.06 
 
 		 954 aa  764    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0427  excinuclease ABC subunit A  47.93 
 
 		 944 aa  828    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0916  excinuclease ABC, A subunit  44.7 
 
 		 931 aa  754    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0420  excinuclease ABC subunit A  45.38 
 
 		 954 aa  740    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790766  normal  0.236129 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  45.93 
 
 		 958 aa  816    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0920  excinuclease ABC, A subunit  44.4 
 
 		 943 aa  739    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0390  excinuclease ABC subunit A  43.88 
 
 		 940 aa  734    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1709  excinuclease ABC subunit A  44.5 
 
 		 942 aa  756    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0152505  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1104  excinuclease ABC subunit A  44.72 
 
 		 974 aa  775    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.807702  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0654  excinuclease ABC, A subunit  44.44 
 
 		 992 aa  777    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  45.93 
 
 		 958 aa  816    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  45.93 
 
 		 958 aa  816    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  45.82 
 
 		 958 aa  814    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0451  excinuclease ABC subunit A  43.92 
 
 		 951 aa  755    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0427  excinuclease ABC subunit A  43.92 
 
 		 951 aa  754    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4520  excinuclease ABC subunit A  44.65 
 
 		 961 aa  778    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308582 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0473  excinuclease ABC subunit A  44.15 
 
 		 941 aa  735    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.78914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  45.89 
 
 		 945 aa  821    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1323  excinuclease ABC subunit A  45.4 
 
 		 980 aa  791    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  45.78 
 
 		 1008 aa  809    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1568  excinuclease ABC subunit A  44.6 
 
 		 993 aa  770    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.524179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3591  excinuclease ABC subunit A  44.37 
 
 		 965 aa  776    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.240208  normal  0.0431372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5051  excinuclease ABC subunit A  44.57 
 
 		 944 aa  777    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0371407 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2966  excinuclease ABC subunit A  45.02 
 
 		 952 aa  772    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.741995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0087  excinuclease ABC, A subunit  46.24 
 
 		 937 aa  811    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141309  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0539  excinuclease ABC subunit A  49.36 
 
 		 956 aa  892    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.111546  normal  0.557 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1662  excinuclease ABC subunit A  43.76 
 
 		 958 aa  763    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2317  excinuclease ABC subunit A  44.56 
 
 		 976 aa  759    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458787  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0154  excinuclease ABC subunit A  41.72 
 
 		 951 aa  744    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.676306  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1301  excinuclease ABC subunit A  49.41 
 
 		 942 aa  897    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2691  excinuclease ABC subunit A  45.02 
 
 		 987 aa  788    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0128  excinuclease ABC subunit A  46.77 
 
 		 937 aa  837    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2486  excinuclease ABC subunit A  43.07 
 
 		 926 aa  735    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000102064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0324  excinuclease ABC, A subunit  43.4 
 
 		 935 aa  729    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  45.93 
 
 		 958 aa  816    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1804  excinuclease ABC subunit A  45.27 
 
 		 967 aa  794    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0848  excinuclease ABC subunit A  42.64 
 
 		 1003 aa  745    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.23949 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2229  excinuclease ABC, A subunit  44.83 
 
 		 944 aa  742    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.748559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1752  excinuclease ABC subunit A  46.39 
 
 		 950 aa  803    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  46.85 
 
 		 971 aa  812    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0498  excinuclease ABC, A subunit  43.99 
 
 		 981 aa  734    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0382753  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  44.78 
 
 		 966 aa  787    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1631  excinuclease ABC subunit A  44.29 
 
 		 976 aa  770    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.978501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2715  excinuclease ABC subunit A  44.38 
 
 		 1011 aa  772    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.199737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1192  excinuclease ABC subunit A  42.61 
 
 		 970 aa  759    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.548367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  45.05 
 
 		 953 aa  803    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1723  excinuclease ABC subunit A  45.33 
 
 		 957 aa  759    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.30006 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0993  excinuclease ABC subunit A  43.51 
 
 		 946 aa  745    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.883407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2757  excinuclease ABC subunit A  44.34 
 
 		 1001 aa  750    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.30708  normal  0.666672 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2426  excinuclease ABC subunit A  45.47 
 
 		 939 aa  751    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4108  excinuclease ABC subunit A  44.16 
 
 		 957 aa  734    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  46.14 
 
 		 941 aa  813    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2758  excinuclease ABC subunit A  44.44 
 
 		 1008 aa  772    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0448  excinuclease ABC subunit A  44.29 
 
 		 957 aa  742    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.775809  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2081  excinuclease ABC subunit A  43.12 
 
 		 1013 aa  759    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0851595  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0313  excinuclease ABC subunit A  44.44 
 
 		 955 aa  729    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0776  excinuclease ABC subunit A  45.43 
 
 		 981 aa  772    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.839433  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2022  excinuclease ABC subunit A  47.37 
 
 		 973 aa  870    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0694  excinuclease ABC subunit A  42.42 
 
 		 1004 aa  739    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.641362 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1098  excinuclease ABC subunit A  45.86 
 
 		 963 aa  762    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0926  excinuclease ABC subunit A  44.18 
 
 		 967 aa  778    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  43.85 
 
 		 973 aa  770    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2016  excinuclease ABC subunit A  46.53 
 
 		 923 aa  769    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1396  excinuclease ABC subunit A  45.58 
 
 		 970 aa  781    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.398652  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0158  excinuclease ABC subunit A  43.78 
 
 		 947 aa  769    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3698  excinuclease ABC subunit A  59.51 
 
 		 944 aa  1090    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  46.67 
 
 		 939 aa  840    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  46.56 
 
 		 939 aa  838    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4529  excinuclease ABC subunit A  42.79 
 
 		 1004 aa  773    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  46.93 
 
 		 942 aa  823    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1885  excinuclease ABC subunit A  45.89 
 
 		 957 aa  785    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.414426  normal  0.621255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2839  excinuclease ABC, A subunit  44.21 
 
 		 961 aa  731    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.696224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09180  excinuclease ABC subunit A  44.26 
 
 		 945 aa  750    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2009  excinuclease ABC subunit A  46.41 
 
 		 943 aa  781    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.407568  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  45.98 
 
 		 952 aa  785    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1317  excinuclease ATPase subunit  47.18 
 
 		 953 aa  807    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.133455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0393  excinuclease ABC subunit A  44.05 
 
 		 952 aa  763    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1722  excinuclease ABC subunit A  45.19 
 
 		 941 aa  782    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2079  excinuclease ABC subunit A  44.91 
 
 		 975 aa  780    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.224045  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3616  excinuclease ABC subunit A  45.05 
 
 		 950 aa  795    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557208 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  45.95 
 
 		 947 aa  818    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3515  excinuclease ABC, A subunit  46.06 
 
 		 954 aa  823    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000620303  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0517  excinuclease ABC subunit A  42.96 
 
 		 962 aa  730    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.516633  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1939  excinuclease ABC subunit A  49.25 
 
 		 950 aa  867    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0317613  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2252  excinuclease ABC subunit A  44.8 
 
 		 959 aa  766    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174561  normal  0.0315795 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  42.8 
 
 		 1019 aa  778    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  43.85 
 
 		 973 aa  770    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0369  excinuclease ABC, A subunit  43.81 
 
 		 945 aa  734    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  43.75 
 
 		 967 aa  764    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0746  excinuclease ABC, A subunit  45.41 
 
 		 940 aa  761    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0735  excinuclease ABC subunit A  44.35 
 
 		 964 aa  776    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0936204  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0366  excinuclease ABC subunit A  43.88 
 
 		 941 aa  734    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>